RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-201ENST00000345512 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-201ENST00000345512 KCNH8Q96L42 1107 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRU-201ENST00000345512 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRU-201ENST00000345512 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRU-201ENST00000345512 CUX2O14529 1486 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRU-201ENST00000345512 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRU-201ENST00000345512 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRU-201ENST00000345512 FBLN2P98095 1184 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRU-201ENST00000345512 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRU-201ENST00000345512 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRU-201ENST00000345512 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRU-201ENST00000345512 CCER2I3L3R5 266 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRU-201ENST00000345512 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-201ENST00000345512 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRU-201ENST00000345512 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRU-201ENST00000345512 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRU-201ENST00000345512 TMC1Q8TDI8 760 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRU-201ENST00000345512 KIF21BO75037 1637 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRU-201ENST00000345512 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRU-201ENST00000345512 NBR1Q14596 966 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRU-201ENST00000345512 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRU-201ENST00000345512 SYNJ1O43426 1573 aa21■□□□□ 0.95
PTPRU-201ENST00000345512 PPP4R2Q9NY27 417 aa21■□□□□ 0.95
PTPRU-201ENST00000345512 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRU-201ENST00000345512 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRU-201ENST00000345512 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRU-201ENST00000345512 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRU-201ENST00000345512 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-201ENST00000345512 ARAP1Q96P48 1450 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRU-201ENST00000345512 FOXD1Q16676 465 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-201ENST00000345512 TSPY4P0CV99 314 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-201ENST00000345512 TSPY10P0CW01 314 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-201ENST00000345512 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-201ENST00000345512 BCL11AQ9H165 835 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 IGF1RP08069 1367 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 FMN1Q68DA7 1419 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 PRXQ9BXM0 1461 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRU-201ENST00000345512 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRU-201ENST00000345512 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRU-201ENST00000345512 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRU-201ENST00000345512 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRU-201ENST00000345512 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRU-201ENST00000345512 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRU-201ENST00000345512 RGL3Q3MIN7 710 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRU-201ENST00000345512 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRU-201ENST00000345512 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRU-201ENST00000345512 TOP2BQ02880 1626 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRU-201ENST00000345512 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRU-201ENST00000345512 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
PTPRU-201ENST00000345512 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRU-201ENST00000345512 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRU-201ENST00000345512 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRU-201ENST00000345512 PKD2Q13563 968 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-201ENST00000345512 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-201ENST00000345512 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRU-201ENST00000345512 NCAPD3P42695 1498 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-201ENST00000345512 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRU-201ENST00000345512 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-201ENST00000345512 CUX1P39880 1505 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRU-201ENST00000345512 WDR97A6NE52 1622 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRU-201ENST00000345512 UACAQ9BZF9 1416 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRU-201ENST00000345512 NUDCQ9Y266 331 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-201ENST00000345512 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRU-201ENST00000345512 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRU-201ENST00000345512 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 CFTRP13569 1480 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 NEFMP07197 916 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 TIAM1Q13009 1591 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-201ENST00000345512 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 NUP155O75694 1391 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC7Q96M83 1385 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
PTPRU-201ENST00000345512 RGS3P49796 1198 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 NCOA2Q15596 1464 aa20.38■□□□□ 0.85
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