RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427786.1

PPP1CB-206, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PPP1CB, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-206ENST00000427786 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.76■■■■□ 3
PPP1CB-206ENST00000427786 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.75■■■□□ 2.99
PPP1CB-206ENST00000427786 JPH4Q96JJ6 628 aa33.73■■■□□ 2.99
PPP1CB-206ENST00000427786 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
PPP1CB-206ENST00000427786 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.55■■■□□ 2.96
PPP1CB-206ENST00000427786 IQGAP2Q13576 1575 aa33.55■■■□□ 2.96
PPP1CB-206ENST00000427786 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.44■■■□□ 2.94
PPP1CB-206ENST00000427786 PRXQ9BXM0 1461 aa33.39■■■□□ 2.94
PPP1CB-206ENST00000427786 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.37■■■□□ 2.93
PPP1CB-206ENST00000427786 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.37■■■□□ 2.93
PPP1CB-206ENST00000427786 DISP1Q96F81 1524 aa33.36■■■□□ 2.93
PPP1CB-206ENST00000427786 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.33■■■□□ 2.93
PPP1CB-206ENST00000427786 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.31■■■□□ 2.92
PPP1CB-206ENST00000427786 MAPKBP1O60336 1514 aa33.31■■■□□ 2.92
PPP1CB-206ENST00000427786 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.29■■■□□ 2.92
PPP1CB-206ENST00000427786 PTPRGP23470 1445 aa33.28■■■□□ 2.92
PPP1CB-206ENST00000427786 KIAA0556O60303 1618 aa33.27■■■□□ 2.92
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.16■■■□□ 2.9
PPP1CB-206ENST00000427786 DIP2BQ9P265 1576 aa33.16■■■□□ 2.9
PPP1CB-206ENST00000427786 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.15■■■□□ 2.9
PPP1CB-206ENST00000427786 EEA1Q15075 1411 aa33.15■■■□□ 2.9
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCC2Q92887 1545 aa33.13■■■□□ 2.89
PPP1CB-206ENST00000427786 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.1■■■□□ 2.89
PPP1CB-206ENST00000427786 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.09■■■□□ 2.89
PPP1CB-206ENST00000427786 UACAQ9BZF9 1416 aa33.09■■■□□ 2.89
PPP1CB-206ENST00000427786 GOLGA3Q08378 1498 aa33.05■■■□□ 2.88
PPP1CB-206ENST00000427786 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
PPP1CB-206ENST00000427786 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33■■■□□ 2.87
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.95■■■□□ 2.87
PPP1CB-206ENST00000427786 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.86
PPP1CB-206ENST00000427786 KIF21BO75037 1637 aa32.94■■■□□ 2.86
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCA8O94911 1581 aa32.93■■■□□ 2.86
PPP1CB-206ENST00000427786 SAMD9Q5K651 1589 aa32.93■■■□□ 2.86
PPP1CB-206ENST00000427786 ASXL2Q76L83 1435 aa32.93■■■□□ 2.86
PPP1CB-206ENST00000427786 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.92■■■□□ 2.86
PPP1CB-206ENST00000427786 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.92■■■□□ 2.86
PPP1CB-206ENST00000427786 GLI2P10070 1586 aa32.87■■■□□ 2.85
PPP1CB-206ENST00000427786 TSPOAP1O95153 1857 aa32.8■■■□□ 2.84
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
PPP1CB-206ENST00000427786 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
PPP1CB-206ENST00000427786 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
PPP1CB-206ENST00000427786 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.73■■■□□ 2.83
PPP1CB-206ENST00000427786 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.72■■■□□ 2.83
PPP1CB-206ENST00000427786 KDM6BO15054 1643 aa32.68■■■□□ 2.82
PPP1CB-206ENST00000427786 P3H3Q8IVL6 736 aa32.66■■■□□ 2.82
PPP1CB-206ENST00000427786 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.65■■■□□ 2.82
PPP1CB-206ENST00000427786 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.64■■■□□ 2.82
PPP1CB-206ENST00000427786 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.6■■■□□ 2.81
PPP1CB-206ENST00000427786 ATP10BO94823 1461 aa32.58■■■□□ 2.81
PPP1CB-206ENST00000427786 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.54■■■□□ 2.8
PPP1CB-206ENST00000427786 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
PPP1CB-206ENST00000427786 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.48■■■□□ 2.79
PPP1CB-206ENST00000427786 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
PPP1CB-206ENST00000427786 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.45■■■□□ 2.78
PPP1CB-206ENST00000427786 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
PPP1CB-206ENST00000427786 ARID3CA6NKF2 412 aa32.41■■■□□ 2.78
PPP1CB-206ENST00000427786 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.41■■■□□ 2.78
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.4■■■□□ 2.78
PPP1CB-206ENST00000427786 CD109Q6YHK3 1445 aa32.39■■■□□ 2.78
PPP1CB-206ENST00000427786 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
PPP1CB-206ENST00000427786 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.36■■■□□ 2.77
PPP1CB-206ENST00000427786 KCNH8Q96L42 1107 aa32.35■■■□□ 2.77
PPP1CB-206ENST00000427786 FMN1Q68DA7 1419 aa32.26■■■□□ 2.76
PPP1CB-206ENST00000427786 HECW1Q76N89 1606 aa32.23■■■□□ 2.75
PPP1CB-206ENST00000427786 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
PPP1CB-206ENST00000427786 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.18■■■□□ 2.74
PPP1CB-206ENST00000427786 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
PPP1CB-206ENST00000427786 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
PPP1CB-206ENST00000427786 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.15■■■□□ 2.74
PPP1CB-206ENST00000427786 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.14■■■□□ 2.741e-15■■□□□ 13.7
PPP1CB-206ENST00000427786 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
PPP1CB-206ENST00000427786 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP1CB-206ENST00000427786 NEO1Q92859 1461 aa32.11■■■□□ 2.73
PPP1CB-206ENST00000427786 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.1■■■□□ 2.73
PPP1CB-206ENST00000427786 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.08■■■□□ 2.73
PPP1CB-206ENST00000427786 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
PPP1CB-206ENST00000427786 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.06■■■□□ 2.72
PPP1CB-206ENST00000427786 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.03■■■□□ 2.72
PPP1CB-206ENST00000427786 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32■■■□□ 2.71
PPP1CB-206ENST00000427786 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32■■■□□ 2.71
PPP1CB-206ENST00000427786 CLIP1P30622 1438 aa31.99■■■□□ 2.71
PPP1CB-206ENST00000427786 ADGRL1O94910 1474 aa31.98■■■□□ 2.71
PPP1CB-206ENST00000427786 KIF14Q15058 1648 aa31.97■■■□□ 2.71
PPP1CB-206ENST00000427786 FANCAO15360 1455 aa31.95■■■□□ 2.7
PPP1CB-206ENST00000427786 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
PPP1CB-206ENST00000427786 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.93■■■□□ 2.7
PPP1CB-206ENST00000427786 RICTORQ6R327 1708 aa31.93■■■□□ 2.7
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.92■■■□□ 2.7
PPP1CB-206ENST00000427786 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
PPP1CB-206ENST00000427786 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.91■■■□□ 2.7
PPP1CB-206ENST00000427786 AKNAQ7Z591 1439 aa31.89■■■□□ 2.7
PPP1CB-206ENST00000427786 PLCH2O75038 1416 aa31.88■■■□□ 2.69
PPP1CB-206ENST00000427786 RAPGEF3O95398 923 aa31.86■■■□□ 2.69
PPP1CB-206ENST00000427786 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
PPP1CB-206ENST00000427786 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
PPP1CB-206ENST00000427786 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.82■■■□□ 2.68
PPP1CB-206ENST00000427786 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.8■■■□□ 2.68
PPP1CB-206ENST00000427786 CEP162Q5TB80 1403 aa31.76■■■□□ 2.68
PPP1CB-206ENST00000427786 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.74■■■□□ 2.67
PPP1CB-206ENST00000427786 PREX2Q70Z35 1606 aa31.74■■■□□ 2.67
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