RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32■■■□□ 2.71
C10orf55-201ENST00000409178 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.99■■■□□ 2.71
C10orf55-201ENST00000409178 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
C10orf55-201ENST00000409178 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
C10orf55-201ENST00000409178 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
C10orf55-201ENST00000409178 WDR97A6NE52 1622 aa31.98■■■□□ 2.71
C10orf55-201ENST00000409178 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.97■■■□□ 2.71
C10orf55-201ENST00000409178 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
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C10orf55-201ENST00000409178 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.91■■■□□ 2.7
C10orf55-201ENST00000409178 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.89■■■□□ 2.69
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C10orf55-201ENST00000409178 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.88■■■□□ 2.69
C10orf55-201ENST00000409178 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.88■■■□□ 2.69
C10orf55-201ENST00000409178 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.88■■■□□ 2.69
C10orf55-201ENST00000409178 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.85■■■□□ 2.69
C10orf55-201ENST00000409178 NEUROD1Q13562 356 aa31.83■■■□□ 2.69
C10orf55-201ENST00000409178 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.82■■■□□ 2.68
C10orf55-201ENST00000409178 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
C10orf55-201ENST00000409178 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.8■■■□□ 2.68
C10orf55-201ENST00000409178 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.77■■■□□ 2.68
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C10orf55-201ENST00000409178 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.75■■■□□ 2.67
C10orf55-201ENST00000409178 MIER1Q8N108 512 aa31.7■■■□□ 2.67
C10orf55-201ENST00000409178 FMN1Q68DA7 1419 aa31.7■■■□□ 2.66
C10orf55-201ENST00000409178 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
C10orf55-201ENST00000409178 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.68■■■□□ 2.66
C10orf55-201ENST00000409178 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.65■■■□□ 2.66
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C10orf55-201ENST00000409178 SAMD9Q5K651 1589 aa31.65■■■□□ 2.66
C10orf55-201ENST00000409178 MAPKBP1O60336 1514 aa31.6■■■□□ 2.65
C10orf55-201ENST00000409178 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
C10orf55-201ENST00000409178 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.52■■■□□ 2.64
C10orf55-201ENST00000409178 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.52■■■□□ 2.64
C10orf55-201ENST00000409178 GRIN2BQ13224 1484 aa31.51■■■□□ 2.63
C10orf55-201ENST00000409178 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.5■■■□□ 2.63
C10orf55-201ENST00000409178 PBRM1Q86U86 1689 aa31.49■■■□□ 2.63
C10orf55-201ENST00000409178 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.48■■■□□ 2.63
C10orf55-201ENST00000409178 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.45■■■□□ 2.63
C10orf55-201ENST00000409178 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.43■■■□□ 2.62
C10orf55-201ENST00000409178 ADAMTS12P58397 1594 aa31.41■■■□□ 2.62
C10orf55-201ENST00000409178 NCOA2Q15596 1464 aa31.38■■■□□ 2.61
C10orf55-201ENST00000409178 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.38■■■□□ 2.61
C10orf55-201ENST00000409178 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
C10orf55-201ENST00000409178 IQGAP2Q13576 1575 aa31.34■■■□□ 2.61
C10orf55-201ENST00000409178 PTPRKQ15262 1439 aa31.33■■■□□ 2.61
C10orf55-201ENST00000409178 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.31■■■□□ 2.6
C10orf55-201ENST00000409178 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.31■■■□□ 2.6
C10orf55-201ENST00000409178 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.3■■■□□ 2.6
C10orf55-201ENST00000409178 IFT140Q96RY7 1462 aa31.28■■■□□ 2.6
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C10orf55-201ENST00000409178 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.23■■■□□ 2.59
C10orf55-201ENST00000409178 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.22■■■□□ 2.59
C10orf55-201ENST00000409178 HECW1Q76N89 1606 aa31.21■■■□□ 2.59
C10orf55-201ENST00000409178 HFM1A2PYH4 1435 aa31.2■■■□□ 2.59
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C10orf55-201ENST00000409178 ARHGEF11O15085 1522 aa31.2■■■□□ 2.58
C10orf55-201ENST00000409178 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
C10orf55-201ENST00000409178 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
C10orf55-201ENST00000409178 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.16■■■□□ 2.58
C10orf55-201ENST00000409178 NAIPQ13075 1403 aa31.13■■■□□ 2.57
C10orf55-201ENST00000409178 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
C10orf55-201ENST00000409178 UACAQ9BZF9 1416 aa31.08■■■□□ 2.57
C10orf55-201ENST00000409178 ERCC6Q03468 1493 aa31.08■■■□□ 2.57
C10orf55-201ENST00000409178 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.07■■■□□ 2.56
C10orf55-201ENST00000409178 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.06■■■□□ 2.56
C10orf55-201ENST00000409178 DISP1Q96F81 1524 aa31.05■■■□□ 2.56
C10orf55-201ENST00000409178 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.04■■■□□ 2.56
C10orf55-201ENST00000409178 GRIN2AQ12879 1464 aa31.04■■■□□ 2.56
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C10orf55-201ENST00000409178 KIAA0556O60303 1618 aa31.02■■■□□ 2.56
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C10orf55-201ENST00000409178 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
C10orf55-201ENST00000409178 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
C10orf55-201ENST00000409178 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
C10orf55-201ENST00000409178 KDM6BO15054 1643 aa30.87■■■□□ 2.53
C10orf55-201ENST00000409178 FBLN2P98095 1184 aa30.86■■■□□ 2.53
C10orf55-201ENST00000409178 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.86■■■□□ 2.53
C10orf55-201ENST00000409178 CEP170Q5SW79 1584 aa30.86■■■□□ 2.53
C10orf55-201ENST00000409178 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.86■■■□□ 2.53
C10orf55-201ENST00000409178 KCNH8Q96L42 1107 aa30.84■■■□□ 2.53
C10orf55-201ENST00000409178 SYNJ2O15056 1496 aa30.83■■■□□ 2.53
C10orf55-201ENST00000409178 TRIM52Q96A61 297 aa30.82■■■□□ 2.52
C10orf55-201ENST00000409178 AKNAQ7Z591 1439 aa30.82■■■□□ 2.52
C10orf55-201ENST00000409178 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
C10orf55-201ENST00000409178 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.76■■■□□ 2.51
C10orf55-201ENST00000409178 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.76■■■□□ 2.51
C10orf55-201ENST00000409178 DAPK1P53355 1430 aa30.74■■■□□ 2.51
C10orf55-201ENST00000409178 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
C10orf55-201ENST00000409178 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
C10orf55-201ENST00000409178 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
C10orf55-201ENST00000409178 ABCC5O15440 1437 aa30.71■■■□□ 2.51
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