RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 CEP170Q5SW79 1584 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS1-209ENST00000470095 NUP160Q12769 1436 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS1-209ENST00000470095 CEP162Q5TB80 1403 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS1-209ENST00000470095 FBLN2P98095 1184 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS1-209ENST00000470095 IQGAP2Q13576 1575 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS1-209ENST00000470095 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS1-209ENST00000470095 CLIP1P30622 1438 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS1-209ENST00000470095 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.8■■□□□ 1.24
HPS1-209ENST00000470095 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.8■■□□□ 1.24
HPS1-209ENST00000470095 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.78■■□□□ 1.24
HPS1-209ENST00000470095 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HPS1-209ENST00000470095 SAMD9Q5K651 1589 aa22.78■■□□□ 1.24
HPS1-209ENST00000470095 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.77■■□□□ 1.24
HPS1-209ENST00000470095 ARAP1Q96P48 1450 aa22.75■■□□□ 1.23
HPS1-209ENST00000470095 SHROOM2Q13796 1616 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-209ENST00000470095 DISP1Q96F81 1524 aa22.69■■□□□ 1.22
HPS1-209ENST00000470095 KIAA0556O60303 1618 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS1-209ENST00000470095 JPH4Q96JJ6 628 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS1-209ENST00000470095 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS1-209ENST00000470095 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS1-209ENST00000470095 OSCARQ8IYS5 282 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS1-209ENST00000470095 P3H3Q8IVL6 736 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS1-209ENST00000470095 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HPS1-209ENST00000470095 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-209ENST00000470095 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.56■■□□□ 1.2
HPS1-209ENST00000470095 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HPS1-209ENST00000470095 FMN1Q68DA7 1419 aa22.51■■□□□ 1.19
HPS1-209ENST00000470095 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.46■■□□□ 1.19
HPS1-209ENST00000470095 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.45■■□□□ 1.18
HPS1-209ENST00000470095 PTPRGP23470 1445 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS1-209ENST00000470095 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.39■■□□□ 1.18
HPS1-209ENST00000470095 ABCA8O94911 1581 aa22.39■■□□□ 1.18
HPS1-209ENST00000470095 HECW1Q76N89 1606 aa22.39■■□□□ 1.17
HPS1-209ENST00000470095 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS1-209ENST00000470095 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS1-209ENST00000470095 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HPS1-209ENST00000470095 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.35■■□□□ 1.17
HPS1-209ENST00000470095 ARHGEF11O15085 1522 aa22.34■■□□□ 1.17
HPS1-209ENST00000470095 MAP3K1Q13233 1512 aa22.33■■□□□ 1.17
HPS1-209ENST00000470095 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
HPS1-209ENST00000470095 TIAM1Q13009 1591 aa22.33■■□□□ 1.16
HPS1-209ENST00000470095 UACAQ9BZF9 1416 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS1-209ENST00000470095 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS1-209ENST00000470095 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS1-209ENST00000470095 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS1-209ENST00000470095 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HPS1-209ENST00000470095 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS1-209ENST00000470095 ABCC2Q92887 1545 aa22.26■■□□□ 1.15
HPS1-209ENST00000470095 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HPS1-209ENST00000470095 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HPS1-209ENST00000470095 APLP2Q06481 763 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS1-209ENST00000470095 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS1-209ENST00000470095 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.2■■□□□ 1.15
HPS1-209ENST00000470095 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HPS1-209ENST00000470095 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS1-209ENST00000470095 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HPS1-209ENST00000470095 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS1-209ENST00000470095 ATP10BO94823 1461 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS1-209ENST00000470095 ARID3CA6NKF2 412 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS1-209ENST00000470095 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.14■■□□□ 1.13
HPS1-209ENST00000470095 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.14■■□□□ 1.13
HPS1-209ENST00000470095 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HPS1-209ENST00000470095 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS1-209ENST00000470095 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HPS1-209ENST00000470095 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HPS1-209ENST00000470095 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HPS1-209ENST00000470095 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HPS1-209ENST00000470095 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS1-209ENST00000470095 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HPS1-209ENST00000470095 NCOA2Q15596 1464 aa22■■□□□ 1.11
HPS1-209ENST00000470095 KIF14Q15058 1648 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS1-209ENST00000470095 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.97■■□□□ 1.11
HPS1-209ENST00000470095 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.97■■□□□ 1.11
HPS1-209ENST00000470095 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.93■■□□□ 1.1
HPS1-209ENST00000470095 ASXL2Q76L83 1435 aa21.92■■□□□ 1.1
HPS1-209ENST00000470095 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.91■■□□□ 1.1
HPS1-209ENST00000470095 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
HPS1-209ENST00000470095 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 MAPKBP1O60336 1514 aa21.89■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.89■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HPS1-209ENST00000470095 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 PREX2Q70Z35 1606 aa21.8■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.8■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 KCNH8Q96L42 1107 aa21.79■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 MIA2Q96PC5 1412 aa21.79■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.78■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS1-209ENST00000470095 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.74■■□□□ 1.07
HPS1-209ENST00000470095 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
HPS1-209ENST00000470095 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.71■■□□□ 1.07
HPS1-209ENST00000470095 GLI2P10070 1586 aa21.71■■□□□ 1.07
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