RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426925.5

SH3BP5-206, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3BP5, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-206ENST00000426925 WDR97A6NE52 1622 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-206ENST00000426925 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-206ENST00000426925 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-206ENST00000426925 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-206ENST00000426925 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-206ENST00000426925 ITGAEP38570 1179 aa23.45■■□□□ 1.35
SH3BP5-206ENST00000426925 TRIM52Q96A61 297 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-206ENST00000426925 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-206ENST00000426925 KIF27Q86VH2 1401 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-206ENST00000426925 TIAM1Q13009 1591 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-206ENST00000426925 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-206ENST00000426925 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-206ENST00000426925 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-206ENST00000426925 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5-206ENST00000426925 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5-206ENST00000426925 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-206ENST00000426925 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.316e-8■□□□□ 10.1
SH3BP5-206ENST00000426925 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-206ENST00000426925 TONSLQ96HA7 1378 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-206ENST00000426925 CUX1P39880 1505 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-206ENST00000426925 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-206ENST00000426925 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-206ENST00000426925 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-206ENST00000426925 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-206ENST00000426925 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SH3BP5-206ENST00000426925 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP5-206ENST00000426925 UACAQ9BZF9 1416 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP5-206ENST00000426925 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP5-206ENST00000426925 IGF1RP08069 1367 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP5-206ENST00000426925 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP5-206ENST00000426925 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-206ENST00000426925 HFM1A2PYH4 1435 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5-206ENST00000426925 HMGXB3Q12766 1538 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5-206ENST00000426925 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5-206ENST00000426925 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-206ENST00000426925 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-206ENST00000426925 NCOA2Q15596 1464 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-206ENST00000426925 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.273e-8■■■■■ 26.9
SH3BP5-206ENST00000426925 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 CFTRP13569 1480 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 NCAPD3P42695 1498 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3BP5-206ENST00000426925 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5-206ENST00000426925 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5-206ENST00000426925 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5-206ENST00000426925 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5-206ENST00000426925 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 30.9
SH3BP5-206ENST00000426925 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5-206ENST00000426925 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5-206ENST00000426925 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP5-206ENST00000426925 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP5-206ENST00000426925 FMN1Q68DA7 1419 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-206ENST00000426925 NBR1Q14596 966 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP5-206ENST00000426925 NAIPQ13075 1403 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP5-206ENST00000426925 PRDM2Q13029 1718 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-206ENST00000426925 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP5-206ENST00000426925 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SH3BP5-206ENST00000426925 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-206ENST00000426925 MRS2Q9HD23 443 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP5-206ENST00000426925 NCOA1Q15788 1441 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-206ENST00000426925 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-206ENST00000426925 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP5-206ENST00000426925 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP5-206ENST00000426925 CCDC7Q96M83 1385 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5-206ENST00000426925 PTPRKQ15262 1439 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP5-206ENST00000426925 CCDC184Q52MB2 194 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP5-206ENST00000426925 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP5-206ENST00000426925 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 USP35Q9P2H5 1018 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 HECW1Q76N89 1606 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 NUDCQ9Y266 331 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 P3H3Q8IVL6 736 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 AKNAQ7Z591 1439 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP5-206ENST00000426925 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-206ENST00000426925 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-206ENST00000426925 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP5-206ENST00000426925 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP5-206ENST00000426925 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5-206ENST00000426925 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP5-206ENST00000426925 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 CUL7Q14999 1698 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5-206ENST00000426925 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms