RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393893.5

CORO1B-202, Transcript of coronin 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CORO1B, Length 1,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO1B-202ENST00000393893 TOPBP1Q92547 1522 aa28.99■■■□□ 2.23
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CORO1B-202ENST00000393893 TIAM1Q13009 1591 aa28.92■■■□□ 2.22
CORO1B-202ENST00000393893 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.91■■■□□ 2.22
CORO1B-202ENST00000393893 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.88■■■□□ 2.21
CORO1B-202ENST00000393893 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CORO1B-202ENST00000393893 MYT1Q01538 1121 aa28.8■■■□□ 2.2
CORO1B-202ENST00000393893 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.79■■■□□ 2.2
CORO1B-202ENST00000393893 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.79■■■□□ 2.2
CORO1B-202ENST00000393893 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.77■■■□□ 2.2
CORO1B-202ENST00000393893 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.77■■■□□ 2.2
CORO1B-202ENST00000393893 WDR62O43379 1518 aa28.75■■■□□ 2.19
CORO1B-202ENST00000393893 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.74■■■□□ 2.19
CORO1B-202ENST00000393893 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CORO1B-202ENST00000393893 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.72■■■□□ 2.19
CORO1B-202ENST00000393893 MAPKBP1O60336 1514 aa28.71■■■□□ 2.19
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CORO1B-202ENST00000393893 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.65■■■□□ 2.18
CORO1B-202ENST00000393893 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.63■■■□□ 2.17
CORO1B-202ENST00000393893 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.61■■■□□ 2.17
CORO1B-202ENST00000393893 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.61■■■□□ 2.17
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CORO1B-202ENST00000393893 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CORO1B-202ENST00000393893 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.179e-7■■■■□ 25.3
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CORO1B-202ENST00000393893 WDR97A6NE52 1622 aa28.57■■■□□ 2.16
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CORO1B-202ENST00000393893 CUL7Q14999 1698 aa28.54■■■□□ 2.16
CORO1B-202ENST00000393893 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.53■■■□□ 2.16
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CORO1B-202ENST00000393893 IFT140Q96RY7 1462 aa28.51■■■□□ 2.15
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CORO1B-202ENST00000393893 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.46■■■□□ 2.15
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CORO1B-202ENST00000393893 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.43■■■□□ 2.14
CORO1B-202ENST00000393893 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.43■■■□□ 2.14
CORO1B-202ENST00000393893 FMN1Q68DA7 1419 aa28.4■■■□□ 2.14
CORO1B-202ENST00000393893 P3H3Q8IVL6 736 aa28.4■■■□□ 2.14
CORO1B-202ENST00000393893 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CORO1B-202ENST00000393893 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.35■■■□□ 2.13
CORO1B-202ENST00000393893 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CORO1B-202ENST00000393893 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CORO1B-202ENST00000393893 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.31■■■□□ 2.12
CORO1B-202ENST00000393893 PBRM1Q86U86 1689 aa28.29■■■□□ 2.12
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CORO1B-202ENST00000393893 SAMD9Q5K651 1589 aa28.25■■■□□ 2.11
CORO1B-202ENST00000393893 GRIN2BQ13224 1484 aa28.24■■■□□ 2.11
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CORO1B-202ENST00000393893 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.2■■■□□ 2.1
CORO1B-202ENST00000393893 KCNH8Q96L42 1107 aa28.19■■■□□ 2.1
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CORO1B-202ENST00000393893 NCOA2Q15596 1464 aa28.11■■■□□ 2.09
CORO1B-202ENST00000393893 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.1■■■□□ 2.09
CORO1B-202ENST00000393893 ADAMTS12P58397 1594 aa28.1■■■□□ 2.09
CORO1B-202ENST00000393893 PTPRKQ15262 1439 aa28.09■■■□□ 2.09
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CORO1B-202ENST00000393893 ARHGEF11O15085 1522 aa28.03■■■□□ 2.08
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CORO1B-202ENST00000393893 IQGAP2Q13576 1575 aa27.78■■■□□ 2.04
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CORO1B-202ENST00000393893 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CORO1B-202ENST00000393893 CHD1O14646 1710 aa27.73■■■□□ 2.03
CORO1B-202ENST00000393893 BCANQ96GW7 911 aa27.73■■■□□ 2.03
CORO1B-202ENST00000393893 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.73■■■□□ 2.03
CORO1B-202ENST00000393893 CEP170Q5SW79 1584 aa27.73■■■□□ 2.03
CORO1B-202ENST00000393893 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.7■■■□□ 2.02
CORO1B-202ENST00000393893 NUP160Q12769 1436 aa27.68■■■□□ 2.02
CORO1B-202ENST00000393893 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CORO1B-202ENST00000393893 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.67■■■□□ 2.02
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CORO1B-202ENST00000393893 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.66■■■□□ 2.02
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