RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469403.1

AGRN-205, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 3

Gene AGRN, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-205ENST00000469403 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.35■■■■■ 4.53
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AGRN-205ENST00000469403 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
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AGRN-205ENST00000469403 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.87■■■■■ 4.45
AGRN-205ENST00000469403 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.87■■■■■ 4.45
AGRN-205ENST00000469403 SAMD9Q5K651 1589 aa42.86■■■■■ 4.45
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AGRN-205ENST00000469403 CLIP1P30622 1438 aa42.66■■■■■ 4.42
AGRN-205ENST00000469403 CEP162Q5TB80 1403 aa42.65■■■■■ 4.42
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AGRN-205ENST00000469403 HECW1Q76N89 1606 aa42.09■■■■■ 4.33
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AGRN-205ENST00000469403 ASXL2Q76L83 1435 aa41.77■■■■■ 4.28
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AGRN-205ENST00000469403 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.39■■■■■ 4.22
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AGRN-205ENST00000469403 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.212e-6■■■■□ 26.6
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AGRN-205ENST00000469403 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.06■■■■■ 4.16
AGRN-205ENST00000469403 TSPOAP1O95153 1857 aa41.05■■■■■ 4.16
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AGRN-205ENST00000469403 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.98■■■■■ 4.15
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