RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393261.7

FBXW9-201, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXW9, Length 1,738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW9-201ENST00000393261 CLIP1P30622 1438 aa26.2■■□□□ 1.79
FBXW9-201ENST00000393261 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
FBXW9-201ENST00000393261 CHD1O14646 1710 aa26.13■■□□□ 1.77
FBXW9-201ENST00000393261 IQGAP2Q13576 1575 aa26.09■■□□□ 1.77
FBXW9-201ENST00000393261 CEP170Q5SW79 1584 aa26.08■■□□□ 1.77
FBXW9-201ENST00000393261 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.07■■□□□ 1.76
FBXW9-201ENST00000393261 NUP160Q12769 1436 aa26.07■■□□□ 1.76
FBXW9-201ENST00000393261 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.02■■□□□ 1.76
FBXW9-201ENST00000393261 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.02■■□□□ 1.76
FBXW9-201ENST00000393261 ARAP1Q96P48 1450 aa25.96■■□□□ 1.75
FBXW9-201ENST00000393261 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.94■■□□□ 1.74
FBXW9-201ENST00000393261 SAMD9Q5K651 1589 aa25.94■■□□□ 1.74
FBXW9-201ENST00000393261 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.92■■□□□ 1.74
FBXW9-201ENST00000393261 P3H3Q8IVL6 736 aa25.88■■□□□ 1.73
FBXW9-201ENST00000393261 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.87■■□□□ 1.73
FBXW9-201ENST00000393261 JPH4Q96JJ6 628 aa25.84■■□□□ 1.73
FBXW9-201ENST00000393261 KIAA0556O60303 1618 aa25.82■■□□□ 1.72
FBXW9-201ENST00000393261 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.81■■□□□ 1.72
FBXW9-201ENST00000393261 DISP1Q96F81 1524 aa25.8■■□□□ 1.72
FBXW9-201ENST00000393261 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.8■■□□□ 1.72
FBXW9-201ENST00000393261 FMN1Q68DA7 1419 aa25.78■■□□□ 1.72
FBXW9-201ENST00000393261 SHROOM2Q13796 1616 aa25.76■■□□□ 1.71
FBXW9-201ENST00000393261 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
FBXW9-201ENST00000393261 OSCARQ8IYS5 282 aa25.73■■□□□ 1.71
FBXW9-201ENST00000393261 APLP2Q06481 763 aa25.71■■□□□ 1.71
FBXW9-201ENST00000393261 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
FBXW9-201ENST00000393261 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.67■■□□□ 1.7
FBXW9-201ENST00000393261 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.66■■□□□ 1.7
FBXW9-201ENST00000393261 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
FBXW9-201ENST00000393261 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
FBXW9-201ENST00000393261 HECW1Q76N89 1606 aa25.56■■□□□ 1.68
FBXW9-201ENST00000393261 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.56■■□□□ 1.68
FBXW9-201ENST00000393261 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
FBXW9-201ENST00000393261 PTPRGP23470 1445 aa25.54■■□□□ 1.68
FBXW9-201ENST00000393261 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.53■■□□□ 1.68
FBXW9-201ENST00000393261 MAP3K1Q13233 1512 aa25.53■■□□□ 1.68
FBXW9-201ENST00000393261 TIAM1Q13009 1591 aa25.52■■□□□ 1.68
FBXW9-201ENST00000393261 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.51■■□□□ 1.68
FBXW9-201ENST00000393261 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.48■■□□□ 1.67
FBXW9-201ENST00000393261 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.48■■□□□ 1.67
FBXW9-201ENST00000393261 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.46■■□□□ 1.67
FBXW9-201ENST00000393261 ABCA8O94911 1581 aa25.45■■□□□ 1.67
FBXW9-201ENST00000393261 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
FBXW9-201ENST00000393261 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
FBXW9-201ENST00000393261 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
FBXW9-201ENST00000393261 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.39■■□□□ 1.66
FBXW9-201ENST00000393261 UACAQ9BZF9 1416 aa25.39■■□□□ 1.65
FBXW9-201ENST00000393261 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
FBXW9-201ENST00000393261 ARID3CA6NKF2 412 aa25.37■■□□□ 1.65
FBXW9-201ENST00000393261 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.34■■□□□ 1.65
FBXW9-201ENST00000393261 ABCC2Q92887 1545 aa25.34■■□□□ 1.65
FBXW9-201ENST00000393261 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
FBXW9-201ENST00000393261 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
FBXW9-201ENST00000393261 ARHGEF11O15085 1522 aa25.32■■□□□ 1.64
FBXW9-201ENST00000393261 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
FBXW9-201ENST00000393261 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.31■■□□□ 1.64
FBXW9-201ENST00000393261 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
FBXW9-201ENST00000393261 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.28■■□□□ 1.64
FBXW9-201ENST00000393261 ATP10BO94823 1461 aa25.26■■□□□ 1.63
FBXW9-201ENST00000393261 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.24■■□□□ 1.63
FBXW9-201ENST00000393261 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FBXW9-201ENST00000393261 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.22■■□□□ 1.63
FBXW9-201ENST00000393261 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.22■■□□□ 1.63
FBXW9-201ENST00000393261 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.22■■□□□ 1.63
FBXW9-201ENST00000393261 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.2■■□□□ 1.62
FBXW9-201ENST00000393261 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.18■■□□□ 1.62
FBXW9-201ENST00000393261 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
FBXW9-201ENST00000393261 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.16■■□□□ 1.62
FBXW9-201ENST00000393261 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.16■■□□□ 1.62
FBXW9-201ENST00000393261 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FBXW9-201ENST00000393261 NCOA2Q15596 1464 aa25.15■■□□□ 1.62
FBXW9-201ENST00000393261 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.12■■□□□ 1.61
FBXW9-201ENST00000393261 KIF14Q15058 1648 aa25.08■■□□□ 1.6
FBXW9-201ENST00000393261 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
FBXW9-201ENST00000393261 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
FBXW9-201ENST00000393261 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.06■■□□□ 1.6
FBXW9-201ENST00000393261 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.04■■□□□ 1.6
FBXW9-201ENST00000393261 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.03■■□□□ 1.6
FBXW9-201ENST00000393261 FGD6Q6ZV73 1430 aa25■■□□□ 1.59
FBXW9-201ENST00000393261 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.97■■□□□ 1.59
FBXW9-201ENST00000393261 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.96■■□□□ 1.59
FBXW9-201ENST00000393261 ASXL2Q76L83 1435 aa24.94■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.94■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 MIA2Q96PC5 1412 aa24.93■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 KCNH8Q96L42 1107 aa24.92■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.91■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXW9-201ENST00000393261 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXW9-201ENST00000393261 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FBXW9-201ENST00000393261 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FBXW9-201ENST00000393261 MAPKBP1O60336 1514 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXW9-201ENST00000393261 PREX2Q70Z35 1606 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXW9-201ENST00000393261 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXW9-201ENST00000393261 ITGAEP38570 1179 aa24.81■■□□□ 1.56
FBXW9-201ENST00000393261 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.79■■□□□ 1.56
FBXW9-201ENST00000393261 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.78■■□□□ 1.56
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