RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433557.1

UTRN-208, Transcript of utrophin, humanhuman

TSL 4

Gene UTRN, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRN-208ENST00000433557 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.64■■■■□ 3.46
UTRN-208ENST00000433557 SHROOM2Q13796 1616 aa36.6■■■■□ 3.45
UTRN-208ENST00000433557 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.59■■■■□ 3.45
UTRN-208ENST00000433557 PRXQ9BXM0 1461 aa36.57■■■■□ 3.45
UTRN-208ENST00000433557 JPH4Q96JJ6 628 aa36.51■■■■□ 3.44
UTRN-208ENST00000433557 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.49■■■■□ 3.43
UTRN-208ENST00000433557 IQGAP2Q13576 1575 aa36.49■■■■□ 3.43
UTRN-208ENST00000433557 ARAP1Q96P48 1450 aa36.48■■■■□ 3.43
UTRN-208ENST00000433557 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.46■■■■□ 3.43
UTRN-208ENST00000433557 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
UTRN-208ENST00000433557 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.45■■■■□ 3.43
UTRN-208ENST00000433557 KIF21BO75037 1637 aa36.37■■■■□ 3.41
UTRN-208ENST00000433557 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.25■■■■□ 3.39
UTRN-208ENST00000433557 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.23■■■■□ 3.39
UTRN-208ENST00000433557 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.22■■■■□ 3.39
UTRN-208ENST00000433557 GOLGA3Q08378 1498 aa36.17■■■■□ 3.38
UTRN-208ENST00000433557 DISP1Q96F81 1524 aa36.13■■■■□ 3.37
UTRN-208ENST00000433557 KIAA0556O60303 1618 aa36.12■■■■□ 3.37
UTRN-208ENST00000433557 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
UTRN-208ENST00000433557 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
UTRN-208ENST00000433557 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.08■■■■□ 3.37
UTRN-208ENST00000433557 PTPRGP23470 1445 aa36.04■■■■□ 3.36
UTRN-208ENST00000433557 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
UTRN-208ENST00000433557 SAMD9Q5K651 1589 aa35.92■■■■□ 3.34
UTRN-208ENST00000433557 P3H3Q8IVL6 736 aa35.9■■■■□ 3.34
UTRN-208ENST00000433557 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.9■■■■□ 3.34
UTRN-208ENST00000433557 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
UTRN-208ENST00000433557 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.83■■■■□ 3.33
UTRN-208ENST00000433557 UACAQ9BZF9 1416 aa35.8■■■■□ 3.32
UTRN-208ENST00000433557 ABCC2Q92887 1545 aa35.75■■■■□ 3.31
UTRN-208ENST00000433557 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
UTRN-208ENST00000433557 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.73■■■■□ 3.31
UTRN-208ENST00000433557 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.73■■■■□ 3.31
UTRN-208ENST00000433557 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.7■■■■□ 3.31
UTRN-208ENST00000433557 ABCA8O94911 1581 aa35.67■■■■□ 3.3
UTRN-208ENST00000433557 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.61■■■■□ 3.29
UTRN-208ENST00000433557 MAPKBP1O60336 1514 aa35.6■■■■□ 3.29
UTRN-208ENST00000433557 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
UTRN-208ENST00000433557 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.59■■■■□ 3.29
UTRN-208ENST00000433557 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.56■■■■□ 3.28
UTRN-208ENST00000433557 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.52■■■■□ 3.28
UTRN-208ENST00000433557 CLIP1P30622 1438 aa35.51■■■■□ 3.28
UTRN-208ENST00000433557 FMN1Q68DA7 1419 aa35.48■■■■□ 3.27
UTRN-208ENST00000433557 ARID3CA6NKF2 412 aa35.47■■■■□ 3.27
UTRN-208ENST00000433557 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.46■■■■□ 3.27
UTRN-208ENST00000433557 ASXL2Q76L83 1435 aa35.45■■■■□ 3.27
UTRN-208ENST00000433557 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.4■■■■□ 3.26
UTRN-208ENST00000433557 CEP162Q5TB80 1403 aa35.4■■■■□ 3.26
UTRN-208ENST00000433557 DIP2BQ9P265 1576 aa35.39■■■■□ 3.26
UTRN-208ENST00000433557 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
UTRN-208ENST00000433557 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
UTRN-208ENST00000433557 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
UTRN-208ENST00000433557 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
UTRN-208ENST00000433557 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.36■■■■□ 3.25
UTRN-208ENST00000433557 ATP10BO94823 1461 aa35.35■■■■□ 3.25
UTRN-208ENST00000433557 HECW1Q76N89 1606 aa35.35■■■■□ 3.25
UTRN-208ENST00000433557 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.31■■■■□ 3.24
UTRN-208ENST00000433557 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
UTRN-208ENST00000433557 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
UTRN-208ENST00000433557 TSPOAP1O95153 1857 aa35.23■■■■□ 3.23
UTRN-208ENST00000433557 KCNH8Q96L42 1107 aa35.21■■■■□ 3.23
UTRN-208ENST00000433557 GLI2P10070 1586 aa35.21■■■■□ 3.23
UTRN-208ENST00000433557 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
UTRN-208ENST00000433557 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.18■■■■□ 3.22
UTRN-208ENST00000433557 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.16■■■■□ 3.22
UTRN-208ENST00000433557 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.15■■■■□ 3.22
UTRN-208ENST00000433557 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.14■■■■□ 3.22
UTRN-208ENST00000433557 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.1■■■■□ 3.21
UTRN-208ENST00000433557 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.09■■■■□ 3.21
UTRN-208ENST00000433557 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.08■■■■□ 3.21
UTRN-208ENST00000433557 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
UTRN-208ENST00000433557 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
UTRN-208ENST00000433557 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.98■■■■□ 3.19
UTRN-208ENST00000433557 CD109Q6YHK3 1445 aa34.98■■■■□ 3.19
UTRN-208ENST00000433557 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.95■■■■□ 3.19
UTRN-208ENST00000433557 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.94■■■■□ 3.18
UTRN-208ENST00000433557 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
UTRN-208ENST00000433557 KIF14Q15058 1648 aa34.89■■■■□ 3.18
UTRN-208ENST00000433557 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.86■■■■□ 3.17
UTRN-208ENST00000433557 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.86■■■■□ 3.17
UTRN-208ENST00000433557 KDM6BO15054 1643 aa34.84■■■■□ 3.17
UTRN-208ENST00000433557 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.84■■■■□ 3.17
UTRN-208ENST00000433557 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.77■■■■□ 3.16
UTRN-208ENST00000433557 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.76■■■■□ 3.16
UTRN-208ENST00000433557 TIAM1Q13009 1591 aa34.72■■■■□ 3.15
UTRN-208ENST00000433557 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.7■■■■□ 3.15
UTRN-208ENST00000433557 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.69■■■■□ 3.14
UTRN-208ENST00000433557 APLP2Q06481 763 aa34.67■■■■□ 3.14
UTRN-208ENST00000433557 NEO1Q92859 1461 aa34.65■■■■□ 3.14
UTRN-208ENST00000433557 FANCAO15360 1455 aa34.64■■■■□ 3.14
UTRN-208ENST00000433557 PLCH2O75038 1416 aa34.63■■■■□ 3.13
UTRN-208ENST00000433557 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.62■■■■□ 3.13
UTRN-208ENST00000433557 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.6■■■■□ 3.13
UTRN-208ENST00000433557 MAP3K1Q13233 1512 aa34.6■■■■□ 3.13
UTRN-208ENST00000433557 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.58■■■■□ 3.13
UTRN-208ENST00000433557 PREX2Q70Z35 1606 aa34.58■■■■□ 3.13
UTRN-208ENST00000433557 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
UTRN-208ENST00000433557 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.57■■■■□ 3.12
UTRN-208ENST00000433557 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.57■■■■□ 3.12
UTRN-208ENST00000433557 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms