RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, human

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IMP4-209	ENST00000462357	EEA1	Q15075	1411 aa		34.28	■■■■□ 3.08
IMP4-209	ENST00000462357	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		34.26	■■■■□ 3.08
IMP4-209	ENST00000462357	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.25	■■■■□ 3.07
IMP4-209	ENST00000462357	ARAP1	Q96P48	1450 aa		34.14	■■■■□ 3.06
IMP4-209	ENST00000462357	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
IMP4-209	ENST00000462357	SHROOM2	Q13796	1616 aa		34.09	■■■■□ 3.05
IMP4-209	ENST00000462357	PRX	Q9BXM0	1461 aa		34.07	■■■■□ 3.05
IMP4-209	ENST00000462357	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
IMP4-209	ENST00000462357	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		34.01	■■■■□ 3.03
IMP4-209	ENST00000462357	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.96	■■■■□ 3.03
IMP4-209	ENST00000462357	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.92	■■■■□ 3.02
IMP4-209	ENST00000462357	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.83	■■■■□ 3.01
IMP4-209	ENST00000462357	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.83	■■■■□ 3.01
IMP4-209	ENST00000462357	PTPRG	P23470	1445 aa		33.82	■■■■□ 3
IMP4-209	ENST00000462357	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.79	■■■■□ 3
IMP4-209	ENST00000462357	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.78	■■■■□ 3
IMP4-209	ENST00000462357	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
IMP4-209	ENST00000462357	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
IMP4-209	ENST00000462357	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.73	■■■□□ 2.99
IMP4-209	ENST00000462357	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
IMP4-209	ENST00000462357	KIF21B	O75037	1637 aa		33.69	■■■□□ 2.98
IMP4-209	ENST00000462357	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.68	■■■□□ 2.98
IMP4-209	ENST00000462357	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.58	■■■□□ 2.97
IMP4-209	ENST00000462357	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.57	■■■□□ 2.97
IMP4-209	ENST00000462357	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.54	■■■□□ 2.96
IMP4-209	ENST00000462357	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
IMP4-209	ENST00000462357	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.5	■■■□□ 2.95
IMP4-209	ENST00000462357	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.47	■■■□□ 2.95
IMP4-209	ENST00000462357	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.42	■■■□□ 2.94
IMP4-209	ENST00000462357	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.41	■■■□□ 2.94
IMP4-209	ENST00000462357	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.34	■■■□□ 2.93
IMP4-209	ENST00000462357	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.33	■■■□□ 2.93
IMP4-209	ENST00000462357	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.33	■■■□□ 2.93
IMP4-209	ENST00000462357	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.3	■■■□□ 2.92
IMP4-209	ENST00000462357	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.29	■■■□□ 2.92
IMP4-209	ENST00000462357	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.27	■■■□□ 2.92
IMP4-209	ENST00000462357	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.23	■■■□□ 2.91
IMP4-209	ENST00000462357	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.23	■■■□□ 2.91
IMP4-209	ENST00000462357	ABCA8	O94911	1581 aa		33.21	■■■□□ 2.91
IMP4-209	ENST00000462357	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.2	■■■□□ 2.91
IMP4-209	ENST00000462357	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
IMP4-209	ENST00000462357	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
IMP4-209	ENST00000462357	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.16	■■■□□ 2.9
IMP4-209	ENST00000462357	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.09	■■■□□ 2.89
IMP4-209	ENST00000462357	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.08	■■■□□ 2.89
IMP4-209	ENST00000462357	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
IMP4-209	ENST00000462357	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.07	■■■□□ 2.88
IMP4-209	ENST00000462357	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
IMP4-209	ENST00000462357	ATP10B	O94823	1461 aa		33.04	■■■□□ 2.88
IMP4-209	ENST00000462357	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.04	■■■□□ 2.88
IMP4-209	ENST00000462357	CLIP1	P30622	1438 aa		33.03	■■■□□ 2.88
IMP4-209	ENST00000462357	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.03	■■■□□ 2.88
IMP4-209	ENST00000462357	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.03	■■■□□ 2.88
IMP4-209	ENST00000462357	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		33.02	■■■□□ 2.88
IMP4-209	ENST00000462357	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
IMP4-209	ENST00000462357	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
IMP4-209	ENST00000462357	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
IMP4-209	ENST00000462357	GLI2	P10070	1586 aa		32.96	■■■□□ 2.87
IMP4-209	ENST00000462357	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.95	■■■□□ 2.87
IMP4-209	ENST00000462357	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.93	■■■□□ 2.86
IMP4-209	ENST00000462357	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.84	■■■□□ 2.85
IMP4-209	ENST00000462357	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.83	■■■□□ 2.85
IMP4-209	ENST00000462357	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.81	■■■□□ 2.84
IMP4-209	ENST00000462357	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.81	■■■□□ 2.84
IMP4-209	ENST00000462357	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.8	■■■□□ 2.84
IMP4-209	ENST00000462357	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.72	■■■□□ 2.83
IMP4-209	ENST00000462357	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.71	■■■□□ 2.83
IMP4-209	ENST00000462357	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.7	■■■□□ 2.83
IMP4-209	ENST00000462357	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.7	■■■□□ 2.83
IMP4-209	ENST00000462357	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
IMP4-209	ENST00000462357	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.67	■■■□□ 2.82
IMP4-209	ENST00000462357	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.67	■■■□□ 2.82
IMP4-209	ENST00000462357	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.64	■■■□□ 2.82
IMP4-209	ENST00000462357	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
IMP4-209	ENST00000462357	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
IMP4-209	ENST00000462357	KDM6B	O15054	1643 aa		32.59	■■■□□ 2.81
IMP4-209	ENST00000462357	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.59	■■■□□ 2.81
IMP4-209	ENST00000462357	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
IMP4-209	ENST00000462357	NEO1	Q92859	1461 aa		32.48	■■■□□ 2.79
IMP4-209	ENST00000462357	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.47	■■■□□ 2.79
IMP4-209	ENST00000462357	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.46	■■■□□ 2.79
IMP4-209	ENST00000462357	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.46	■■■□□ 2.79
IMP4-209	ENST00000462357	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.45	■■■□□ 2.79
IMP4-209	ENST00000462357	APLP2	Q06481	763 aa		32.45	■■■□□ 2.79
IMP4-209	ENST00000462357	KIF14	Q15058	1648 aa		32.44	■■■□□ 2.78
IMP4-209	ENST00000462357	PLCH2	O75038	1416 aa		32.43	■■■□□ 2.78
IMP4-209	ENST00000462357	FANCA	O15360	1455 aa		32.39	■■■□□ 2.78
IMP4-209	ENST00000462357	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.39	■■■□□ 2.78
IMP4-209	ENST00000462357	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.35	■■■□□ 2.77
IMP4-209	ENST00000462357	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
IMP4-209	ENST00000462357	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.34	■■■□□ 2.77
IMP4-209	ENST00000462357	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.34	■■■□□ 2.77
IMP4-209	ENST00000462357	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.33	■■■□□ 2.77
IMP4-209	ENST00000462357	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.27	■■■□□ 2.76
IMP4-209	ENST00000462357	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
IMP4-209	ENST00000462357	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.26	■■■□□ 2.75
IMP4-209	ENST00000462357	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.25	■■■□□ 2.75
IMP4-209	ENST00000462357	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.23	■■■□□ 2.75
IMP4-209	ENST00000462357	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.22	■■■□□ 2.75
IMP4-209	ENST00000462357	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75

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