RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425566.1

RPL23AP87-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 87, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPL23AP87, Length 2,256 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP87-201ENST00000425566 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.14
RPL23AP87-201ENST00000425566 TIAM1Q13009 1591 aa15.89■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.88■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.88■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.87■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.86■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 WDR97A6NE52 1622 aa15.85■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.85■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.84■□□□□ 0.13
RPL23AP87-201ENST00000425566 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.83■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.83■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.82■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 P3H3Q8IVL6 736 aa15.82■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.81■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 MAPKBP1O60336 1514 aa15.8■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 CUL7Q14999 1698 aa15.78■□□□□ 0.12
RPL23AP87-201ENST00000425566 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.75■□□□□ 0.11
RPL23AP87-201ENST00000425566 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.74■□□□□ 0.11
RPL23AP87-201ENST00000425566 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
RPL23AP87-201ENST00000425566 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.74■□□□□ 0.11
RPL23AP87-201ENST00000425566 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
RPL23AP87-201ENST00000425566 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.71■□□□□ 0.11
RPL23AP87-201ENST00000425566 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.69■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 MYT1Q01538 1121 aa15.69■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.69■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.68■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.68■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.67■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 KCNH8Q96L42 1107 aa15.67■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.66■□□□□ 0.1
RPL23AP87-201ENST00000425566 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.64■□□□□ 0.09
RPL23AP87-201ENST00000425566 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
RPL23AP87-201ENST00000425566 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
RPL23AP87-201ENST00000425566 FMN1Q68DA7 1419 aa15.61■□□□□ 0.09
RPL23AP87-201ENST00000425566 PBRM1Q86U86 1689 aa15.61■□□□□ 0.09
RPL23AP87-201ENST00000425566 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.58■□□□□ 0.09
RPL23AP87-201ENST00000425566 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
RPL23AP87-201ENST00000425566 WDR62O43379 1518 aa15.57■□□□□ 0.08
RPL23AP87-201ENST00000425566 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.56■□□□□ 0.08
RPL23AP87-201ENST00000425566 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.55■□□□□ 0.08
RPL23AP87-201ENST00000425566 SAMD9Q5K651 1589 aa15.54■□□□□ 0.08
RPL23AP87-201ENST00000425566 ADAMTS12P58397 1594 aa15.53■□□□□ 0.08
RPL23AP87-201ENST00000425566 TONSLQ96HA7 1378 aa15.52■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.52■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 PTPRKQ15262 1439 aa15.51■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 HFM1A2PYH4 1435 aa15.5■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 ANP32CO43423 234 aa15.5■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 UACAQ9BZF9 1416 aa15.5■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 CCER2I3L3R5 266 aa15.5■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 IFT140Q96RY7 1462 aa15.49■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.49■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 NCOA2Q15596 1464 aa15.48■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.48■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.47■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 GRIN2BQ13224 1484 aa15.47■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.47■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 NAIPQ13075 1403 aa15.46■□□□□ 0.07
RPL23AP87-201ENST00000425566 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 FKBP8Q14318 412 aa15.45■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 ERCC6Q03468 1493 aa15.43■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 BCANQ96GW7 911 aa15.42■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 IQGAP2Q13576 1575 aa15.42■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.42■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 TRIM52Q96A61 297 aa15.41■□□□□ 0.06
RPL23AP87-201ENST00000425566 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.39■□□□□ 0.05
RPL23AP87-201ENST00000425566 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.39■□□□□ 0.05
RPL23AP87-201ENST00000425566 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.38■□□□□ 0.05
RPL23AP87-201ENST00000425566 NEFLP07196 543 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL23AP87-201ENST00000425566 ARHGEF11O15085 1522 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL23AP87-201ENST00000425566 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.37■□□□□ 0.05
RPL23AP87-201ENST00000425566 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.34■□□□□ 0.05
RPL23AP87-201ENST00000425566 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
RPL23AP87-201ENST00000425566 HECW1Q76N89 1606 aa15.31■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 GRIN2AQ12879 1464 aa15.31■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.3■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.29■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.28■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 MIA2Q96PC5 1412 aa15.28■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.28■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 AKNAQ7Z591 1439 aa15.27■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 KIAA0556O60303 1618 aa15.27■□□□□ 0.04
RPL23AP87-201ENST00000425566 KDM6BO15054 1643 aa15.27■□□□□ 0.03
RPL23AP87-201ENST00000425566 ARID3CA6NKF2 412 aa15.27■□□□□ 0.03
RPL23AP87-201ENST00000425566 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.03
RPL23AP87-201ENST00000425566 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
RPL23AP87-201ENST00000425566 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms