RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477726.1

SIGMAR1-205, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-205ENST00000477726 SHROOM2Q13796 1616 aa45.6■■■■■ 4.89
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SIGMAR1-205ENST00000477726 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.56■■■■■ 4.88
SIGMAR1-205ENST00000477726 ARAP1Q96P48 1450 aa45.55■■■■■ 4.88
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SIGMAR1-205ENST00000477726 FMN1Q68DA7 1419 aa44.15■■■■■ 4.66
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SIGMAR1-205ENST00000477726 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.02■■■■■ 4.64
SIGMAR1-205ENST00000477726 ARID3CA6NKF2 412 aa44.01■■■■■ 4.64
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SIGMAR1-205ENST00000477726 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.47
SIGMAR1-205ENST00000477726 PREX2Q70Z35 1606 aa42.93■■■■■ 4.46
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