RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436293.6

PAX8-AS1-204, PAX8 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PAX8-AS1, Length 2,687 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8-AS1-204ENST00000436293 KIF27Q86VH2 1401 aa21.18■□□□□ 0.98
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 CCER2I3L3R5 266 aa21.12■□□□□ 0.97
PAX8-AS1-204ENST00000436293 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PAX8-AS1-204ENST00000436293 TIAM1Q13009 1591 aa21.1■□□□□ 0.97
PAX8-AS1-204ENST00000436293 ANP32CO43423 234 aa21.08■□□□□ 0.96
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 NCAPD3P42695 1498 aa20.82■□□□□ 0.92
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.67■□□□□ 0.9
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 HFM1A2PYH4 1435 aa20.67■□□□□ 0.9
PAX8-AS1-204ENST00000436293 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.67■□□□□ 0.9
PAX8-AS1-204ENST00000436293 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.66■□□□□ 0.9
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 CCDC184Q52MB2 194 aa20.62■□□□□ 0.89
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.52■□□□□ 0.87
PAX8-AS1-204ENST00000436293 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.51■□□□□ 0.87
PAX8-AS1-204ENST00000436293 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PAX8-AS1-204ENST00000436293 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.5■□□□□ 0.87
PAX8-AS1-204ENST00000436293 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.49■□□□□ 0.87
PAX8-AS1-204ENST00000436293 MRS2Q9HD23 443 aa20.49■□□□□ 0.87
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 CCDC7Q96M83 1385 aa20.44■□□□□ 0.86
PAX8-AS1-204ENST00000436293 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.44■□□□□ 0.86
PAX8-AS1-204ENST00000436293 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PAX8-AS1-204ENST00000436293 NCOA1Q15788 1441 aa20.43■□□□□ 0.86
PAX8-AS1-204ENST00000436293 NBR1Q14596 966 aa20.42■□□□□ 0.86
PAX8-AS1-204ENST00000436293 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.42■□□□□ 0.86
PAX8-AS1-204ENST00000436293 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.41■□□□□ 0.86
PAX8-AS1-204ENST00000436293 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.4■□□□□ 0.86
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.37■□□□□ 0.85
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PAX8-AS1-204ENST00000436293 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.35■□□□□ 0.85
PAX8-AS1-204ENST00000436293 KDM6BO15054 1643 aa20.34■□□□□ 0.85
PAX8-AS1-204ENST00000436293 AKNAQ7Z591 1439 aa20.34■□□□□ 0.85
PAX8-AS1-204ENST00000436293 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.34■□□□□ 0.85
PAX8-AS1-204ENST00000436293 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.34■□□□□ 0.85
PAX8-AS1-204ENST00000436293 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.34■□□□□ 0.85
PAX8-AS1-204ENST00000436293 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.34■□□□□ 0.85
PAX8-AS1-204ENST00000436293 FOXD1Q16676 465 aa20.33■□□□□ 0.84
PAX8-AS1-204ENST00000436293 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PAX8-AS1-204ENST00000436293 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.31■□□□□ 0.84
PAX8-AS1-204ENST00000436293 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.31■□□□□ 0.84
PAX8-AS1-204ENST00000436293 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PAX8-AS1-204ENST00000436293 SAMD9Q5K651 1589 aa20.31■□□□□ 0.84
PAX8-AS1-204ENST00000436293 ARHGEF11O15085 1522 aa20.3■□□□□ 0.84
PAX8-AS1-204ENST00000436293 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.3■□□□□ 0.84
PAX8-AS1-204ENST00000436293 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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