RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469990.1

LMNTD2-203, Transcript of lamin tail domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMNTD2, Length 1,232 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2-203ENST00000469990 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.85■■■■■ 4.77
LMNTD2-203ENST00000469990 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.83■■■■■ 4.77
LMNTD2-203ENST00000469990 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.83■■■■■ 4.77
LMNTD2-203ENST00000469990 SHROOM2Q13796 1616 aa44.78■■■■■ 4.76
LMNTD2-203ENST00000469990 ARAP1Q96P48 1450 aa44.75■■■■■ 4.75
LMNTD2-203ENST00000469990 PRXQ9BXM0 1461 aa44.72■■■■■ 4.75
LMNTD2-203ENST00000469990 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
LMNTD2-203ENST00000469990 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
LMNTD2-203ENST00000469990 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.55■■■■■ 4.72
LMNTD2-203ENST00000469990 IQGAP2Q13576 1575 aa44.54■■■■■ 4.72
LMNTD2-203ENST00000469990 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.44■■■■■ 4.7
LMNTD2-203ENST00000469990 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.34■■■■■ 4.69
LMNTD2-203ENST00000469990 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.32■■■■■ 4.69
LMNTD2-203ENST00000469990 KIF21BO75037 1637 aa44.27■■■■■ 4.68
LMNTD2-203ENST00000469990 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.24■■■■■ 4.67
LMNTD2-203ENST00000469990 PTPRGP23470 1445 aa44.22■■■■■ 4.67
LMNTD2-203ENST00000469990 GOLGA3Q08378 1498 aa44.19■■■■■ 4.66
LMNTD2-203ENST00000469990 DISP1Q96F81 1524 aa44.19■■■■■ 4.66
LMNTD2-203ENST00000469990 KIAA0556O60303 1618 aa44.07■■■■■ 4.65
LMNTD2-203ENST00000469990 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
LMNTD2-203ENST00000469990 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
LMNTD2-203ENST00000469990 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.05■■■■■ 4.64
LMNTD2-203ENST00000469990 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.95■■■■■ 4.63
LMNTD2-203ENST00000469990 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
LMNTD2-203ENST00000469990 UACAQ9BZF9 1416 aa43.9■■■■■ 4.62
LMNTD2-203ENST00000469990 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.88■■■■■ 4.61
LMNTD2-203ENST00000469990 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.84■■■■■ 4.61
LMNTD2-203ENST00000469990 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
LMNTD2-203ENST00000469990 P3H3Q8IVL6 736 aa43.83■■■■■ 4.61
LMNTD2-203ENST00000469990 SAMD9Q5K651 1589 aa43.8■■■■■ 4.6
LMNTD2-203ENST00000469990 ABCC2Q92887 1545 aa43.75■■■■■ 4.59
LMNTD2-203ENST00000469990 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.73■■■■■ 4.59
LMNTD2-203ENST00000469990 MAPKBP1O60336 1514 aa43.68■■■■■ 4.58
LMNTD2-203ENST00000469990 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.65■■■■■ 4.58
LMNTD2-203ENST00000469990 ABCA8O94911 1581 aa43.6■■■■■ 4.57
LMNTD2-203ENST00000469990 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.6■■■■■ 4.57
LMNTD2-203ENST00000469990 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.57■■■■■ 4.57
LMNTD2-203ENST00000469990 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.48■■■■■ 4.55
LMNTD2-203ENST00000469990 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.46■■■■■ 4.55
LMNTD2-203ENST00000469990 ASXL2Q76L83 1435 aa43.46■■■■■ 4.55
LMNTD2-203ENST00000469990 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.45■■■■■ 4.55
LMNTD2-203ENST00000469990 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
LMNTD2-203ENST00000469990 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.4■■■■■ 4.54
LMNTD2-203ENST00000469990 FMN1Q68DA7 1419 aa43.39■■■■■ 4.54
LMNTD2-203ENST00000469990 DIP2BQ9P265 1576 aa43.33■■■■■ 4.53
LMNTD2-203ENST00000469990 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.3■■■■■ 4.52
LMNTD2-203ENST00000469990 CLIP1P30622 1438 aa43.3■■■■■ 4.52
LMNTD2-203ENST00000469990 ATP10BO94823 1461 aa43.29■■■■■ 4.52
LMNTD2-203ENST00000469990 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
LMNTD2-203ENST00000469990 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
LMNTD2-203ENST00000469990 ARID3CA6NKF2 412 aa43.26■■■■■ 4.52
LMNTD2-203ENST00000469990 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.25■■■■■ 4.51
LMNTD2-203ENST00000469990 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
LMNTD2-203ENST00000469990 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.2■■■■■ 4.51
LMNTD2-203ENST00000469990 GLI2P10070 1586 aa43.19■■■■■ 4.5
LMNTD2-203ENST00000469990 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
LMNTD2-203ENST00000469990 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
LMNTD2-203ENST00000469990 KCNH8Q96L42 1107 aa43.13■■■■■ 4.49
LMNTD2-203ENST00000469990 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.1■■■■■ 4.49
LMNTD2-203ENST00000469990 CEP162Q5TB80 1403 aa43.08■■■■■ 4.49
LMNTD2-203ENST00000469990 HECW1Q76N89 1606 aa43.07■■■■■ 4.48
LMNTD2-203ENST00000469990 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43■■■■■ 4.47
LMNTD2-203ENST00000469990 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
LMNTD2-203ENST00000469990 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.92■■■■■ 4.46
LMNTD2-203ENST00000469990 TSPOAP1O95153 1857 aa42.91■■■■■ 4.46
LMNTD2-203ENST00000469990 CD109Q6YHK3 1445 aa42.9■■■■■ 4.46
LMNTD2-203ENST00000469990 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
LMNTD2-203ENST00000469990 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.88■■■■■ 4.46
LMNTD2-203ENST00000469990 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.87■■■■■ 4.45
LMNTD2-203ENST00000469990 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.86■■■■■ 4.45
LMNTD2-203ENST00000469990 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.85■■■■■ 4.45
LMNTD2-203ENST00000469990 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
LMNTD2-203ENST00000469990 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.78■■■■■ 4.44
LMNTD2-203ENST00000469990 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.77■■■■■ 4.44
LMNTD2-203ENST00000469990 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
LMNTD2-203ENST00000469990 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
LMNTD2-203ENST00000469990 KDM6BO15054 1643 aa42.65■■■■■ 4.42
LMNTD2-203ENST00000469990 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.65■■■■■ 4.42
LMNTD2-203ENST00000469990 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.62■■■■■ 4.41
LMNTD2-203ENST00000469990 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.6■■■■■ 4.41
LMNTD2-203ENST00000469990 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.59■■■■■ 4.41
LMNTD2-203ENST00000469990 KIF14Q15058 1648 aa42.53■■■■■ 4.4
LMNTD2-203ENST00000469990 NEO1Q92859 1461 aa42.51■■■■■ 4.4
LMNTD2-203ENST00000469990 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.48■■■■■ 4.39
LMNTD2-203ENST00000469990 PLCH2O75038 1416 aa42.45■■■■■ 4.39
LMNTD2-203ENST00000469990 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.44■■■■■ 4.38
LMNTD2-203ENST00000469990 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
LMNTD2-203ENST00000469990 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.42■■■■■ 4.38
LMNTD2-203ENST00000469990 FANCAO15360 1455 aa42.4■■■■■ 4.38
LMNTD2-203ENST00000469990 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.38■■■■■ 4.37
LMNTD2-203ENST00000469990 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.37■■■■■ 4.37
LMNTD2-203ENST00000469990 AKNAQ7Z591 1439 aa42.33■■■■■ 4.37
LMNTD2-203ENST00000469990 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.32■■■■■ 4.37
LMNTD2-203ENST00000469990 APLP2Q06481 763 aa42.3■■■■■ 4.36
LMNTD2-203ENST00000469990 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.27■■■■■ 4.36
LMNTD2-203ENST00000469990 MAP3K1Q13233 1512 aa42.25■■■■■ 4.35
LMNTD2-203ENST00000469990 TIAM1Q13009 1591 aa42.25■■■■■ 4.35
LMNTD2-203ENST00000469990 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.23■■■■■ 4.35
LMNTD2-203ENST00000469990 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
LMNTD2-203ENST00000469990 RAPGEF3O95398 923 aa42.19■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms