RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416506.5

PCBP1-AS1-211, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCBP1-AS1, Length 542 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.03□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.03□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.02□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SMARCA2P51531 1590 aa6.02□□□□□ -1.45
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POTEB2H3BUK9 544 aa6.02□□□□□ -1.45
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.02□□□□□ -1.45
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.01□□□□□ -1.45
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PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HMGXB3Q12766 1538 aa5.98□□□□□ -1.45
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C7P10643 843 aa5.93□□□□□ -1.46
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa5.93□□□□□ -1.46
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SLC39A7Q92504 469 aa5.92□□□□□ -1.46
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5.92□□□□□ -1.46
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 METRNQ9UJH8 293 aa5.91□□□□□ -1.46
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NCAPD3P42695 1498 aa5.89□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PHF12Q96QT6 1004 aa5.87□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 STAG3Q9UJ98 1225 aa5.87□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CDAN1Q8IWY9 1227 aa5.86□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZBTB22O15209 634 aa5.85□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CREBZFQ9NS37 354 aa5.85□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa5.85□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POTEJP0CG39 1038 aa5.84□□□□□ -1.47
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa5.83□□□□□ -1.48
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCDC88BA6NC98 1476 aa5.83□□□□□ -1.48
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MS4A3Q96HJ5 214 aa5.78□□□□□ -1.48
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.77□□□□□ -1.48
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MMRN1Q13201 1228 aa5.75□□□□□ -1.49
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CFTRP13569 1480 aa5.74□□□□□ -1.49
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ABCC8Q09428 1581 aa5.74□□□□□ -1.49
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TOP2BQ02880 1626 aa5.73□□□□□ -1.49
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SEC24BO95487 1268 aa5.72□□□□□ -1.49
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.72□□□□□ -1.49
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SYNJ1O43426 1573 aa5.72□□□□□ -1.49
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 WDR97A6NE52 1622 aa5.71□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NESP48681 1621 aa5.71□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DNMBPQ6XZF7 1577 aa5.71□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CEP164Q9UPV0 1460 aa5.71□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.7□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FANCD2Q9BXW9 1451 aa5.7□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PBRM1Q86U86 1689 aa5.69□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PDS5BQ9NTI5 1447 aa5.68□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ST18O60284 1047 aa5.68□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POTEFA5A3E0 1075 aa5.67□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CUX1P39880 1505 aa5.66□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SLAIN1Q8ND83 568 aa5.66□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ERCC6Q03468 1493 aa5.65□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 WDR62O43379 1518 aa5.65□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TIE1P35590 1138 aa5.65□□□□□ -1.5
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MRC2Q9UBG0 1479 aa5.64□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TOPBP1Q92547 1522 aa5.64□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.64□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KIF12Q96FN5 646 aa5.63□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.63□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SNPHO15079 494 aa5.62□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IER5LQ5T953 404 aa5.62□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FGD5Q6ZNL6 1462 aa5.62□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CUL7Q14999 1698 aa5.62□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa5.61□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TRIM41Q8WV44 630 aa5.6□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KIF21BO75037 1637 aa5.59□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CHD1O14646 1710 aa5.59□□□□□ -1.51
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.58□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TTLL13PA6NNM8 815 aa5.58□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MAP3K13O43283 966 aa5.58□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 EEA1Q15075 1411 aa5.57□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.57□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.57□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TRPC6Q9Y210 931 aa5.56□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PLCG2P16885 1265 aa5.55□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IFT140Q96RY7 1462 aa5.55□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CUX2O14529 1486 aa5.54□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MARVELD3Q96A59 401 aa5.54□□□□□ -1.52
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KIF27Q86VH2 1401 aa5.54□□□□□ -1.52
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