RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452514.6

MEG3-211, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MEG3, Length 461 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-211ENST00000452514 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.73■■■□□ 2.35
MEG3-211ENST00000452514 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
MEG3-211ENST00000452514 SHROOM2Q13796 1616 aa29.7■■■□□ 2.34
MEG3-211ENST00000452514 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.69■■■□□ 2.34
MEG3-211ENST00000452514 KIF21BO75037 1637 aa29.58■■■□□ 2.33
MEG3-211ENST00000452514 IQGAP2Q13576 1575 aa29.57■■■□□ 2.32
MEG3-211ENST00000452514 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.57■■■□□ 2.32
MEG3-211ENST00000452514 JPH4Q96JJ6 628 aa29.56■■■□□ 2.32
MEG3-211ENST00000452514 ARAP1Q96P48 1450 aa29.55■■■□□ 2.32
MEG3-211ENST00000452514 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.54■■■□□ 2.32
MEG3-211ENST00000452514 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
MEG3-211ENST00000452514 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.43■■■□□ 2.3
MEG3-211ENST00000452514 GOLGA3Q08378 1498 aa29.39■■■□□ 2.3
MEG3-211ENST00000452514 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.38■■■□□ 2.29
MEG3-211ENST00000452514 DISP1Q96F81 1524 aa29.35■■■□□ 2.29
MEG3-211ENST00000452514 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.32■■■□□ 2.28
MEG3-211ENST00000452514 KIAA0556O60303 1618 aa29.3■■■□□ 2.28
MEG3-211ENST00000452514 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.29■■■□□ 2.28
MEG3-211ENST00000452514 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.24■■■□□ 2.27
MEG3-211ENST00000452514 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
MEG3-211ENST00000452514 SAMD9Q5K651 1589 aa29.19■■■□□ 2.26
MEG3-211ENST00000452514 PTPRGP23470 1445 aa29.19■■■□□ 2.26
MEG3-211ENST00000452514 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
MEG3-211ENST00000452514 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.09■■■□□ 2.25
MEG3-211ENST00000452514 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.09■■■□□ 2.25
MEG3-211ENST00000452514 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
MEG3-211ENST00000452514 P3H3Q8IVL6 736 aa29.04■■■□□ 2.24
MEG3-211ENST00000452514 UACAQ9BZF9 1416 aa29.02■■■□□ 2.24
MEG3-211ENST00000452514 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.01■■■□□ 2.23
MEG3-211ENST00000452514 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29■■■□□ 2.23
MEG3-211ENST00000452514 ABCC2Q92887 1545 aa28.99■■■□□ 2.23
MEG3-211ENST00000452514 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.98■■■□□ 2.23
MEG3-211ENST00000452514 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.97■■■□□ 2.23
MEG3-211ENST00000452514 ABCA8O94911 1581 aa28.96■■■□□ 2.23
MEG3-211ENST00000452514 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.91■■■□□ 2.22
MEG3-211ENST00000452514 CLIP1P30622 1438 aa28.86■■■□□ 2.21
MEG3-211ENST00000452514 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.86■■■□□ 2.21
MEG3-211ENST00000452514 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
MEG3-211ENST00000452514 MAPKBP1O60336 1514 aa28.84■■■□□ 2.21
MEG3-211ENST00000452514 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.84■■■□□ 2.21
MEG3-211ENST00000452514 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
MEG3-211ENST00000452514 CEP162Q5TB80 1403 aa28.8■■■□□ 2.2
MEG3-211ENST00000452514 FMN1Q68DA7 1419 aa28.78■■■□□ 2.2
MEG3-211ENST00000452514 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
MEG3-211ENST00000452514 ASXL2Q76L83 1435 aa28.71■■■□□ 2.19
MEG3-211ENST00000452514 ATP10BO94823 1461 aa28.7■■■□□ 2.18
MEG3-211ENST00000452514 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
MEG3-211ENST00000452514 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.66■■■□□ 2.18
MEG3-211ENST00000452514 ARID3CA6NKF2 412 aa28.66■■■□□ 2.18
MEG3-211ENST00000452514 HECW1Q76N89 1606 aa28.65■■■□□ 2.18
MEG3-211ENST00000452514 DIP2BQ9P265 1576 aa28.65■■■□□ 2.18
MEG3-211ENST00000452514 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.64■■■□□ 2.17
MEG3-211ENST00000452514 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
MEG3-211ENST00000452514 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.61■■■□□ 2.17
MEG3-211ENST00000452514 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.6■■■□□ 2.17
MEG3-211ENST00000452514 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
MEG3-211ENST00000452514 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
MEG3-211ENST00000452514 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.56■■■□□ 2.16
MEG3-211ENST00000452514 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.55■■■□□ 2.16
MEG3-211ENST00000452514 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.54■■■□□ 2.16
MEG3-211ENST00000452514 GLI2P10070 1586 aa28.53■■■□□ 2.16
MEG3-211ENST00000452514 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
MEG3-211ENST00000452514 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
MEG3-211ENST00000452514 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
MEG3-211ENST00000452514 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.46■■■□□ 2.15
MEG3-211ENST00000452514 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.44■■■□□ 2.14
MEG3-211ENST00000452514 KCNH8Q96L42 1107 aa28.42■■■□□ 2.14
MEG3-211ENST00000452514 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.42■■■□□ 2.14
MEG3-211ENST00000452514 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.41■■■□□ 2.14
MEG3-211ENST00000452514 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.36■■■□□ 2.13
MEG3-211ENST00000452514 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.36■■■□□ 2.13
MEG3-211ENST00000452514 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
MEG3-211ENST00000452514 TSPOAP1O95153 1857 aa28.35■■■□□ 2.13
MEG3-211ENST00000452514 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
MEG3-211ENST00000452514 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
MEG3-211ENST00000452514 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.33■■■□□ 2.13
MEG3-211ENST00000452514 CD109Q6YHK3 1445 aa28.29■■■□□ 2.12
MEG3-211ENST00000452514 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
MEG3-211ENST00000452514 KIF14Q15058 1648 aa28.27■■■□□ 2.12
MEG3-211ENST00000452514 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.26■■■□□ 2.11
MEG3-211ENST00000452514 TIAM1Q13009 1591 aa28.23■■■□□ 2.11
MEG3-211ENST00000452514 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.22■■■□□ 2.11
MEG3-211ENST00000452514 MAP3K1Q13233 1512 aa28.17■■■□□ 2.1
MEG3-211ENST00000452514 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.17■■■□□ 2.1
MEG3-211ENST00000452514 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.16■■■□□ 2.1
MEG3-211ENST00000452514 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.11■■■□□ 2.09
MEG3-211ENST00000452514 KDM6BO15054 1643 aa28.1■■■□□ 2.09
MEG3-211ENST00000452514 PLCH2O75038 1416 aa28.09■■■□□ 2.09
MEG3-211ENST00000452514 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.08■■■□□ 2.09
MEG3-211ENST00000452514 NEO1Q92859 1461 aa28.08■■■□□ 2.09
MEG3-211ENST00000452514 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.08■■■□□ 2.08
MEG3-211ENST00000452514 FANCAO15360 1455 aa28.05■■■□□ 2.08
MEG3-211ENST00000452514 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.05■■■□□ 2.08
MEG3-211ENST00000452514 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
MEG3-211ENST00000452514 PREX2Q70Z35 1606 aa28.03■■■□□ 2.08
MEG3-211ENST00000452514 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.02■■■□□ 2.08
MEG3-211ENST00000452514 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.02■■■□□ 2.08
MEG3-211ENST00000452514 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
MEG3-211ENST00000452514 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
MEG3-211ENST00000452514 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms