RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481958.1

APOBEC3G-205, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 2

Gene APOBEC3G, Length 2,337 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-205ENST00000481958 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.17■■■■□ 3.38
APOBEC3G-205ENST00000481958 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.62■■■□□ 2.65
APOBEC3G-205ENST00000481958 ABCC9O60706 1549 aa30.34■■■□□ 2.45
APOBEC3G-205ENST00000481958 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
APOBEC3G-205ENST00000481958 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3G-205ENST00000481958 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.82■■■□□ 2.36
APOBEC3G-205ENST00000481958 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3G-205ENST00000481958 NACADO15069 1562 aa29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3G-205ENST00000481958 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.4■■■□□ 2.3
APOBEC3G-205ENST00000481958 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3G-205ENST00000481958 SCRIBQ14160 1630 aa29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3G-205ENST00000481958 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3G-205ENST00000481958 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.62■■■□□ 2.17
APOBEC3G-205ENST00000481958 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
APOBEC3G-205ENST00000481958 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.24■■■□□ 2.11
APOBEC3G-205ENST00000481958 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3G-205ENST00000481958 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.01■■■□□ 2.07
APOBEC3G-205ENST00000481958 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
APOBEC3G-205ENST00000481958 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
APOBEC3G-205ENST00000481958 SMARCA4P51532 1647 aa27.89■■■□□ 2.05
APOBEC3G-205ENST00000481958 WIZO95785 1651 aa27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3G-205ENST00000481958 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3G-205ENST00000481958 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.52■■■□□ 2
APOBEC3G-205ENST00000481958 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3G-205ENST00000481958 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.43■■□□□ 1.98
APOBEC3G-205ENST00000481958 SMARCA2P51531 1590 aa27.4■■□□□ 1.98
APOBEC3G-205ENST00000481958 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
APOBEC3G-205ENST00000481958 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3G-205ENST00000481958 NCAPD3P42695 1498 aa27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3G-205ENST00000481958 HMGXB3Q12766 1538 aa27.2■■□□□ 1.94
APOBEC3G-205ENST00000481958 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.19■■□□□ 1.94
APOBEC3G-205ENST00000481958 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.14■■□□□ 1.94
APOBEC3G-205ENST00000481958 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3G-205ENST00000481958 CFTRP13569 1480 aa26.62■■□□□ 1.85
APOBEC3G-205ENST00000481958 NESP48681 1621 aa26.59■■□□□ 1.85
APOBEC3G-205ENST00000481958 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.58■■□□□ 1.85
APOBEC3G-205ENST00000481958 ABCC8Q09428 1581 aa26.53■■□□□ 1.84
APOBEC3G-205ENST00000481958 PRDM2Q13029 1718 aa26.44■■□□□ 1.82
APOBEC3G-205ENST00000481958 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.39■■□□□ 1.82
APOBEC3G-205ENST00000481958 TRIM41Q8WV44 630 aa26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3G-205ENST00000481958 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.3■■□□□ 1.8
APOBEC3G-205ENST00000481958 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3G-205ENST00000481958 SYNJ1O43426 1573 aa26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3G-205ENST00000481958 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3G-205ENST00000481958 CUX1P39880 1505 aa26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3G-205ENST00000481958 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3G-205ENST00000481958 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3G-205ENST00000481958 TOP2BQ02880 1626 aa26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3G-205ENST00000481958 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3G-205ENST00000481958 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3G-205ENST00000481958 TOPBP1Q92547 1522 aa25.99■■□□□ 1.75
APOBEC3G-205ENST00000481958 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.97■■□□□ 1.75
APOBEC3G-205ENST00000481958 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
APOBEC3G-205ENST00000481958 SOGA1O94964 1423 aa25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3G-205ENST00000481958 ERCC6Q03468 1493 aa25.95■■□□□ 1.74
APOBEC3G-205ENST00000481958 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.93■■□□□ 1.74
APOBEC3G-205ENST00000481958 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.92■■□□□ 1.74
APOBEC3G-205ENST00000481958 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.89■■□□□ 1.74
APOBEC3G-205ENST00000481958 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
APOBEC3G-205ENST00000481958 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
APOBEC3G-205ENST00000481958 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.82■■□□□ 1.72
APOBEC3G-205ENST00000481958 WDR62O43379 1518 aa25.79■■□□□ 1.72
APOBEC3G-205ENST00000481958 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3G-205ENST00000481958 CUX2O14529 1486 aa25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3G-205ENST00000481958 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3G-205ENST00000481958 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3G-205ENST00000481958 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3G-205ENST00000481958 WDR97A6NE52 1622 aa25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3G-205ENST00000481958 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3G-205ENST00000481958 EEA1Q15075 1411 aa25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3G-205ENST00000481958 KIF27Q86VH2 1401 aa25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3G-205ENST00000481958 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3G-205ENST00000481958 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3G-205ENST00000481958 IFT140Q96RY7 1462 aa25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3G-205ENST00000481958 IGF1RP08069 1367 aa25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3G-205ENST00000481958 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3G-205ENST00000481958 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3G-205ENST00000481958 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3G-205ENST00000481958 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3G-205ENST00000481958 PRXQ9BXM0 1461 aa25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3G-205ENST00000481958 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3G-205ENST00000481958 KIF21BO75037 1637 aa25.39■■□□□ 1.65
APOBEC3G-205ENST00000481958 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3G-205ENST00000481958 PBRM1Q86U86 1689 aa25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3G-205ENST00000481958 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3G-205ENST00000481958 GOLGA3Q08378 1498 aa25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3G-205ENST00000481958 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3G-205ENST00000481958 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3G-205ENST00000481958 GRIN2BQ13224 1484 aa25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3G-205ENST00000481958 CUL7Q14999 1698 aa25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3G-205ENST00000481958 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3G-205ENST00000481958 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3G-205ENST00000481958 ADAMTS12P58397 1594 aa25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3G-205ENST00000481958 HRCP23327 699 aa25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3G-205ENST00000481958 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3G-205ENST00000481958 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3G-205ENST00000481958 CEP162Q5TB80 1403 aa25.08■■□□□ 1.61
APOBEC3G-205ENST00000481958 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
APOBEC3G-205ENST00000481958 SYNJ2O15056 1496 aa25■■□□□ 1.59
APOBEC3G-205ENST00000481958 FBLN2P98095 1184 aa25■■□□□ 1.59
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