RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439969.2

C6orf223-202, Transcript of chromosome 6 open reading frame 223, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C6orf223, Length 2,757 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223-202ENST00000439969 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
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C6orf223-202ENST00000439969 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.84■■■□□ 2.05
C6orf223-202ENST00000439969 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.83■■■□□ 2.05
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C6orf223-202ENST00000439969 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.71■■■□□ 2.03
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C6orf223-202ENST00000439969 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.69■■■□□ 2.02
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C6orf223-202ENST00000439969 ARID3CA6NKF2 412 aa27.66■■■□□ 2.02
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C6orf223-202ENST00000439969 MIER1Q8N108 512 aa27.65■■■□□ 2.02
C6orf223-202ENST00000439969 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.63■■■□□ 2.01
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C6orf223-202ENST00000439969 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.61■■■□□ 2.01
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C6orf223-202ENST00000439969 PBRM1Q86U86 1689 aa27.39■■□□□ 1.98
C6orf223-202ENST00000439969 ERCC6Q03468 1493 aa27.39■■□□□ 1.97
C6orf223-202ENST00000439969 MAPKBP1O60336 1514 aa27.39■■□□□ 1.97
C6orf223-202ENST00000439969 NCOA2Q15596 1464 aa27.35■■□□□ 1.97
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C6orf223-202ENST00000439969 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.34■■□□□ 1.97
C6orf223-202ENST00000439969 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.33■■□□□ 1.97
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C6orf223-202ENST00000439969 IFT140Q96RY7 1462 aa27.31■■□□□ 1.96
C6orf223-202ENST00000439969 IQGAP2Q13576 1575 aa27.31■■□□□ 1.96
C6orf223-202ENST00000439969 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.28■■□□□ 1.96
C6orf223-202ENST00000439969 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.26■■□□□ 1.96
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C6orf223-202ENST00000439969 WDR62O43379 1518 aa27.23■■□□□ 1.95
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C6orf223-202ENST00000439969 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.16■■□□□ 1.94
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C6orf223-202ENST00000439969 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
C6orf223-202ENST00000439969 HECW1Q76N89 1606 aa27.12■■□□□ 1.93
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C6orf223-202ENST00000439969 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.11■■□□□ 1.93
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C6orf223-202ENST00000439969 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.09■■□□□ 1.93
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C6orf223-202ENST00000439969 ARHGEF11O15085 1522 aa27■■□□□ 1.91
C6orf223-202ENST00000439969 KIAA0556O60303 1618 aa26.99■■□□□ 1.91
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C6orf223-202ENST00000439969 KCNH8Q96L42 1107 aa26.97■■□□□ 1.91
C6orf223-202ENST00000439969 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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C6orf223-202ENST00000439969 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.96■■□□□ 1.91
C6orf223-202ENST00000439969 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.94■■□□□ 1.9
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C6orf223-202ENST00000439969 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
C6orf223-202ENST00000439969 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C6orf223-202ENST00000439969 CEP170Q5SW79 1584 aa26.92■■□□□ 1.9
C6orf223-202ENST00000439969 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
C6orf223-202ENST00000439969 MIA2Q96PC5 1412 aa26.88■■□□□ 1.89
C6orf223-202ENST00000439969 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
C6orf223-202ENST00000439969 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.86■■□□□ 1.89
C6orf223-202ENST00000439969 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.86■■□□□ 1.89
C6orf223-202ENST00000439969 KDM6BO15054 1643 aa26.86■■□□□ 1.89
C6orf223-202ENST00000439969 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
C6orf223-202ENST00000439969 DAPK1P53355 1430 aa26.79■■□□□ 1.88
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