RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452892.1

CCM2L-202, Transcript of CCM2 like scaffold protein, humanhuman

TSL 2

Gene CCM2L, Length 1,841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2L-202ENST00000452892 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
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CCM2L-202ENST00000452892 ARAP1Q96P48 1450 aa42.96■■■■■ 4.47
CCM2L-202ENST00000452892 IQGAP2Q13576 1575 aa42.94■■■■■ 4.46
CCM2L-202ENST00000452892 CEP170Q5SW79 1584 aa42.94■■■■■ 4.46
CCM2L-202ENST00000452892 CHD1O14646 1710 aa42.94■■■■■ 4.46
CCM2L-202ENST00000452892 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.87■■■■■ 4.45
CCM2L-202ENST00000452892 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.87■■■■■ 4.45
CCM2L-202ENST00000452892 NUP160Q12769 1436 aa42.86■■■■■ 4.45
CCM2L-202ENST00000452892 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.86■■■■■ 4.45
CCM2L-202ENST00000452892 SAMD9Q5K651 1589 aa42.79■■■■■ 4.44
CCM2L-202ENST00000452892 P3H3Q8IVL6 736 aa42.76■■■■■ 4.44
CCM2L-202ENST00000452892 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.71■■■■■ 4.43
CCM2L-202ENST00000452892 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.7■■■■■ 4.43
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CCM2L-202ENST00000452892 KIAA0556O60303 1618 aa42.52■■■■■ 4.4
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CCM2L-202ENST00000452892 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.38■■■■■ 4.37
CCM2L-202ENST00000452892 SHROOM2Q13796 1616 aa42.35■■■■■ 4.37
CCM2L-202ENST00000452892 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.34■■■■■ 4.37
CCM2L-202ENST00000452892 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.33■■■■■ 4.37
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CCM2L-202ENST00000452892 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
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CCM2L-202ENST00000452892 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.15■■■■■ 4.34
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CCM2L-202ENST00000452892 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.06■■■■■ 4.32
CCM2L-202ENST00000452892 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.04■■■■■ 4.32
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CCM2L-202ENST00000452892 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.97■■■■■ 4.31
CCM2L-202ENST00000452892 PTPRGP23470 1445 aa41.96■■■■■ 4.31
CCM2L-202ENST00000452892 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.95■■■■■ 4.31
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CCM2L-202ENST00000452892 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.75■■■■■ 4.27
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CCM2L-202ENST00000452892 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.71■■■■■ 4.27
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CCM2L-202ENST00000452892 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.3■■■■■ 4.2
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CCM2L-202ENST00000452892 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.08■■■■■ 4.17
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CCM2L-202ENST00000452892 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.16
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CCM2L-202ENST00000452892 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41■■■■■ 4.15
CCM2L-202ENST00000452892 ASXL2Q76L83 1435 aa40.97■■■■■ 4.15
CCM2L-202ENST00000452892 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
CCM2L-202ENST00000452892 PREX2Q70Z35 1606 aa40.91■■■■■ 4.14
CCM2L-202ENST00000452892 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.9■■■■■ 4.14
CCM2L-202ENST00000452892 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
CCM2L-202ENST00000452892 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.89■■■■■ 4.14
CCM2L-202ENST00000452892 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.87■■■■■ 4.13
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