RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SHQ1-205ENST00000468371 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.22□□□□□ -0.93
SHQ1-205ENST00000468371 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.22□□□□□ -0.93
SHQ1-205ENST00000468371 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
SHQ1-205ENST00000468371 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.21□□□□□ -0.94
SHQ1-205ENST00000468371 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SHQ1-205ENST00000468371 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SHQ1-205ENST00000468371 IGF1RP08069 1367 aa9.19□□□□□ -0.94
SHQ1-205ENST00000468371 GRIN2AQ12879 1464 aa9.17□□□□□ -0.94
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGEF11O15085 1522 aa9.16□□□□□ -0.94
SHQ1-205ENST00000468371 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.14□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 TOP2BQ02880 1626 aa9.13□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.13□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 EEA1Q15075 1411 aa9.13□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 PRDM2Q13029 1718 aa9.12□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.11□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.1□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 GOLGA3Q08378 1498 aa9.1□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.09□□□□□ -0.95
SHQ1-205ENST00000468371 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 WDR97A6NE52 1622 aa9.06□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 MLECQ14165 292 aa9.05□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 ARAP1Q96P48 1450 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 CHD1O14646 1710 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-205ENST00000468371 NUP160Q12769 1436 aa9.02□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 UACAQ9BZF9 1416 aa9.02□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.01□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.99□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 ADAMTS12P58397 1594 aa8.99□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.98□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 CEP170Q5SW79 1584 aa8.97□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 PBRM1Q86U86 1689 aa8.97□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 CUL7Q14999 1698 aa8.97□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.96□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 TSPY4P0CV99 314 aa8.96□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 TSPY10P0CW01 314 aa8.96□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
SHQ1-205ENST00000468371 CLIP1P30622 1438 aa8.96□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 IQGAP2Q13576 1575 aa8.96□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.96□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.95□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 ITGAEP38570 1179 aa8.94□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 FMN1Q68DA7 1419 aa8.94□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 CD109Q6YHK3 1445 aa8.93□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 ASXL2Q76L83 1435 aa8.93□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 BCANQ96GW7 911 aa8.92□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.92□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 RAPGEF3O95398 923 aa8.9□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.9□□□□□ -0.98
SHQ1-205ENST00000468371 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.89□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.88□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 ABCC2Q92887 1545 aa8.87□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 GGT6Q6P531 493 aa8.87□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 PRXQ9BXM0 1461 aa8.87□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.85□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.84□□□□□ -0.99
SHQ1-205ENST00000468371 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.83□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.82□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 AFAP1Q8N556 730 aa8.8□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.8□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.8□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.8□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.79□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM52Q96A61 297 aa8.78□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 CEP162Q5TB80 1403 aa8.78□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.78□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 KIF3BO15066 747 aa8.77□□□□□ -1
SHQ1-205ENST00000468371 DISP1Q96F81 1524 aa8.77□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.77□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 ATP10BO94823 1461 aa8.76□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA0556O60303 1618 aa8.76□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 TSPOAP1O95153 1857 aa8.75□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.75□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.75□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.75□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 KDM6BO15054 1643 aa8.75□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 AKNAQ7Z591 1439 aa8.74□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.74□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.74□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SHQ1-205ENST00000468371 C14orf37Q86TY3 774 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms