RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.77■□□□□ 0.92
ZBED1-202ENST00000381222 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
ZBED1-202ENST00000381222 ERCC6Q03468 1493 aa20.76■□□□□ 0.91
ZBED1-202ENST00000381222 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ZBED1-202ENST00000381222 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.71■□□□□ 0.91
ZBED1-202ENST00000381222 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
ZBED1-202ENST00000381222 TSPY4P0CV99 314 aa20.69■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 TSPY10P0CW01 314 aa20.69■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.68■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 FOXD1Q16676 465 aa20.68■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.67■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.66■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 RGL3Q3MIN7 710 aa20.65■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.65■□□□□ 0.9
ZBED1-202ENST00000381222 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
ZBED1-202ENST00000381222 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.59■□□□□ 0.89
ZBED1-202ENST00000381222 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.57■□□□□ 0.88
ZBED1-202ENST00000381222 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED1-202ENST00000381222 FKBP8Q14318 412 aa20.55■□□□□ 0.88
ZBED1-202ENST00000381222 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
ZBED1-202ENST00000381222 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ZBED1-202ENST00000381222 IGF1RP08069 1367 aa20.53■□□□□ 0.88
ZBED1-202ENST00000381222 NESP48681 1621 aa20.52■□□□□ 0.88
ZBED1-202ENST00000381222 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.5■□□□□ 0.87
ZBED1-202ENST00000381222 SYNJ1O43426 1573 aa20.5■□□□□ 0.87
ZBED1-202ENST00000381222 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.48■□□□□ 0.87
ZBED1-202ENST00000381222 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.48■□□□□ 0.87
ZBED1-202ENST00000381222 NCAPD3P42695 1498 aa20.48■□□□□ 0.87
ZBED1-202ENST00000381222 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.48■□□□□ 0.87
ZBED1-202ENST00000381222 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
ZBED1-202ENST00000381222 MRS2Q9HD23 443 aa20.42■□□□□ 0.86
ZBED1-202ENST00000381222 BCL11AQ9H165 835 aa20.41■□□□□ 0.86
ZBED1-202ENST00000381222 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.37■□□□□ 0.85
ZBED1-202ENST00000381222 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.35■□□□□ 0.85
ZBED1-202ENST00000381222 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
ZBED1-202ENST00000381222 JPH4Q96JJ6 628 aa20.32■□□□□ 0.84
ZBED1-202ENST00000381222 TMC1Q8TDI8 760 aa20.32■□□□□ 0.84
ZBED1-202ENST00000381222 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.31■□□□□ 0.84
ZBED1-202ENST00000381222 CFTRP13569 1480 aa20.29■□□□□ 0.84
ZBED1-202ENST00000381222 ARAP1Q96P48 1450 aa20.28■□□□□ 0.84
ZBED1-202ENST00000381222 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
ZBED1-202ENST00000381222 KIF21BO75037 1637 aa20.27■□□□□ 0.84
ZBED1-202ENST00000381222 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.27■□□□□ 0.84
ZBED1-202ENST00000381222 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.26■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 FMN1Q68DA7 1419 aa20.26■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 PKD2Q13563 968 aa20.26■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.26■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 CUX1P39880 1505 aa20.25■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.24■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.23■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.21■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.21■□□□□ 0.83
ZBED1-202ENST00000381222 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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ZBED1-202ENST00000381222 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED1-202ENST00000381222 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED1-202ENST00000381222 SLC24A1O60721 1099 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED1-202ENST00000381222 PLEKHG5O94827 1062 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED1-202ENST00000381222 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ZBED1-202ENST00000381222 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ZBED1-202ENST00000381222 PRXQ9BXM0 1461 aa20.11■□□□□ 0.81
ZBED1-202ENST00000381222 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ZBED1-202ENST00000381222 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.09■□□□□ 0.81
ZBED1-202ENST00000381222 NUP155O75694 1391 aa20.09■□□□□ 0.81
ZBED1-202ENST00000381222 GGT6Q6P531 493 aa20.09■□□□□ 0.81
ZBED1-202ENST00000381222 MLECQ14165 292 aa20.08■□□□□ 0.81
ZBED1-202ENST00000381222 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
ZBED1-202ENST00000381222 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
ZBED1-202ENST00000381222 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ZBED1-202ENST00000381222 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ZBED1-202ENST00000381222 TOP2BQ02880 1626 aa20.06■□□□□ 0.8
ZBED1-202ENST00000381222 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
ZBED1-202ENST00000381222 TOPBP1Q92547 1522 aa20.03■□□□□ 0.8
ZBED1-202ENST00000381222 HMGXB3Q12766 1538 aa20■□□□□ 0.79
ZBED1-202ENST00000381222 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ZBED1-202ENST00000381222 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
ZBED1-202ENST00000381222 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ZBED1-202ENST00000381222 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.97■□□□□ 0.79
ZBED1-202ENST00000381222 NEUROD2Q15784 382 aa19.97■□□□□ 0.79
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.96■□□□□ 0.79
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ZBED1-202ENST00000381222 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.93■□□□□ 0.78
ZBED1-202ENST00000381222 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.92■□□□□ 0.78
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ZBED1-202ENST00000381222 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.9■□□□□ 0.78
ZBED1-202ENST00000381222 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.9■□□□□ 0.78
ZBED1-202ENST00000381222 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.9■□□□□ 0.78
ZBED1-202ENST00000381222 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.88■□□□□ 0.77
ZBED1-202ENST00000381222 STK26Q9P289 416 aa19.87■□□□□ 0.77
ZBED1-202ENST00000381222 NEFMP07197 916 aa19.86■□□□□ 0.77
ZBED1-202ENST00000381222 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.86■□□□□ 0.77
ZBED1-202ENST00000381222 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.85■□□□□ 0.77
ZBED1-202ENST00000381222 NCOA2Q15596 1464 aa19.84■□□□□ 0.77
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