RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376557.3

PRR3-201, Transcript of proline rich 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRR3, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR3-201ENST00000376557 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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PRR3-201ENST00000376557 ATP10BO94823 1461 aa20.51■□□□□ 0.87
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PRR3-201ENST00000376557 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.27■□□□□ 0.84
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PRR3-201ENST00000376557 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PRR3-201ENST00000376557 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PRR3-201ENST00000376557 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PRR3-201ENST00000376557 MIA2Q96PC5 1412 aa20.25■□□□□ 0.83
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PRR3-201ENST00000376557 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.24■□□□□ 0.83
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PRR3-201ENST00000376557 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.24■□□□□ 0.83
PRR3-201ENST00000376557 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PRR3-201ENST00000376557 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PRR3-201ENST00000376557 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PRR3-201ENST00000376557 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.2■□□□□ 0.82
PRR3-201ENST00000376557 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.19■□□□□ 0.82
PRR3-201ENST00000376557 PTPRKQ15262 1439 aa20.19■□□□□ 0.82
PRR3-201ENST00000376557 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
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