RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410016.5

HOXD3-202, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXD3, Length 2,384 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-202ENST00000410016 NESP48681 1621 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD3-202ENST00000410016 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD3-202ENST00000410016 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD3-202ENST00000410016 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD3-202ENST00000410016 ITGAEP38570 1179 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD3-202ENST00000410016 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD3-202ENST00000410016 P3H3Q8IVL6 736 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD3-202ENST00000410016 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 CUL7Q14999 1698 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD3-202ENST00000410016 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD3-202ENST00000410016 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD3-202ENST00000410016 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
HOXD3-202ENST00000410016 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD3-202ENST00000410016 MAPKBP1O60336 1514 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD3-202ENST00000410016 WDR97A6NE52 1622 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD3-202ENST00000410016 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 FMN1Q68DA7 1419 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD3-202ENST00000410016 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD3-202ENST00000410016 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD3-202ENST00000410016 SAMD9Q5K651 1589 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD3-202ENST00000410016 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD3-202ENST00000410016 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD3-202ENST00000410016 GRIN2BQ13224 1484 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD3-202ENST00000410016 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD3-202ENST00000410016 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD3-202ENST00000410016 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD3-202ENST00000410016 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD3-202ENST00000410016 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD3-202ENST00000410016 PTPRKQ15262 1439 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD3-202ENST00000410016 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXD3-202ENST00000410016 NCOA2Q15596 1464 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD3-202ENST00000410016 HFM1A2PYH4 1435 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD3-202ENST00000410016 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXD3-202ENST00000410016 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXD3-202ENST00000410016 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD3-202ENST00000410016 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD3-202ENST00000410016 ARHGEF11O15085 1522 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD3-202ENST00000410016 NAIPQ13075 1403 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 UACAQ9BZF9 1416 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 PBRM1Q86U86 1689 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 ADAMTS12P58397 1594 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 IQGAP2Q13576 1575 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD3-202ENST00000410016 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HOXD3-202ENST00000410016 KCNH8Q96L42 1107 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXD3-202ENST00000410016 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXD3-202ENST00000410016 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXD3-202ENST00000410016 HECW1Q76N89 1606 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD3-202ENST00000410016 TONSLQ96HA7 1378 aa22.64■■□□□ 1.22
HOXD3-202ENST00000410016 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXD3-202ENST00000410016 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXD3-202ENST00000410016 WDR62O43379 1518 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD3-202ENST00000410016 IFT140Q96RY7 1462 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD3-202ENST00000410016 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD3-202ENST00000410016 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD3-202ENST00000410016 MIA2Q96PC5 1412 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD3-202ENST00000410016 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXD3-202ENST00000410016 AKNAQ7Z591 1439 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD3-202ENST00000410016 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD3-202ENST00000410016 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXD3-202ENST00000410016 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXD3-202ENST00000410016 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXD3-202ENST00000410016 DISP1Q96F81 1524 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXD3-202ENST00000410016 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD3-202ENST00000410016 ARID3CA6NKF2 412 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD3-202ENST00000410016 CCER2I3L3R5 266 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD3-202ENST00000410016 KDM6BO15054 1643 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD3-202ENST00000410016 KIAA0556O60303 1618 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD3-202ENST00000410016 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD3-202ENST00000410016 GRIN2AQ12879 1464 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD3-202ENST00000410016 ANP32CO43423 234 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD3-202ENST00000410016 TRIM52Q96A61 297 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD3-202ENST00000410016 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXD3-202ENST00000410016 ROCK1Q13464 1354 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD3-202ENST00000410016 DAPK1P53355 1430 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD3-202ENST00000410016 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXD3-202ENST00000410016 ABCC5O15440 1437 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD3-202ENST00000410016 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXD3-202ENST00000410016 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD3-202ENST00000410016 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXD3-202ENST00000410016 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXD3-202ENST00000410016 FOXD1Q16676 465 aa22.33■■□□□ 1.16
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