RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481958.1

APOBEC3G-205, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 2

Gene APOBEC3G, Length 2,337 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-205ENST00000481958 GRIN2AQ12879 1464 aa24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3G-205ENST00000481958 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3G-205ENST00000481958 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3G-205ENST00000481958 CLIP1P30622 1438 aa24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3G-205ENST00000481958 CHD1O14646 1710 aa24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3G-205ENST00000481958 CEP170Q5SW79 1584 aa24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3G-205ENST00000481958 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.85■■□□□ 1.57
APOBEC3G-205ENST00000481958 NUP160Q12769 1436 aa24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3G-205ENST00000481958 ARAP1Q96P48 1450 aa24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3G-205ENST00000481958 IQGAP2Q13576 1575 aa24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3G-205ENST00000481958 P3H3Q8IVL6 736 aa24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3G-205ENST00000481958 MYT1Q01538 1121 aa24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3G-205ENST00000481958 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3G-205ENST00000481958 SAMD9Q5K651 1589 aa24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3G-205ENST00000481958 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3G-205ENST00000481958 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3G-205ENST00000481958 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3G-205ENST00000481958 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.65■■□□□ 1.54
APOBEC3G-205ENST00000481958 DISP1Q96F81 1524 aa24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3G-205ENST00000481958 JPH4Q96JJ6 628 aa24.64■■□□□ 1.53
APOBEC3G-205ENST00000481958 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3G-205ENST00000481958 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3G-205ENST00000481958 KIAA0556O60303 1618 aa24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3G-205ENST00000481958 SHROOM2Q13796 1616 aa24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3G-205ENST00000481958 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3G-205ENST00000481958 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3G-205ENST00000481958 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3G-205ENST00000481958 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3G-205ENST00000481958 OSCARQ8IYS5 282 aa24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3G-205ENST00000481958 FMN1Q68DA7 1419 aa24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3G-205ENST00000481958 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3G-205ENST00000481958 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3G-205ENST00000481958 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3G-205ENST00000481958 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3G-205ENST00000481958 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3G-205ENST00000481958 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3G-205ENST00000481958 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3G-205ENST00000481958 ARID3CA6NKF2 412 aa24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3G-205ENST00000481958 APLP2Q06481 763 aa24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3G-205ENST00000481958 TIAM1Q13009 1591 aa24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3G-205ENST00000481958 PTPRGP23470 1445 aa24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3G-205ENST00000481958 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3G-205ENST00000481958 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3G-205ENST00000481958 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3G-205ENST00000481958 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3G-205ENST00000481958 ABCA8O94911 1581 aa24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3G-205ENST00000481958 HECW1Q76N89 1606 aa24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3G-205ENST00000481958 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3G-205ENST00000481958 MAP3K1Q13233 1512 aa24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3G-205ENST00000481958 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3G-205ENST00000481958 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3G-205ENST00000481958 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3G-205ENST00000481958 UACAQ9BZF9 1416 aa24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3G-205ENST00000481958 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3G-205ENST00000481958 ARHGEF11O15085 1522 aa24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3G-205ENST00000481958 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3G-205ENST00000481958 ATP10BO94823 1461 aa24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3G-205ENST00000481958 ABCC2Q92887 1545 aa24.08■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24■■□□□ 1.43
APOBEC3G-205ENST00000481958 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24■■□□□ 1.43
APOBEC3G-205ENST00000481958 NCOA2Q15596 1464 aa23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3G-205ENST00000481958 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3G-205ENST00000481958 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3G-205ENST00000481958 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3G-205ENST00000481958 KIF14Q15058 1648 aa23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3G-205ENST00000481958 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3G-205ENST00000481958 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3G-205ENST00000481958 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3G-205ENST00000481958 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3G-205ENST00000481958 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3G-205ENST00000481958 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3G-205ENST00000481958 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3G-205ENST00000481958 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3G-205ENST00000481958 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3G-205ENST00000481958 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3G-205ENST00000481958 KCNH8Q96L42 1107 aa23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3G-205ENST00000481958 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3G-205ENST00000481958 ASXL2Q76L83 1435 aa23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 ITGAEP38570 1179 aa23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3G-205ENST00000481958 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3G-205ENST00000481958 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3G-205ENST00000481958 MIA2Q96PC5 1412 aa23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3G-205ENST00000481958 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3G-205ENST00000481958 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
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