RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 PRXQ9BXM0 1461 aa18.4■□□□□ 0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.4■□□□□ 0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.38■□□□□ 0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 EEA1Q15075 1411 aa18.36■□□□□ 0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.36■□□□□ 0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 SHROOM2Q13796 1616 aa18.34■□□□□ 0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.32■□□□□ 0.52
RPRD1B-202ENST00000449186 JPH4Q96JJ6 628 aa18.31■□□□□ 0.52
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RPRD1B-202ENST00000449186 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.25■□□□□ 0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF21BO75037 1637 aa18.24■□□□□ 0.51
RPRD1B-202ENST00000449186 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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RPRD1B-202ENST00000449186 DISP1Q96F81 1524 aa18.17■□□□□ 0.5
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RPRD1B-202ENST00000449186 P3H3Q8IVL6 736 aa18.1■□□□□ 0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.08■□□□□ 0.49
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RPRD1B-202ENST00000449186 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.05■□□□□ 0.48
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RPRD1B-202ENST00000449186 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.01■□□□□ 0.47
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RPRD1B-202ENST00000449186 ABCC2Q92887 1545 aa17.89■□□□□ 0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.87■□□□□ 0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
RPRD1B-202ENST00000449186 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
RPRD1B-202ENST00000449186 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
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RPRD1B-202ENST00000449186 CEP162Q5TB80 1403 aa17.81■□□□□ 0.44
RPRD1B-202ENST00000449186 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.81■□□□□ 0.44
RPRD1B-202ENST00000449186 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
RPRD1B-202ENST00000449186 MAPKBP1O60336 1514 aa17.77■□□□□ 0.44
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP10BO94823 1461 aa17.77■□□□□ 0.44
RPRD1B-202ENST00000449186 ASXL2Q76L83 1435 aa17.77■□□□□ 0.44
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.75■□□□□ 0.43
RPRD1B-202ENST00000449186 FMN1Q68DA7 1419 aa17.73■□□□□ 0.43
RPRD1B-202ENST00000449186 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
RPRD1B-202ENST00000449186 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
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RPRD1B-202ENST00000449186 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.7■□□□□ 0.42
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RPRD1B-202ENST00000449186 KCNH8Q96L42 1107 aa17.68■□□□□ 0.42
RPRD1B-202ENST00000449186 HECW1Q76N89 1606 aa17.67■□□□□ 0.42
RPRD1B-202ENST00000449186 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.67■□□□□ 0.42
RPRD1B-202ENST00000449186 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.66■□□□□ 0.42
RPRD1B-202ENST00000449186 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
RPRD1B-202ENST00000449186 TSPOAP1O95153 1857 aa17.63■□□□□ 0.41
RPRD1B-202ENST00000449186 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.6■□□□□ 0.41
RPRD1B-202ENST00000449186 GLI2P10070 1586 aa17.58■□□□□ 0.41
RPRD1B-202ENST00000449186 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.57■□□□□ 0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 KIF14Q15058 1648 aa17.53■□□□□ 0.4
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.52■□□□□ 0.4
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RPRD1B-202ENST00000449186 CD109Q6YHK3 1445 aa17.5■□□□□ 0.39
RPRD1B-202ENST00000449186 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
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RPRD1B-202ENST00000449186 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
RPRD1B-202ENST00000449186 TIAM1Q13009 1591 aa17.44■□□□□ 0.38
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RPRD1B-202ENST00000449186 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
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RPRD1B-202ENST00000449186 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.38■□□□□ 0.37
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RPRD1B-202ENST00000449186 PLCH2O75038 1416 aa17.36■□□□□ 0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.36■□□□□ 0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.35■□□□□ 0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.35■□□□□ 0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 FANCAO15360 1455 aa17.34■□□□□ 0.37
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP3K1Q13233 1512 aa17.32■□□□□ 0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 PREX2Q70Z35 1606 aa17.32■□□□□ 0.36
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RPRD1B-202ENST00000449186 NCOA2Q15596 1464 aa17.31■□□□□ 0.36
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