RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375370.9

TFDP1-201, Transcript of transcription factor Dp-1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TFDP1, Length 2,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP1-201ENST00000375370 CUL7Q14999 1698 aa21.62■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.61■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.6■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.59■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.58■■□□□ 1.05
TFDP1-201ENST00000375370 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.57■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.56■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 NEUROD1Q13562 356 aa21.55■■□□□ 1.04
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TFDP1-201ENST00000375370 P3H3Q8IVL6 736 aa21.54■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.54■■□□□ 1.04
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TFDP1-201ENST00000375370 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.53■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.53■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.52■■□□□ 1.04
TFDP1-201ENST00000375370 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TFDP1-201ENST00000375370 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.47■■□□□ 1.03
TFDP1-201ENST00000375370 ITGAEP38570 1179 aa21.47■■□□□ 1.03
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TFDP1-201ENST00000375370 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.44■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.44■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 MIER1Q8N108 512 aa21.42■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 SAMD9Q5K651 1589 aa21.41■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.4■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 MAPKBP1O60336 1514 aa21.4■■□□□ 1.02
TFDP1-201ENST00000375370 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.37■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.36■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 IFT140Q96RY7 1462 aa21.35■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 FMN1Q68DA7 1419 aa21.35■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 ERCC6Q03468 1493 aa21.35■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 PBRM1Q86U86 1689 aa21.34■■□□□ 1.01
TFDP1-201ENST00000375370 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TFDP1-201ENST00000375370 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
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TFDP1-201ENST00000375370 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.18■□□□□ 0.98
TFDP1-201ENST00000375370 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
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TFDP1-201ENST00000375370 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TFDP1-201ENST00000375370 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.12■□□□□ 0.97
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TFDP1-201ENST00000375370 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TFDP1-201ENST00000375370 ABCC5O15440 1437 aa20.72■□□□□ 0.91
TFDP1-201ENST00000375370 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
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TFDP1-201ENST00000375370 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.69■□□□□ 0.9
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