RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23■■□□□ 1.27
NISCH-202ENST00000420808 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NISCH-202ENST00000420808 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-202ENST00000420808 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-202ENST00000420808 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NISCH-202ENST00000420808 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.95■■□□□ 1.26
NISCH-202ENST00000420808 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.94■■□□□ 1.26
NISCH-202ENST00000420808 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.9■■□□□ 1.26
NISCH-202ENST00000420808 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NISCH-202ENST00000420808 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.89■■□□□ 1.26
NISCH-202ENST00000420808 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NISCH-202ENST00000420808 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
NISCH-202ENST00000420808 MAP3K1Q13233 1512 aa22.85■■□□□ 1.25
NISCH-202ENST00000420808 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.82■■□□□ 1.24
NISCH-202ENST00000420808 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.81■■□□□ 1.24
NISCH-202ENST00000420808 MAPKBP1O60336 1514 aa22.81■■□□□ 1.24
NISCH-202ENST00000420808 WDR97A6NE52 1622 aa22.77■■□□□ 1.24
NISCH-202ENST00000420808 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-202ENST00000420808 CUL7Q14999 1698 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-202ENST00000420808 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-202ENST00000420808 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.74■■□□□ 1.23
NISCH-202ENST00000420808 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.74■■□□□ 1.23
NISCH-202ENST00000420808 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-202ENST00000420808 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-202ENST00000420808 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-202ENST00000420808 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-202ENST00000420808 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-202ENST00000420808 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.68■■□□□ 1.22
NISCH-202ENST00000420808 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-202ENST00000420808 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.65■■□□□ 1.22
NISCH-202ENST00000420808 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-202ENST00000420808 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 24.7
NISCH-202ENST00000420808 FMN1Q68DA7 1419 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-202ENST00000420808 SAMD9Q5K651 1589 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-202ENST00000420808 PTPRKQ15262 1439 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-202ENST00000420808 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-202ENST00000420808 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-202ENST00000420808 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NISCH-202ENST00000420808 KCNH8Q96L42 1107 aa22.54■■□□□ 1.2
NISCH-202ENST00000420808 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NISCH-202ENST00000420808 GRIN2BQ13224 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
NISCH-202ENST00000420808 ARID3CA6NKF2 412 aa22.51■■□□□ 1.19
NISCH-202ENST00000420808 NCOA2Q15596 1464 aa22.49■■□□□ 1.19
NISCH-202ENST00000420808 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.48■■□□□ 1.19
NISCH-202ENST00000420808 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NISCH-202ENST00000420808 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
NISCH-202ENST00000420808 PBRM1Q86U86 1689 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-202ENST00000420808 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NISCH-202ENST00000420808 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-202ENST00000420808 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-202ENST00000420808 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 HFM1A2PYH4 1435 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 NAIPQ13075 1403 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 ADAMTS12P58397 1594 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.34■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 IQGAP2Q13576 1575 aa22.33■■□□□ 1.17
NISCH-202ENST00000420808 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.32■■□□□ 1.16
NISCH-202ENST00000420808 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NISCH-202ENST00000420808 ARHGEF11O15085 1522 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-202ENST00000420808 UACAQ9BZF9 1416 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-202ENST00000420808 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NISCH-202ENST00000420808 TONSLQ96HA7 1378 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-202ENST00000420808 KDM6BO15054 1643 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-202ENST00000420808 HECW1Q76N89 1606 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-202ENST00000420808 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-202ENST00000420808 WDR62O43379 1518 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-202ENST00000420808 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NISCH-202ENST00000420808 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NISCH-202ENST00000420808 FOXD1Q16676 465 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-202ENST00000420808 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-202ENST00000420808 TRIM52Q96A61 297 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-202ENST00000420808 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-202ENST00000420808 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NISCH-202ENST00000420808 DISP1Q96F81 1524 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-202ENST00000420808 IFT140Q96RY7 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-202ENST00000420808 KIAA0556O60303 1618 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-202ENST00000420808 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NISCH-202ENST00000420808 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-202ENST00000420808 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NISCH-202ENST00000420808 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-202ENST00000420808 GRIN2AQ12879 1464 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-202ENST00000420808 FBLN2P98095 1184 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-202ENST00000420808 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.06■■□□□ 1.12
NISCH-202ENST00000420808 MIA2Q96PC5 1412 aa22.05■■□□□ 1.12
NISCH-202ENST00000420808 ANP32CO43423 234 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-202ENST00000420808 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NISCH-202ENST00000420808 DAPK1P53355 1430 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-202ENST00000420808 ERCC6Q03468 1493 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-202ENST00000420808 ABCC5O15440 1437 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-202ENST00000420808 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-202ENST00000420808 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-202ENST00000420808 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-202ENST00000420808 CEP170Q5SW79 1584 aa21.99■■□□□ 1.11
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