RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362821.1

RN7SKP173-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 173, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP173, Length 315 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP173-201ENST00000362821 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RN7SKP173-201ENST00000362821 FBLN2P98095 1184 aa13.7□□□□□ -0.22
RN7SKP173-201ENST00000362821 IQGAP2Q13576 1575 aa13.67□□□□□ -0.22
RN7SKP173-201ENST00000362821 EFCAB5A4FU69 1503 aa13.67□□□□□ -0.22
RN7SKP173-201ENST00000362821 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.66□□□□□ -0.22
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.65□□□□□ -0.22
RN7SKP173-201ENST00000362821 NUP160Q12769 1436 aa13.64□□□□□ -0.23
RN7SKP173-201ENST00000362821 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.64□□□□□ -0.23
RN7SKP173-201ENST00000362821 CEP170Q5SW79 1584 aa13.64□□□□□ -0.23
RN7SKP173-201ENST00000362821 ARAP1Q96P48 1450 aa13.64□□□□□ -0.23
RN7SKP173-201ENST00000362821 CHD1O14646 1710 aa13.63□□□□□ -0.23
RN7SKP173-201ENST00000362821 SAMD9Q5K651 1589 aa13.6□□□□□ -0.23
RN7SKP173-201ENST00000362821 UGGT2Q9NYU1 1516 aa13.59□□□□□ -0.23
RN7SKP173-201ENST00000362821 FHOD3Q2V2M9 1422 aa13.57□□□□□ -0.24
RN7SKP173-201ENST00000362821 P3H3Q8IVL6 736 aa13.56□□□□□ -0.24
RN7SKP173-201ENST00000362821 FMN1Q68DA7 1419 aa13.55□□□□□ -0.24
RN7SKP173-201ENST00000362821 APLP2Q06481 763 aa13.53□□□□□ -0.24
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIAA0556O60303 1618 aa13.53□□□□□ -0.24
RN7SKP173-201ENST00000362821 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.52□□□□□ -0.25
RN7SKP173-201ENST00000362821 DISP1Q96F81 1524 aa13.51□□□□□ -0.25
RN7SKP173-201ENST00000362821 JPH4Q96JJ6 628 aa13.51□□□□□ -0.25
RN7SKP173-201ENST00000362821 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RN7SKP173-201ENST00000362821 FYCO1Q9BQS8 1478 aa13.49□□□□□ -0.25
RN7SKP173-201ENST00000362821 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.49□□□□□ -0.25
RN7SKP173-201ENST00000362821 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.47□□□□□ -0.25
RN7SKP173-201ENST00000362821 SHROOM2Q13796 1616 aa13.46□□□□□ -0.25
RN7SKP173-201ENST00000362821 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAP3K1Q13233 1512 aa13.43□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 HECW1Q76N89 1606 aa13.42□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 OSCARQ8IYS5 282 aa13.42□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 TIAM1Q13009 1591 aa13.41□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.4□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
RN7SKP173-201ENST00000362821 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.39□□□□□ -0.27
RN7SKP173-201ENST00000362821 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa13.38□□□□□ -0.27
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RN7SKP173-201ENST00000362821 PTPRGP23470 1445 aa13.37□□□□□ -0.27
RN7SKP173-201ENST00000362821 PLB1Q6P1J6 1458 aa13.35□□□□□ -0.27
RN7SKP173-201ENST00000362821 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.35□□□□□ -0.27
RN7SKP173-201ENST00000362821 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.34□□□□□ -0.27
RN7SKP173-201ENST00000362821 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
RN7SKP173-201ENST00000362821 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 ABCA8O94911 1581 aa13.32□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.32□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.31□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.31□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.29□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 UACAQ9BZF9 1416 aa13.29□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 ARID3CA6NKF2 412 aa13.28□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
RN7SKP173-201ENST00000362821 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
RN7SKP173-201ENST00000362821 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
RN7SKP173-201ENST00000362821 ABCC2Q92887 1545 aa13.26□□□□□ -0.29
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.23□□□□□ -0.29
RN7SKP173-201ENST00000362821 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.23□□□□□ -0.29
RN7SKP173-201ENST00000362821 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RN7SKP173-201ENST00000362821 ATP10BO94823 1461 aa13.22□□□□□ -0.29
RN7SKP173-201ENST00000362821 NCOA2Q15596 1464 aa13.21□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 ARHGEF11O15085 1522 aa13.2□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.2□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.18□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.18□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.17□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.17□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.16□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIF14Q15058 1648 aa13.16□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RN7SKP173-201ENST00000362821 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.14□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.13□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.13□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.13□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.1□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 MIA2Q96PC5 1412 aa13.1□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
RN7SKP173-201ENST00000362821 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.07□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.07□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.07□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.06□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 ASXL2Q76L83 1435 aa13.05□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 ITGAEP38570 1179 aa13.04□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 KCNH8Q96L42 1107 aa13.04□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.03□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
RN7SKP173-201ENST00000362821 PREX2Q70Z35 1606 aa13.02□□□□□ -0.33
RN7SKP173-201ENST00000362821 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.02□□□□□ -0.33
RN7SKP173-201ENST00000362821 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13□□□□□ -0.33
RN7SKP173-201ENST00000362821 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13□□□□□ -0.33
RN7SKP173-201ENST00000362821 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.99□□□□□ -0.33
RN7SKP173-201ENST00000362821 MAPKBP1O60336 1514 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms