RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.51■□□□□ 0.87
THBS3-202ENST00000428962 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
THBS3-202ENST00000428962 TIAM1Q13009 1591 aa20.5■□□□□ 0.87
THBS3-202ENST00000428962 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.5■□□□□ 0.87
THBS3-202ENST00000428962 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.5■□□□□ 0.87
THBS3-202ENST00000428962 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.43■□□□□ 0.86
THBS3-202ENST00000428962 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.42■□□□□ 0.86
THBS3-202ENST00000428962 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
THBS3-202ENST00000428962 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.41■□□□□ 0.86
THBS3-202ENST00000428962 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.38■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.38■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.38■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 IFT140Q96RY7 1462 aa20.37■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.33■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.33■□□□□ 0.85
THBS3-202ENST00000428962 FMN1Q68DA7 1419 aa20.32■□□□□ 0.84
THBS3-202ENST00000428962 SAMD9Q5K651 1589 aa20.3■□□□□ 0.84
THBS3-202ENST00000428962 PBRM1Q86U86 1689 aa20.28■□□□□ 0.84
THBS3-202ENST00000428962 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
THBS3-202ENST00000428962 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
THBS3-202ENST00000428962 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
THBS3-202ENST00000428962 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
THBS3-202ENST00000428962 P3H3Q8IVL6 736 aa20.26■□□□□ 0.83
THBS3-202ENST00000428962 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.22■□□□□ 0.83
THBS3-202ENST00000428962 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.21■□□□□ 0.83
THBS3-202ENST00000428962 ADAMTS12P58397 1594 aa20.2■□□□□ 0.82
THBS3-202ENST00000428962 OSCARQ8IYS5 282 aa20.19■□□□□ 0.82
THBS3-202ENST00000428962 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
THBS3-202ENST00000428962 GRIN2BQ13224 1484 aa20.16■□□□□ 0.82
THBS3-202ENST00000428962 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
THBS3-202ENST00000428962 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
THBS3-202ENST00000428962 IQGAP2Q13576 1575 aa20.12■□□□□ 0.81
THBS3-202ENST00000428962 ITGAEP38570 1179 aa20.12■□□□□ 0.81
THBS3-202ENST00000428962 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.12■□□□□ 0.81
THBS3-202ENST00000428962 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.11■□□□□ 0.81
THBS3-202ENST00000428962 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.09■□□□□ 0.81
THBS3-202ENST00000428962 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.08■□□□□ 0.8
THBS3-202ENST00000428962 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
THBS3-202ENST00000428962 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.08■□□□□ 0.8
THBS3-202ENST00000428962 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.07■□□□□ 0.8
THBS3-202ENST00000428962 HECW1Q76N89 1606 aa20.06■□□□□ 0.8
THBS3-202ENST00000428962 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.05■□□□□ 0.8
THBS3-202ENST00000428962 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
THBS3-202ENST00000428962 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.02■□□□□ 0.79
THBS3-202ENST00000428962 MAPKBP1O60336 1514 aa20■□□□□ 0.79
THBS3-202ENST00000428962 NCOA2Q15596 1464 aa20■□□□□ 0.79
THBS3-202ENST00000428962 FBLN2P98095 1184 aa19.99■□□□□ 0.79
THBS3-202ENST00000428962 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.98■□□□□ 0.79
THBS3-202ENST00000428962 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.96■□□□□ 0.79
THBS3-202ENST00000428962 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 ARHGEF11O15085 1522 aa19.95■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 GRIN2AQ12879 1464 aa19.92■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 KIAA0556O60303 1618 aa19.91■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.9■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.89■□□□□ 0.78
THBS3-202ENST00000428962 CHD1O14646 1710 aa19.89■□□□□ 0.77
THBS3-202ENST00000428962 HFM1A2PYH4 1435 aa19.88■□□□□ 0.77
THBS3-202ENST00000428962 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
THBS3-202ENST00000428962 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
THBS3-202ENST00000428962 SYNJ2O15056 1496 aa19.86■□□□□ 0.77
THBS3-202ENST00000428962 DISP1Q96F81 1524 aa19.85■□□□□ 0.77
THBS3-202ENST00000428962 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.84■□□□□ 0.77
THBS3-202ENST00000428962 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 MIA2Q96PC5 1412 aa19.82■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 MIER1Q8N108 512 aa19.81■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.8■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 PTPRKQ15262 1439 aa19.8■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 UACAQ9BZF9 1416 aa19.8■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 NEUROD1Q13562 356 aa19.79■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 NAIPQ13075 1403 aa19.78■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 AKNAQ7Z591 1439 aa19.78■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.78■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.78■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.78■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 CEP170Q5SW79 1584 aa19.77■□□□□ 0.76
THBS3-202ENST00000428962 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.77■□□□□ 0.75
THBS3-202ENST00000428962 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
THBS3-202ENST00000428962 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
THBS3-202ENST00000428962 NUP160Q12769 1436 aa19.73■□□□□ 0.75
THBS3-202ENST00000428962 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.72■□□□□ 0.75
THBS3-202ENST00000428962 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.71■□□□□ 0.75
THBS3-202ENST00000428962 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
THBS3-202ENST00000428962 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.7■□□□□ 0.74
THBS3-202ENST00000428962 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.68■□□□□ 0.74
THBS3-202ENST00000428962 TONSLQ96HA7 1378 aa19.64■□□□□ 0.73
THBS3-202ENST00000428962 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
THBS3-202ENST00000428962 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
THBS3-202ENST00000428962 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.63■□□□□ 0.73
THBS3-202ENST00000428962 ARID3CA6NKF2 412 aa19.63■□□□□ 0.73
THBS3-202ENST00000428962 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
THBS3-202ENST00000428962 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.62■□□□□ 0.73
THBS3-202ENST00000428962 ROCK1Q13464 1354 aa19.62■□□□□ 0.73
THBS3-202ENST00000428962 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
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