RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463900.5

AUP1-204, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AUP1, Length 1,645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-204ENST00000463900 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.8■■■□□ 2.2
AUP1-204ENST00000463900 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.8■■■□□ 2.2
AUP1-204ENST00000463900 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.8■■■□□ 2.2
AUP1-204ENST00000463900 JPH4Q96JJ6 628 aa28.8■■■□□ 2.2
AUP1-204ENST00000463900 SHROOM2Q13796 1616 aa28.78■■■□□ 2.2
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AUP1-204ENST00000463900 KDM6BO15054 1643 aa27.28■■□□□ 1.96
AUP1-204ENST00000463900 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.27■■□□□ 1.96
AUP1-204ENST00000463900 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.27■■□□□ 1.96
AUP1-204ENST00000463900 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
AUP1-204ENST00000463900 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.25■■□□□ 1.95
AUP1-204ENST00000463900 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.24■■□□□ 1.95
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