RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466076.1

BCR-208, Transcript of BCR, RhoGEF and GTPase activating protein, humanhuman

TSL 3

Gene BCR, Length 495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCR-208ENST00000466076 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.89■■□□□ 1.74
BCR-208ENST00000466076 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.89■■□□□ 1.73
BCR-208ENST00000466076 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.85■■□□□ 1.73
BCR-208ENST00000466076 IQGAP2Q13576 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
BCR-208ENST00000466076 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.81■■□□□ 1.72
BCR-208ENST00000466076 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.76■■□□□ 1.71
BCR-208ENST00000466076 JPH4Q96JJ6 628 aa25.76■■□□□ 1.71
BCR-208ENST00000466076 SHROOM2Q13796 1616 aa25.75■■□□□ 1.71
BCR-208ENST00000466076 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.73■■□□□ 1.71
BCR-208ENST00000466076 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.66■■□□□ 1.7
BCR-208ENST00000466076 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
BCR-208ENST00000466076 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.63■■□□□ 1.69
BCR-208ENST00000466076 SAMD9Q5K651 1589 aa25.6■■□□□ 1.69
BCR-208ENST00000466076 DISP1Q96F81 1524 aa25.59■■□□□ 1.69
BCR-208ENST00000466076 KIAA0556O60303 1618 aa25.58■■□□□ 1.69
BCR-208ENST00000466076 CEP162Q5TB80 1403 aa25.57■■□□□ 1.68
BCR-208ENST00000466076 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
BCR-208ENST00000466076 CLIP1P30622 1438 aa25.56■■□□□ 1.68
BCR-208ENST00000466076 ARHGEF11O15085 1522 aa25.55■■□□□ 1.68
BCR-208ENST00000466076 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.53■■□□□ 1.68
BCR-208ENST00000466076 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.52■■□□□ 1.68
BCR-208ENST00000466076 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.51■■□□□ 1.67
BCR-208ENST00000466076 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.48■■□□□ 1.67
BCR-208ENST00000466076 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.48■■□□□ 1.67
BCR-208ENST00000466076 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.48■■□□□ 1.67
BCR-208ENST00000466076 P3H3Q8IVL6 736 aa25.44■■□□□ 1.66
BCR-208ENST00000466076 PTPRGP23470 1445 aa25.44■■□□□ 1.66
BCR-208ENST00000466076 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.44■■□□□ 1.66
BCR-208ENST00000466076 FMN1Q68DA7 1419 aa25.39■■□□□ 1.66
BCR-208ENST00000466076 ARAP1Q96P48 1450 aa25.39■■□□□ 1.65
BCR-208ENST00000466076 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
BCR-208ENST00000466076 UACAQ9BZF9 1416 aa25.29■■□□□ 1.64
BCR-208ENST00000466076 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.27■■□□□ 1.64
BCR-208ENST00000466076 ABCA8O94911 1581 aa25.27■■□□□ 1.64
BCR-208ENST00000466076 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.26■■□□□ 1.63
BCR-208ENST00000466076 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.25■■□□□ 1.63
BCR-208ENST00000466076 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.24■■□□□ 1.63
BCR-208ENST00000466076 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.24■■□□□ 1.63
BCR-208ENST00000466076 ABCC2Q92887 1545 aa25.23■■□□□ 1.63
BCR-208ENST00000466076 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.22■■□□□ 1.63
BCR-208ENST00000466076 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.2■■□□□ 1.62
BCR-208ENST00000466076 HECW1Q76N89 1606 aa25.19■■□□□ 1.62
BCR-208ENST00000466076 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.17■■□□□ 1.62
BCR-208ENST00000466076 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
BCR-208ENST00000466076 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
BCR-208ENST00000466076 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
BCR-208ENST00000466076 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
BCR-208ENST00000466076 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.11■■□□□ 1.61
BCR-208ENST00000466076 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.09■■□□□ 1.61
BCR-208ENST00000466076 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
BCR-208ENST00000466076 ATP10BO94823 1461 aa25.05■■□□□ 1.6
BCR-208ENST00000466076 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
BCR-208ENST00000466076 APLP2Q06481 763 aa25.01■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 MAP3K1Q13233 1512 aa25■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.98■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 ARID3CA6NKF2 412 aa24.98■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 MAPKBP1O60336 1514 aa24.96■■□□□ 1.59
BCR-208ENST00000466076 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.94■■□□□ 1.58
BCR-208ENST00000466076 TIAM1Q13009 1591 aa24.94■■□□□ 1.58
BCR-208ENST00000466076 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.93■■□□□ 1.58
BCR-208ENST00000466076 ASXL2Q76L83 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
BCR-208ENST00000466076 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.89■■□□□ 1.58
BCR-208ENST00000466076 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
BCR-208ENST00000466076 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.85■■□□□ 1.57
BCR-208ENST00000466076 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.84■■□□□ 1.57
BCR-208ENST00000466076 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.83■■□□□ 1.57
BCR-208ENST00000466076 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.8■■□□□ 1.56
BCR-208ENST00000466076 KIF14Q15058 1648 aa24.77■■□□□ 1.56
BCR-208ENST00000466076 KCNH8Q96L42 1107 aa24.76■■□□□ 1.55
BCR-208ENST00000466076 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.76■■□□□ 1.55
BCR-208ENST00000466076 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
BCR-208ENST00000466076 GLI2P10070 1586 aa24.73■■□□□ 1.55
BCR-208ENST00000466076 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
BCR-208ENST00000466076 DIP2BQ9P265 1576 aa24.72■■□□□ 1.55
BCR-208ENST00000466076 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.68■■□□□ 1.54
BCR-208ENST00000466076 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
BCR-208ENST00000466076 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.67■■□□□ 1.54
BCR-208ENST00000466076 NCOA2Q15596 1464 aa24.66■■□□□ 1.54
BCR-208ENST00000466076 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.63■■□□□ 1.53
BCR-208ENST00000466076 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.62■■□□□ 1.53
BCR-208ENST00000466076 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.62■■□□□ 1.53
BCR-208ENST00000466076 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
BCR-208ENST00000466076 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.6■■□□□ 1.53
BCR-208ENST00000466076 CD109Q6YHK3 1445 aa24.6■■□□□ 1.53
BCR-208ENST00000466076 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.58■■□□□ 1.53
BCR-208ENST00000466076 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.58■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 PLCH2O75038 1416 aa24.57■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.56■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 PREX2Q70Z35 1606 aa24.53■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.53■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.53■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.52■■□□□ 1.52
BCR-208ENST00000466076 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.51■■□□□ 1.51
BCR-208ENST00000466076 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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