RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 NEUROD1Q13562 356 aa23.66■■□□□ 1.38
SHQ1-202ENST00000444040 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SHQ1-202ENST00000444040 WDR97A6NE52 1622 aa23.62■■□□□ 1.37
SHQ1-202ENST00000444040 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SHQ1-202ENST00000444040 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.6■■□□□ 1.37
SHQ1-202ENST00000444040 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.6■■□□□ 1.37
SHQ1-202ENST00000444040 P3H3Q8IVL6 736 aa23.59■■□□□ 1.37
SHQ1-202ENST00000444040 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.58■■□□□ 1.37
SHQ1-202ENST00000444040 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.58■■□□□ 1.37
SHQ1-202ENST00000444040 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.56■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 ITGAEP38570 1179 aa23.55■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.54■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.54■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.54■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.53■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.53■■□□□ 1.36
SHQ1-202ENST00000444040 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.51■■□□□ 1.35
SHQ1-202ENST00000444040 MIER1Q8N108 512 aa23.51■■□□□ 1.35
SHQ1-202ENST00000444040 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SHQ1-202ENST00000444040 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.48■■□□□ 1.35
SHQ1-202ENST00000444040 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.45■■□□□ 1.34
SHQ1-202ENST00000444040 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SHQ1-202ENST00000444040 FMN1Q68DA7 1419 aa23.44■■□□□ 1.34
SHQ1-202ENST00000444040 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.43■■□□□ 1.34
SHQ1-202ENST00000444040 MAPKBP1O60336 1514 aa23.43■■□□□ 1.34
SHQ1-202ENST00000444040 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.42■■□□□ 1.34
SHQ1-202ENST00000444040 SAMD9Q5K651 1589 aa23.41■■□□□ 1.34
SHQ1-202ENST00000444040 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SHQ1-202ENST00000444040 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
SHQ1-202ENST00000444040 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SHQ1-202ENST00000444040 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.37■■□□□ 1.33
SHQ1-202ENST00000444040 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SHQ1-202ENST00000444040 GRIN2BQ13224 1484 aa23.29■■□□□ 1.32
SHQ1-202ENST00000444040 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.28■■□□□ 1.32
SHQ1-202ENST00000444040 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.27■■□□□ 1.32
SHQ1-202ENST00000444040 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SHQ1-202ENST00000444040 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.25■■□□□ 1.31
SHQ1-202ENST00000444040 PBRM1Q86U86 1689 aa23.21■■□□□ 1.31
SHQ1-202ENST00000444040 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.19■■□□□ 1.3
SHQ1-202ENST00000444040 NCOA2Q15596 1464 aa23.19■■□□□ 1.3
SHQ1-202ENST00000444040 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.18■■□□□ 1.3
SHQ1-202ENST00000444040 ADAMTS12P58397 1594 aa23.16■■□□□ 1.3
SHQ1-202ENST00000444040 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.16■■□□□ 1.3
SHQ1-202ENST00000444040 PTPRKQ15262 1439 aa23.16■■□□□ 1.3
SHQ1-202ENST00000444040 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.16■■□□□ 1.3
SHQ1-202ENST00000444040 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.14■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 IQGAP2Q13576 1575 aa23.13■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGEF11O15085 1522 aa23.12■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 HFM1A2PYH4 1435 aa23.12■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.11■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.11■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.1■■□□□ 1.29
SHQ1-202ENST00000444040 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-202ENST00000444040 HECW1Q76N89 1606 aa23.06■■□□□ 1.28
SHQ1-202ENST00000444040 IFT140Q96RY7 1462 aa23.05■■□□□ 1.28
SHQ1-202ENST00000444040 NAIPQ13075 1403 aa23.05■■□□□ 1.28
SHQ1-202ENST00000444040 UACAQ9BZF9 1416 aa23.04■■□□□ 1.28
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-202ENST00000444040 WDR62O43379 1518 aa23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-202ENST00000444040 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SHQ1-202ENST00000444040 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-202ENST00000444040 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SHQ1-202ENST00000444040 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.94■■□□□ 1.26
SHQ1-202ENST00000444040 MIA2Q96PC5 1412 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-202ENST00000444040 DISP1Q96F81 1524 aa22.91■■□□□ 1.26
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA0556O60303 1618 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 TONSLQ96HA7 1378 aa22.89■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 AKNAQ7Z591 1439 aa22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 GRIN2AQ12879 1464 aa22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.87■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.85■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.83■■□□□ 1.25
SHQ1-202ENST00000444040 ARID3CA6NKF2 412 aa22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 KCNH8Q96L42 1107 aa22.81■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 KDM6BO15054 1643 aa22.79■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.78■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SHQ1-202ENST00000444040 ERCC6Q03468 1493 aa22.76■■□□□ 1.23
SHQ1-202ENST00000444040 DAPK1P53355 1430 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-202ENST00000444040 CEP170Q5SW79 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-202ENST00000444040 SYNJ2O15056 1496 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-202ENST00000444040 ROCK1Q13464 1354 aa22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM52Q96A61 297 aa22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-202ENST00000444040 ABCC5O15440 1437 aa22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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