RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462012.1

MDM4-208, Transcript of MDM4, p53 regulator, humanhuman

TSL 2

Gene MDM4, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM4-208ENST00000462012 SHROOM2Q13796 1616 aa21.21■□□□□ 0.99
MDM4-208ENST00000462012 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.2■□□□□ 0.98
MDM4-208ENST00000462012 PRXQ9BXM0 1461 aa21.2■□□□□ 0.98
MDM4-208ENST00000462012 JPH4Q96JJ6 628 aa21.18■□□□□ 0.98
MDM4-208ENST00000462012 ARAP1Q96P48 1450 aa21.13■□□□□ 0.97
MDM4-208ENST00000462012 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.1■□□□□ 0.97
MDM4-208ENST00000462012 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
MDM4-208ENST00000462012 IQGAP2Q13576 1575 aa21.06■□□□□ 0.96
MDM4-208ENST00000462012 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.02■□□□□ 0.96
MDM4-208ENST00000462012 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.01■□□□□ 0.95
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MDM4-208ENST00000462012 GOLGA3Q08378 1498 aa20.93■□□□□ 0.94
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MDM4-208ENST00000462012 PTPRGP23470 1445 aa20.89■□□□□ 0.94
MDM4-208ENST00000462012 KIAA0556O60303 1618 aa20.84■□□□□ 0.93
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MDM4-208ENST00000462012 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.72■□□□□ 0.91
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MDM4-208ENST00000462012 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.65■□□□□ 0.9
MDM4-208ENST00000462012 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
MDM4-208ENST00000462012 ABCA8O94911 1581 aa20.63■□□□□ 0.89
MDM4-208ENST00000462012 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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MDM4-208ENST00000462012 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.56■□□□□ 0.88
MDM4-208ENST00000462012 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.56■□□□□ 0.88
MDM4-208ENST00000462012 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.56■□□□□ 0.88
MDM4-208ENST00000462012 FMN1Q68DA7 1419 aa20.55■□□□□ 0.88
MDM4-208ENST00000462012 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
MDM4-208ENST00000462012 ASXL2Q76L83 1435 aa20.53■□□□□ 0.88
MDM4-208ENST00000462012 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.51■□□□□ 0.87
MDM4-208ENST00000462012 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MDM4-208ENST00000462012 DIP2BQ9P265 1576 aa20.47■□□□□ 0.87
MDM4-208ENST00000462012 CLIP1P30622 1438 aa20.47■□□□□ 0.87
MDM4-208ENST00000462012 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.47■□□□□ 0.87
MDM4-208ENST00000462012 ATP10BO94823 1461 aa20.47■□□□□ 0.87
MDM4-208ENST00000462012 GLI2P10070 1586 aa20.46■□□□□ 0.87
MDM4-208ENST00000462012 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
MDM4-208ENST00000462012 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.45■□□□□ 0.86
MDM4-208ENST00000462012 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.43■□□□□ 0.86
MDM4-208ENST00000462012 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
MDM4-208ENST00000462012 CEP162Q5TB80 1403 aa20.37■□□□□ 0.85
MDM4-208ENST00000462012 HECW1Q76N89 1606 aa20.37■□□□□ 0.85
MDM4-208ENST00000462012 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.36■□□□□ 0.85
MDM4-208ENST00000462012 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.36■□□□□ 0.85
MDM4-208ENST00000462012 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.35■□□□□ 0.85
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MDM4-208ENST00000462012 ARID3CA6NKF2 412 aa20.3■□□□□ 0.84
MDM4-208ENST00000462012 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.3■□□□□ 0.84
MDM4-208ENST00000462012 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.3■□□□□ 0.84
MDM4-208ENST00000462012 KCNH8Q96L42 1107 aa20.29■□□□□ 0.84
MDM4-208ENST00000462012 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.28■□□□□ 0.84
MDM4-208ENST00000462012 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.27■□□□□ 0.84
MDM4-208ENST00000462012 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
MDM4-208ENST00000462012 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.27■□□□□ 0.83
MDM4-208ENST00000462012 CD109Q6YHK3 1445 aa20.26■□□□□ 0.83
MDM4-208ENST00000462012 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
MDM4-208ENST00000462012 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.24■□□□□ 0.83
MDM4-208ENST00000462012 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
MDM4-208ENST00000462012 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.21■□□□□ 0.83
MDM4-208ENST00000462012 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
MDM4-208ENST00000462012 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MDM4-208ENST00000462012 TSPOAP1O95153 1857 aa20.17■□□□□ 0.82
MDM4-208ENST00000462012 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.17■□□□□ 0.82
MDM4-208ENST00000462012 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.14■□□□□ 0.81
MDM4-208ENST00000462012 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
MDM4-208ENST00000462012 NEO1Q92859 1461 aa20.13■□□□□ 0.81
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MDM4-208ENST00000462012 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.11■□□□□ 0.81
MDM4-208ENST00000462012 PLCH2O75038 1416 aa20.09■□□□□ 0.81
MDM4-208ENST00000462012 MAP3K1Q13233 1512 aa20.07■□□□□ 0.8
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MDM4-208ENST00000462012 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.05■□□□□ 0.8
MDM4-208ENST00000462012 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.05■□□□□ 0.8
MDM4-208ENST00000462012 FANCAO15360 1455 aa20.04■□□□□ 0.8
MDM4-208ENST00000462012 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.03■□□□□ 0.8
MDM4-208ENST00000462012 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
MDM4-208ENST00000462012 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.02■□□□□ 0.79
MDM4-208ENST00000462012 AKNAQ7Z591 1439 aa20■□□□□ 0.79
MDM4-208ENST00000462012 TIAM1Q13009 1591 aa20■□□□□ 0.79
MDM4-208ENST00000462012 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.99■□□□□ 0.79
MDM4-208ENST00000462012 APLP2Q06481 763 aa19.96■□□□□ 0.79
MDM4-208ENST00000462012 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
MDM4-208ENST00000462012 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.93■□□□□ 0.78
MDM4-208ENST00000462012 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.93■□□□□ 0.78
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