RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418576.3

SEMA3B-202, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SEMA3B, Length 1,765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-202ENST00000418576 GOLGA3Q08378 1498 aa30.25■■■□□ 2.43
SEMA3B-202ENST00000418576 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.24■■■□□ 2.43
SEMA3B-202ENST00000418576 JPH4Q96JJ6 628 aa30.21■■■□□ 2.43
SEMA3B-202ENST00000418576 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
SEMA3B-202ENST00000418576 IQGAP2Q13576 1575 aa30.18■■■□□ 2.42
SEMA3B-202ENST00000418576 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.16■■■□□ 2.42
SEMA3B-202ENST00000418576 SHROOM2Q13796 1616 aa30.12■■■□□ 2.41
SEMA3B-202ENST00000418576 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SEMA3B-202ENST00000418576 ARHGEF11O15085 1522 aa30.08■■■□□ 2.41
SEMA3B-202ENST00000418576 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.02■■■□□ 2.4
SEMA3B-202ENST00000418576 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.01■■■□□ 2.39
SEMA3B-202ENST00000418576 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30■■■□□ 2.39
SEMA3B-202ENST00000418576 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30■■■□□ 2.39
SEMA3B-202ENST00000418576 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30■■■□□ 2.39
SEMA3B-202ENST00000418576 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.96■■■□□ 2.39
SEMA3B-202ENST00000418576 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SEMA3B-202ENST00000418576 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.95■■■□□ 2.39
SEMA3B-202ENST00000418576 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.95■■■□□ 2.39
SEMA3B-202ENST00000418576 DISP1Q96F81 1524 aa29.92■■■□□ 2.38
SEMA3B-202ENST00000418576 KIAA0556O60303 1618 aa29.87■■■□□ 2.37
SEMA3B-202ENST00000418576 ARAP1Q96P48 1450 aa29.85■■■□□ 2.37
SEMA3B-202ENST00000418576 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.85■■■□□ 2.37
SEMA3B-202ENST00000418576 P3H3Q8IVL6 736 aa29.81■■■□□ 2.36
SEMA3B-202ENST00000418576 SAMD9Q5K651 1589 aa29.81■■■□□ 2.36
SEMA3B-202ENST00000418576 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.81■■■□□ 2.36
SEMA3B-202ENST00000418576 PTPRGP23470 1445 aa29.8■■■□□ 2.36
SEMA3B-202ENST00000418576 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
SEMA3B-202ENST00000418576 CLIP1P30622 1438 aa29.72■■■□□ 2.35
SEMA3B-202ENST00000418576 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.71■■■□□ 2.35
SEMA3B-202ENST00000418576 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.69■■■□□ 2.34
SEMA3B-202ENST00000418576 CEP162Q5TB80 1403 aa29.69■■■□□ 2.34
SEMA3B-202ENST00000418576 UACAQ9BZF9 1416 aa29.6■■■□□ 2.33
SEMA3B-202ENST00000418576 FMN1Q68DA7 1419 aa29.57■■■□□ 2.32
SEMA3B-202ENST00000418576 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.55■■■□□ 2.32
SEMA3B-202ENST00000418576 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.53■■■□□ 2.32
SEMA3B-202ENST00000418576 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.32
SEMA3B-202ENST00000418576 ABCC2Q92887 1545 aa29.51■■■□□ 2.31
SEMA3B-202ENST00000418576 ABCA8O94911 1581 aa29.5■■■□□ 2.31
SEMA3B-202ENST00000418576 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.5■■■□□ 2.31
SEMA3B-202ENST00000418576 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.45■■■□□ 2.31
SEMA3B-202ENST00000418576 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
SEMA3B-202ENST00000418576 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.38■■■□□ 2.29
SEMA3B-202ENST00000418576 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.36■■■□□ 2.29
SEMA3B-202ENST00000418576 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SEMA3B-202ENST00000418576 ARID3CA6NKF2 412 aa29.34■■■□□ 2.29
SEMA3B-202ENST00000418576 HECW1Q76N89 1606 aa29.33■■■□□ 2.29
SEMA3B-202ENST00000418576 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
SEMA3B-202ENST00000418576 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
SEMA3B-202ENST00000418576 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.31■■■□□ 2.28
SEMA3B-202ENST00000418576 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.31■■■□□ 2.28
SEMA3B-202ENST00000418576 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SEMA3B-202ENST00000418576 ATP10BO94823 1461 aa29.3■■■□□ 2.28
SEMA3B-202ENST00000418576 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SEMA3B-202ENST00000418576 MAPKBP1O60336 1514 aa29.27■■■□□ 2.28
SEMA3B-202ENST00000418576 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
SEMA3B-202ENST00000418576 ASXL2Q76L83 1435 aa29.22■■■□□ 2.27
SEMA3B-202ENST00000418576 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.21■■■□□ 2.27
SEMA3B-202ENST00000418576 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
SEMA3B-202ENST00000418576 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SEMA3B-202ENST00000418576 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.18■■■□□ 2.26
SEMA3B-202ENST00000418576 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.15■■■□□ 2.26
SEMA3B-202ENST00000418576 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
SEMA3B-202ENST00000418576 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.11■■■□□ 2.25
SEMA3B-202ENST00000418576 APLP2Q06481 763 aa29.09■■■□□ 2.25
SEMA3B-202ENST00000418576 KCNH8Q96L42 1107 aa29.08■■■□□ 2.25
SEMA3B-202ENST00000418576 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.08■■■□□ 2.25
SEMA3B-202ENST00000418576 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.06■■■□□ 2.24
SEMA3B-202ENST00000418576 DIP2BQ9P265 1576 aa29■■■□□ 2.23
SEMA3B-202ENST00000418576 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SEMA3B-202ENST00000418576 MAP3K1Q13233 1512 aa28.99■■■□□ 2.23
SEMA3B-202ENST00000418576 TIAM1Q13009 1591 aa28.98■■■□□ 2.23
SEMA3B-202ENST00000418576 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.98■■■□□ 2.23
SEMA3B-202ENST00000418576 GLI2P10070 1586 aa28.96■■■□□ 2.23
SEMA3B-202ENST00000418576 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.95■■■□□ 2.23
SEMA3B-202ENST00000418576 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.93■■■□□ 2.22
SEMA3B-202ENST00000418576 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.92■■■□□ 2.22
SEMA3B-202ENST00000418576 KIF14Q15058 1648 aa28.89■■■□□ 2.22
SEMA3B-202ENST00000418576 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.89■■■□□ 2.21
SEMA3B-202ENST00000418576 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.88■■■□□ 2.21
SEMA3B-202ENST00000418576 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
SEMA3B-202ENST00000418576 CD109Q6YHK3 1445 aa28.85■■■□□ 2.21
SEMA3B-202ENST00000418576 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.85■■■□□ 2.21
SEMA3B-202ENST00000418576 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
SEMA3B-202ENST00000418576 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.82■■■□□ 2.2
SEMA3B-202ENST00000418576 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.78■■■□□ 2.2
SEMA3B-202ENST00000418576 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SEMA3B-202ENST00000418576 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.74■■■□□ 2.19
SEMA3B-202ENST00000418576 TSPOAP1O95153 1857 aa28.74■■■□□ 2.19
SEMA3B-202ENST00000418576 NCOA2Q15596 1464 aa28.72■■■□□ 2.19
SEMA3B-202ENST00000418576 PLCH2O75038 1416 aa28.72■■■□□ 2.19
SEMA3B-202ENST00000418576 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.72■■■□□ 2.19
SEMA3B-202ENST00000418576 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.68■■■□□ 2.18
SEMA3B-202ENST00000418576 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SEMA3B-202ENST00000418576 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.65■■■□□ 2.18
SEMA3B-202ENST00000418576 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.65■■■□□ 2.18
SEMA3B-202ENST00000418576 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SEMA3B-202ENST00000418576 FANCAO15360 1455 aa28.64■■■□□ 2.17
SEMA3B-202ENST00000418576 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
SEMA3B-202ENST00000418576 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.63■■■□□ 2.17
SEMA3B-202ENST00000418576 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms