RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377242.7

PLXDC2-202, Transcript of plexin domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLXDC2, Length 2,822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC2-202ENST00000377242 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PLXDC2-202ENST00000377242 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.89■■□□□ 1.57
PLXDC2-202ENST00000377242 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PLXDC2-202ENST00000377242 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.85■■□□□ 1.57
PLXDC2-202ENST00000377242 MAP3K1Q13233 1512 aa24.85■■□□□ 1.57
PLXDC2-202ENST00000377242 TIAM1Q13009 1591 aa24.83■■□□□ 1.57
PLXDC2-202ENST00000377242 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.83■■□□□ 1.57
PLXDC2-202ENST00000377242 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.83■■□□□ 1.57
PLXDC2-202ENST00000377242 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PLXDC2-202ENST00000377242 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PLXDC2-202ENST00000377242 IFT140Q96RY7 1462 aa24.8■■□□□ 1.56
PLXDC2-202ENST00000377242 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PLXDC2-202ENST00000377242 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.76■■□□□ 1.55
PLXDC2-202ENST00000377242 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.73■■□□□ 1.55
PLXDC2-202ENST00000377242 CUL7Q14999 1698 aa24.73■■□□□ 1.55
PLXDC2-202ENST00000377242 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PLXDC2-202ENST00000377242 ITGAEP38570 1179 aa24.69■■□□□ 1.54
PLXDC2-202ENST00000377242 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.68■■□□□ 1.54
PLXDC2-202ENST00000377242 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PLXDC2-202ENST00000377242 P3H3Q8IVL6 736 aa24.67■■□□□ 1.54
PLXDC2-202ENST00000377242 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.66■■□□□ 1.54
PLXDC2-202ENST00000377242 MIER1Q8N108 512 aa24.65■■□□□ 1.54
PLXDC2-202ENST00000377242 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.65■■□□□ 1.54
PLXDC2-202ENST00000377242 WDR97A6NE52 1622 aa24.64■■□□□ 1.53
PLXDC2-202ENST00000377242 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PLXDC2-202ENST00000377242 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.63■■□□□ 1.53
PLXDC2-202ENST00000377242 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.61■■□□□ 1.53
PLXDC2-202ENST00000377242 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.59■■□□□ 1.53
PLXDC2-202ENST00000377242 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PLXDC2-202ENST00000377242 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.58■■□□□ 1.53
PLXDC2-202ENST00000377242 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
PLXDC2-202ENST00000377242 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.56■■□□□ 1.52
PLXDC2-202ENST00000377242 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.54■■□□□ 1.52
PLXDC2-202ENST00000377242 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.53■■□□□ 1.52
PLXDC2-202ENST00000377242 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PLXDC2-202ENST00000377242 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PLXDC2-202ENST00000377242 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PLXDC2-202ENST00000377242 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.5■■□□□ 1.51
PLXDC2-202ENST00000377242 FMN1Q68DA7 1419 aa24.49■■□□□ 1.51
PLXDC2-202ENST00000377242 MAPKBP1O60336 1514 aa24.46■■□□□ 1.51
PLXDC2-202ENST00000377242 SAMD9Q5K651 1589 aa24.42■■□□□ 1.5
PLXDC2-202ENST00000377242 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.42■■□□□ 1.5
PLXDC2-202ENST00000377242 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
PLXDC2-202ENST00000377242 GRIN2BQ13224 1484 aa24.39■■□□□ 1.49
PLXDC2-202ENST00000377242 PBRM1Q86U86 1689 aa24.39■■□□□ 1.49
PLXDC2-202ENST00000377242 BCL11AQ9H165 835 aa24.37■■□□□ 1.49
PLXDC2-202ENST00000377242 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.32■■□□□ 1.48
PLXDC2-202ENST00000377242 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.32■■□□□ 1.48
PLXDC2-202ENST00000377242 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.32■■□□□ 1.48
PLXDC2-202ENST00000377242 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PLXDC2-202ENST00000377242 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.31■■□□□ 1.48
PLXDC2-202ENST00000377242 CHD1O14646 1710 aa24.28■■□□□ 1.48
PLXDC2-202ENST00000377242 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.25■■□□□ 1.47
PLXDC2-202ENST00000377242 SYNJ2O15056 1496 aa24.22■■□□□ 1.47
PLXDC2-202ENST00000377242 NCOA2Q15596 1464 aa24.22■■□□□ 1.47
PLXDC2-202ENST00000377242 ADAMTS12P58397 1594 aa24.21■■□□□ 1.47
PLXDC2-202ENST00000377242 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PLXDC2-202ENST00000377242 OSCARQ8IYS5 282 aa24.2■■□□□ 1.47
PLXDC2-202ENST00000377242 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.2■■□□□ 1.47
PLXDC2-202ENST00000377242 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.2■■□□□ 1.46
PLXDC2-202ENST00000377242 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.19■■□□□ 1.46
PLXDC2-202ENST00000377242 IQGAP2Q13576 1575 aa24.15■■□□□ 1.46
PLXDC2-202ENST00000377242 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.15■■□□□ 1.46
PLXDC2-202ENST00000377242 HFM1A2PYH4 1435 aa24.14■■□□□ 1.46
PLXDC2-202ENST00000377242 PTPRKQ15262 1439 aa24.14■■□□□ 1.46
PLXDC2-202ENST00000377242 FBLN2P98095 1184 aa24.14■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.12■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.12■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 HECW1Q76N89 1606 aa24.12■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 ARHGEF11O15085 1522 aa24.1■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.1■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 GRIN2AQ12879 1464 aa24.09■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 UACAQ9BZF9 1416 aa24.08■■□□□ 1.45
PLXDC2-202ENST00000377242 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PLXDC2-202ENST00000377242 NAIPQ13075 1403 aa24.06■■□□□ 1.44
PLXDC2-202ENST00000377242 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.05■■□□□ 1.44
PLXDC2-202ENST00000377242 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PLXDC2-202ENST00000377242 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PLXDC2-202ENST00000377242 CEP170Q5SW79 1584 aa24■■□□□ 1.43
PLXDC2-202ENST00000377242 NUP160Q12769 1436 aa24■■□□□ 1.43
PLXDC2-202ENST00000377242 TONSLQ96HA7 1378 aa24■■□□□ 1.43
PLXDC2-202ENST00000377242 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PLXDC2-202ENST00000377242 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PLXDC2-202ENST00000377242 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.95■■□□□ 1.42
PLXDC2-202ENST00000377242 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.93■■□□□ 1.42
PLXDC2-202ENST00000377242 MIA2Q96PC5 1412 aa23.92■■□□□ 1.42
PLXDC2-202ENST00000377242 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.92■■□□□ 1.42
PLXDC2-202ENST00000377242 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.91■■□□□ 1.42
PLXDC2-202ENST00000377242 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.9■■□□□ 1.42
PLXDC2-202ENST00000377242 AKNAQ7Z591 1439 aa23.89■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.89■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.89■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 KIAA0556O60303 1618 aa23.89■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.89■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 ARID3CA6NKF2 412 aa23.88■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 DISP1Q96F81 1524 aa23.87■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 KCNH8Q96L42 1107 aa23.87■■□□□ 1.41
PLXDC2-202ENST00000377242 SHROOM2Q13796 1616 aa23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms