RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TGM1P22735 817 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LORP23490 312 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP1-1Q07627 177 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOTCH2Q04721 2471 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-9P60411 292 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MUC6Q6W4X9 2439 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RYR3Q15413 4870 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIVEP1P15822 2718 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HHIPQ96QV1 700 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBN2P35556 2912 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USH2AO75445 5202 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL9A1P20849 921 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TENM4Q6N022 2769 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL7A1Q02388 2944 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE1BQ5T7P3 118 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACNA1AO00555 2505 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRCH2Q5VUJ6 765 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SORCS1Q8WY21 1168 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCOR1O75376 2440 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNMDQ9H2S6 317 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MBD2Q9UBB5 411 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HERC1Q15751 4861 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOTCH3Q9UM47 2321 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.47□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERINC4A6NH21 518 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR26Q9H7D7 661 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DACH1Q9UI36 760 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACNA1GO43497 2377 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TENM3Q9P273 2699 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BTBD11A6QL63 1104 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE3BQ5TA77 95 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRPM4Q8TD43 1214 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZANQ9Y493 2812 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE1DQ5T752 114 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERBB2P04626 1255 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIVEP2P31629 2446 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNXBP22105 4242 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT1P04264 644 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-12P60413 245 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VWFP04275 2813 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRIN2CQ14957 1233 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE4AQ5TA78 99 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACANP16112 2415 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLQO75417 2590 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKS1AQ92625 1134 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.63□□□□□ -2.51
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