RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CERKQ8TCT0 537 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PBRM1Q86U86 1689 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NUP160Q12769 1436 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRIN2AQ12879 1464 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.25■□□□□ 0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GLI2P10070 1586 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.18■□□□□ 0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRMP28827 1452 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS12P58397 1594 aa17.11■□□□□ 0.33
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JPH4Q96JJ6 628 aa17.08■□□□□ 0.33
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTSL3P82987 1691 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF21BO75037 1637 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CUX1P39880 1505 aa17■□□□□ 0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17■□□□□ 0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASXL2Q76L83 1435 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSPA2P54652 639 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCC2Q92887 1545 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MADDQ8WXG6 1647 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CUL7Q14999 1698 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRGP23470 1445 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STRCQ7RTU9 1775 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.71■□□□□ 0.26
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD109Q6YHK3 1445 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRTO14522 1441 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UACAQ9BZF9 1416 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSPA1LP34931 641 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.46■□□□□ 0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAPGEF3O95398 923 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FANCAO15360 1455 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNH8Q96L42 1107 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEO1Q92859 1461 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DISP1Q96F81 1524 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCOA1Q15788 1441 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AKNAQ7Z591 1439 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIP4K2BP78356 416 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IQGAP2Q13576 1575 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RICTORQ6R327 1708 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MLECQ14165 292 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOM1O60784 492 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA0556O60303 1618 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POTEAQ6S8J7 498 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
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