RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429923.5

LSP1-208, Transcript of lymphocyte specific protein 1, human

TSL 3

Gene LSP1, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LSP1-208	ENST00000429923	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LSP1-208	ENST00000429923	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LSP1-208	ENST00000429923	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LSP1-208	ENST00000429923	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
LSP1-208	ENST00000429923	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.22	■■■□□ 2.91
LSP1-208	ENST00000429923	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.13	■■■□□ 2.89
LSP1-208	ENST00000429923	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.13	■■■□□ 2.89
LSP1-208	ENST00000429923	KIF21B	O75037	1637 aa		33.12	■■■□□ 2.89
LSP1-208	ENST00000429923	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.11	■■■□□ 2.89
LSP1-208	ENST00000429923	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
LSP1-208	ENST00000429923	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.1	■■■□□ 2.89
LSP1-208	ENST00000429923	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LSP1-208	ENST00000429923	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.98	■■■□□ 2.87
LSP1-208	ENST00000429923	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.94	■■■□□ 2.86
LSP1-208	ENST00000429923	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.91	■■■□□ 2.86
LSP1-208	ENST00000429923	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LSP1-208	ENST00000429923	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.82	■■■□□ 2.84
LSP1-208	ENST00000429923	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.81	■■■□□ 2.84
LSP1-208	ENST00000429923	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
LSP1-208	ENST00000429923	PTPRG	P23470	1445 aa		32.76	■■■□□ 2.83
LSP1-208	ENST00000429923	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.74	■■■□□ 2.83
LSP1-208	ENST00000429923	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.7	■■■□□ 2.82
LSP1-208	ENST00000429923	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
LSP1-208	ENST00000429923	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LSP1-208	ENST00000429923	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.59	■■■□□ 2.81
LSP1-208	ENST00000429923	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
LSP1-208	ENST00000429923	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LSP1-208	ENST00000429923	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.55	■■■□□ 2.8
LSP1-208	ENST00000429923	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.54	■■■□□ 2.8
LSP1-208	ENST00000429923	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.49	■■■□□ 2.79
LSP1-208	ENST00000429923	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.48	■■■□□ 2.79
LSP1-208	ENST00000429923	ABCA8	O94911	1581 aa		32.46	■■■□□ 2.79
LSP1-208	ENST00000429923	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.45	■■■□□ 2.79
LSP1-208	ENST00000429923	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LSP1-208	ENST00000429923	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LSP1-208	ENST00000429923	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LSP1-208	ENST00000429923	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LSP1-208	ENST00000429923	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LSP1-208	ENST00000429923	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LSP1-208	ENST00000429923	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
LSP1-208	ENST00000429923	CLIP1	P30622	1438 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LSP1-208	ENST00000429923	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LSP1-208	ENST00000429923	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
LSP1-208	ENST00000429923	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.21	■■■□□ 2.75
LSP1-208	ENST00000429923	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.19	■■■□□ 2.74
LSP1-208	ENST00000429923	ATP10B	O94823	1461 aa		32.18	■■■□□ 2.74
LSP1-208	ENST00000429923	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
LSP1-208	ENST00000429923	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.17	■■■□□ 2.74
LSP1-208	ENST00000429923	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.16	■■■□□ 2.74
LSP1-208	ENST00000429923	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.12	■■■□□ 2.73
LSP1-208	ENST00000429923	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.11	■■■□□ 2.73
LSP1-208	ENST00000429923	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.08	■■■□□ 2.73
LSP1-208	ENST00000429923	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.07	■■■□□ 2.72
LSP1-208	ENST00000429923	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.06	■■■□□ 2.72
LSP1-208	ENST00000429923	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LSP1-208	ENST00000429923	GLI2	P10070	1586 aa		32.03	■■■□□ 2.72
LSP1-208	ENST00000429923	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
LSP1-208	ENST00000429923	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
LSP1-208	ENST00000429923	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
LSP1-208	ENST00000429923	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
LSP1-208	ENST00000429923	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
LSP1-208	ENST00000429923	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LSP1-208	ENST00000429923	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.97	■■■□□ 2.71
LSP1-208	ENST00000429923	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
LSP1-208	ENST00000429923	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.93	■■■□□ 2.7
LSP1-208	ENST00000429923	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.91	■■■□□ 2.7
LSP1-208	ENST00000429923	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.9	■■■□□ 2.7
LSP1-208	ENST00000429923	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.89	■■■□□ 2.7
LSP1-208	ENST00000429923	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
LSP1-208	ENST00000429923	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.86	■■■□□ 2.69
LSP1-208	ENST00000429923	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.85	■■■□□ 2.69
LSP1-208	ENST00000429923	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.83	■■■□□ 2.69
LSP1-208	ENST00000429923	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.81	■■■□□ 2.68
LSP1-208	ENST00000429923	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
LSP1-208	ENST00000429923	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.76	■■■□□ 2.68
LSP1-208	ENST00000429923	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
LSP1-208	ENST00000429923	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LSP1-208	ENST00000429923	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LSP1-208	ENST00000429923	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.7	■■■□□ 2.66
LSP1-208	ENST00000429923	KIF14	Q15058	1648 aa		31.67	■■■□□ 2.66
LSP1-208	ENST00000429923	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LSP1-208	ENST00000429923	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.6	■■■□□ 2.65
LSP1-208	ENST00000429923	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.59	■■■□□ 2.65
LSP1-208	ENST00000429923	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.56	■■■□□ 2.64
LSP1-208	ENST00000429923	KDM6B	O15054	1643 aa		31.55	■■■□□ 2.64
LSP1-208	ENST00000429923	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.55	■■■□□ 2.64
LSP1-208	ENST00000429923	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.54	■■■□□ 2.64
LSP1-208	ENST00000429923	PLCH2	O75038	1416 aa		31.53	■■■□□ 2.64
LSP1-208	ENST00000429923	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.53	■■■□□ 2.64
LSP1-208	ENST00000429923	NEO1	Q92859	1461 aa		31.51	■■■□□ 2.63
LSP1-208	ENST00000429923	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.5	■■■□□ 2.63
LSP1-208	ENST00000429923	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.49	■■■□□ 2.63
LSP1-208	ENST00000429923	APLP2	Q06481	763 aa		31.46	■■■□□ 2.63
LSP1-208	ENST00000429923	FANCA	O15360	1455 aa		31.46	■■■□□ 2.63
LSP1-208	ENST00000429923	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.45	■■■□□ 2.62
LSP1-208	ENST00000429923	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
LSP1-208	ENST00000429923	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.43	■■■□□ 2.62
LSP1-208	ENST00000429923	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.43	■■■□□ 2.62
LSP1-208	ENST00000429923	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
LSP1-208	ENST00000429923	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.42	■■■□□ 2.62

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