RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 CUL7Q14999 1698 aa38.91■■■■□ 3.82
OPN3-204ENST00000469376 APLP2Q06481 763 aa38.9■■■■□ 3.82
OPN3-204ENST00000469376 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
OPN3-204ENST00000469376 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
OPN3-204ENST00000469376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.75■■■■□ 3.79
OPN3-204ENST00000469376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.74■■■■□ 3.79
OPN3-204ENST00000469376 ADAMTS12P58397 1594 aa38.72■■■■□ 3.79
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
OPN3-204ENST00000469376 ARAP1Q96P48 1450 aa38.68■■■■□ 3.78
OPN3-204ENST00000469376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
OPN3-204ENST00000469376 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
OPN3-204ENST00000469376 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
OPN3-204ENST00000469376 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
OPN3-204ENST00000469376 SYNJ2O15056 1496 aa38.54■■■■□ 3.76
OPN3-204ENST00000469376 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
OPN3-204ENST00000469376 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
OPN3-204ENST00000469376 GRIN2AQ12879 1464 aa38.47■■■■□ 3.75
OPN3-204ENST00000469376 FBLN2P98095 1184 aa38.45■■■■□ 3.75
OPN3-204ENST00000469376 NEUROD1Q13562 356 aa38.4■■■■□ 3.74
OPN3-204ENST00000469376 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
OPN3-204ENST00000469376 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.39■■■■□ 3.74
OPN3-204ENST00000469376 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.37■■■■□ 3.73
OPN3-204ENST00000469376 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.34■■■■□ 3.73
OPN3-204ENST00000469376 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
OPN3-204ENST00000469376 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
OPN3-204ENST00000469376 CHD1O14646 1710 aa38.23■■■■□ 3.71
OPN3-204ENST00000469376 CEP170Q5SW79 1584 aa38.22■■■■□ 3.71
OPN3-204ENST00000469376 NUP160Q12769 1436 aa38.22■■■■□ 3.71
OPN3-204ENST00000469376 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.2■■■■□ 3.71
OPN3-204ENST00000469376 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
OPN3-204ENST00000469376 IQGAP2Q13576 1575 aa38.17■■■■□ 3.7
OPN3-204ENST00000469376 MAP3K1Q13233 1512 aa38.15■■■■□ 3.7
OPN3-204ENST00000469376 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.08■■■■□ 3.69
OPN3-204ENST00000469376 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.04■■■■□ 3.68
OPN3-204ENST00000469376 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa38.02■■■■□ 3.68
OPN3-204ENST00000469376 TIAM1Q13009 1591 aa38.01■■■■□ 3.68
OPN3-204ENST00000469376 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38■■■■□ 3.67
OPN3-204ENST00000469376 P3H3Q8IVL6 736 aa37.99■■■■□ 3.67
OPN3-204ENST00000469376 SAMD9Q5K651 1589 aa37.97■■■■□ 3.67
OPN3-204ENST00000469376 MIER1Q8N108 512 aa37.95■■■■□ 3.67
OPN3-204ENST00000469376 JPH4Q96JJ6 628 aa37.93■■■■□ 3.66
OPN3-204ENST00000469376 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.9■■■■□ 3.66
OPN3-204ENST00000469376 DISP1Q96F81 1524 aa37.84■■■■□ 3.65
OPN3-204ENST00000469376 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.82■■■■□ 3.65
OPN3-204ENST00000469376 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.82■■■■□ 3.64
OPN3-204ENST00000469376 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.81■■■■□ 3.64
OPN3-204ENST00000469376 KIAA0556O60303 1618 aa37.79■■■■□ 3.64
OPN3-204ENST00000469376 OSCARQ8IYS5 282 aa37.77■■■■□ 3.64
OPN3-204ENST00000469376 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.75■■■■□ 3.63
OPN3-204ENST00000469376 SHROOM2Q13796 1616 aa37.73■■■■□ 3.63
OPN3-204ENST00000469376 FMN1Q68DA7 1419 aa37.72■■■■□ 3.63
OPN3-204ENST00000469376 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
OPN3-204ENST00000469376 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
OPN3-204ENST00000469376 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
OPN3-204ENST00000469376 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.66■■■■□ 3.62
OPN3-204ENST00000469376 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.63■■■■□ 3.61
OPN3-204ENST00000469376 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.61■■■■□ 3.61
OPN3-204ENST00000469376 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.61■■■■□ 3.61
OPN3-204ENST00000469376 ITGAEP38570 1179 aa37.59■■■■□ 3.61
OPN3-204ENST00000469376 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.57■■■■□ 3.61
OPN3-204ENST00000469376 MAPKBP1O60336 1514 aa37.57■■■■□ 3.6
OPN3-204ENST00000469376 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
OPN3-204ENST00000469376 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.51■■■■□ 3.6
OPN3-204ENST00000469376 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.47■■■■□ 3.59
OPN3-204ENST00000469376 PTPRGP23470 1445 aa37.44■■■■□ 3.58
OPN3-204ENST00000469376 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
OPN3-204ENST00000469376 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.36■■■■□ 3.57
OPN3-204ENST00000469376 HECW1Q76N89 1606 aa37.36■■■■□ 3.57
OPN3-204ENST00000469376 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.36■■■■□ 3.57
OPN3-204ENST00000469376 ABCA8O94911 1581 aa37.29■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.27■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.27■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.27■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.25■■■■□ 3.55
OPN3-204ENST00000469376 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
OPN3-204ENST00000469376 ARID3CA6NKF2 412 aa37.21■■■■□ 3.55
OPN3-204ENST00000469376 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.2■■■■□ 3.55
OPN3-204ENST00000469376 UACAQ9BZF9 1416 aa37.2■■■■□ 3.55
OPN3-204ENST00000469376 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
OPN3-204ENST00000469376 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.11■■■■□ 3.53
OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF11O15085 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
OPN3-204ENST00000469376 ABCC2Q92887 1545 aa37.09■■■■□ 3.53
OPN3-204ENST00000469376 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.05■■■■□ 3.52
OPN3-204ENST00000469376 ATP10BO94823 1461 aa37.05■■■■□ 3.52
OPN3-204ENST00000469376 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.04■■■■□ 3.52
OPN3-204ENST00000469376 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.03■■■■□ 3.52
OPN3-204ENST00000469376 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
OPN3-204ENST00000469376 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
OPN3-204ENST00000469376 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.01■■■■□ 3.52
OPN3-204ENST00000469376 HFM1A2PYH4 1435 aa37■■■■□ 3.51
OPN3-204ENST00000469376 NCOA2Q15596 1464 aa36.99■■■■□ 3.51
OPN3-204ENST00000469376 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.98■■■■□ 3.51
OPN3-204ENST00000469376 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.96■■■■□ 3.51
OPN3-204ENST00000469376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.95■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.95■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.95■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.92■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms