RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371421.8

ARRDC1-201, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1, Length 1,586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-201ENST00000371421 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.62■■■■■ 5.05
ARRDC1-201ENST00000371421 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.57■■■■■ 5.05
ARRDC1-201ENST00000371421 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.49■■■■■ 5.03
ARRDC1-201ENST00000371421 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.48■■■■■ 5.03
ARRDC1-201ENST00000371421 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.43■■■■■ 5.02
ARRDC1-201ENST00000371421 IQGAP2Q13576 1575 aa46.42■■■■■ 5.02
ARRDC1-201ENST00000371421 JPH4Q96JJ6 628 aa46.37■■■■■ 5.01
ARRDC1-201ENST00000371421 SHROOM2Q13796 1616 aa46.23■■■■■ 4.99
ARRDC1-201ENST00000371421 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
ARRDC1-201ENST00000371421 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.21■■■■■ 4.99
ARRDC1-201ENST00000371421 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
ARRDC1-201ENST00000371421 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.07■■■■■ 4.96
ARRDC1-201ENST00000371421 DISP1Q96F81 1524 aa46.03■■■■■ 4.96
ARRDC1-201ENST00000371421 CEP162Q5TB80 1403 aa46.03■■■■■ 4.96
ARRDC1-201ENST00000371421 CLIP1P30622 1438 aa46.01■■■■■ 4.96
ARRDC1-201ENST00000371421 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.98■■■■■ 4.95
ARRDC1-201ENST00000371421 SAMD9Q5K651 1589 aa45.97■■■■■ 4.95
ARRDC1-201ENST00000371421 KIAA0556O60303 1618 aa45.95■■■■■ 4.95
ARRDC1-201ENST00000371421 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.95■■■■■ 4.95
ARRDC1-201ENST00000371421 P3H3Q8IVL6 736 aa45.95■■■■■ 4.95
ARRDC1-201ENST00000371421 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.93■■■■■ 4.94
ARRDC1-201ENST00000371421 ARHGEF11O15085 1522 aa45.92■■■■■ 4.94
ARRDC1-201ENST00000371421 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.88■■■■■ 4.94
ARRDC1-201ENST00000371421 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.8■■■■■ 4.92
ARRDC1-201ENST00000371421 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.78■■■■■ 4.92
ARRDC1-201ENST00000371421 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.78■■■■■ 4.92
ARRDC1-201ENST00000371421 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.78■■■■■ 4.92
ARRDC1-201ENST00000371421 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
ARRDC1-201ENST00000371421 PTPRGP23470 1445 aa45.74■■■■■ 4.91
ARRDC1-201ENST00000371421 ARAP1Q96P48 1450 aa45.72■■■■■ 4.91
ARRDC1-201ENST00000371421 FMN1Q68DA7 1419 aa45.6■■■■■ 4.89
ARRDC1-201ENST00000371421 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.54■■■■■ 4.88
ARRDC1-201ENST00000371421 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.46■■■■■ 4.87
ARRDC1-201ENST00000371421 UACAQ9BZF9 1416 aa45.44■■■■■ 4.87
ARRDC1-201ENST00000371421 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.41■■■■■ 4.86
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCA8O94911 1581 aa45.39■■■■■ 4.86
ARRDC1-201ENST00000371421 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.35■■■■■ 4.85
ARRDC1-201ENST00000371421 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.33■■■■■ 4.85
ARRDC1-201ENST00000371421 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
ARRDC1-201ENST00000371421 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.32■■■■■ 4.84
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCC2Q92887 1545 aa45.31■■■■■ 4.84
ARRDC1-201ENST00000371421 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
ARRDC1-201ENST00000371421 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.25■■■■■ 4.83
ARRDC1-201ENST00000371421 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.24■■■■■ 4.83
ARRDC1-201ENST00000371421 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
ARRDC1-201ENST00000371421 HECW1Q76N89 1606 aa45.21■■■■■ 4.83
ARRDC1-201ENST00000371421 ARID3CA6NKF2 412 aa45.14■■■■■ 4.82
ARRDC1-201ENST00000371421 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.11■■■■■ 4.81
ARRDC1-201ENST00000371421 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.1■■■■■ 4.81
ARRDC1-201ENST00000371421 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
ARRDC1-201ENST00000371421 ATP10BO94823 1461 aa45.07■■■■■ 4.81
ARRDC1-201ENST00000371421 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
ARRDC1-201ENST00000371421 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
ARRDC1-201ENST00000371421 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.04■■■■■ 4.8
ARRDC1-201ENST00000371421 APLP2Q06481 763 aa44.99■■■■■ 4.79
ARRDC1-201ENST00000371421 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
ARRDC1-201ENST00000371421 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.98■■■■■ 4.79
ARRDC1-201ENST00000371421 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
ARRDC1-201ENST00000371421 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
ARRDC1-201ENST00000371421 MAP3K1Q13233 1512 aa44.87■■■■■ 4.77
ARRDC1-201ENST00000371421 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.86■■■■■ 4.77
ARRDC1-201ENST00000371421 TIAM1Q13009 1591 aa44.84■■■■■ 4.77
ARRDC1-201ENST00000371421 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.8■■■■■ 4.76
ARRDC1-201ENST00000371421 ASXL2Q76L83 1435 aa44.79■■■■■ 4.76
ARRDC1-201ENST00000371421 MAPKBP1O60336 1514 aa44.78■■■■■ 4.76
ARRDC1-201ENST00000371421 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.72■■■■■ 4.75
ARRDC1-201ENST00000371421 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.72■■■■■ 4.75
ARRDC1-201ENST00000371421 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
ARRDC1-201ENST00000371421 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.68■■■■■ 4.74
ARRDC1-201ENST00000371421 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
ARRDC1-201ENST00000371421 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.67■■■■■ 4.74
ARRDC1-201ENST00000371421 KCNH8Q96L42 1107 aa44.64■■■■■ 4.74
ARRDC1-201ENST00000371421 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.6■■■■■ 4.73
ARRDC1-201ENST00000371421 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.47■■■■■ 4.71
ARRDC1-201ENST00000371421 KIF14Q15058 1648 aa44.47■■■■■ 4.71
ARRDC1-201ENST00000371421 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.41■■■■■ 4.7
ARRDC1-201ENST00000371421 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
ARRDC1-201ENST00000371421 DIP2BQ9P265 1576 aa44.39■■■■■ 4.7
ARRDC1-201ENST00000371421 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.37■■■■■ 4.696e-6■■■■□ 24.8
ARRDC1-201ENST00000371421 NCOA2Q15596 1464 aa44.37■■■■■ 4.69
ARRDC1-201ENST00000371421 GLI2P10070 1586 aa44.35■■■■■ 4.69
ARRDC1-201ENST00000371421 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.32■■■■■ 4.68
ARRDC1-201ENST00000371421 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.29■■■■■ 4.68
ARRDC1-201ENST00000371421 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.29■■■■■ 4.68
ARRDC1-201ENST00000371421 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.27■■■■■ 4.68
ARRDC1-201ENST00000371421 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.24■■■■■ 4.67
ARRDC1-201ENST00000371421 CD109Q6YHK3 1445 aa44.23■■■■■ 4.67
ARRDC1-201ENST00000371421 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.18■■■■■ 4.66
ARRDC1-201ENST00000371421 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
ARRDC1-201ENST00000371421 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.18■■■■■ 4.66
ARRDC1-201ENST00000371421 PLCH2O75038 1416 aa44.16■■■■■ 4.66
ARRDC1-201ENST00000371421 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.13■■■■■ 4.66
ARRDC1-201ENST00000371421 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.13■■■■■ 4.65
ARRDC1-201ENST00000371421 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.11■■■■■ 4.65
ARRDC1-201ENST00000371421 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
ARRDC1-201ENST00000371421 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.07■■■■■ 4.65
ARRDC1-201ENST00000371421 PREX2Q70Z35 1606 aa44.07■■■■■ 4.65
ARRDC1-201ENST00000371421 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.05■■■■■ 4.64
ARRDC1-201ENST00000371421 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.03■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms