RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.2■■■■■ 4.83
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.17■■■■■ 4.82
GIPC1-201ENST00000345425 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.12■■■■■ 4.81
GIPC1-201ENST00000345425 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.12■■■■■ 4.81
GIPC1-201ENST00000345425 IQGAP2Q13576 1575 aa45.08■■■■■ 4.81
GIPC1-201ENST00000345425 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.03■■■■■ 4.8
GIPC1-201ENST00000345425 JPH4Q96JJ6 628 aa44.9■■■■■ 4.78
GIPC1-201ENST00000345425 SHROOM2Q13796 1616 aa44.89■■■■■ 4.78
GIPC1-201ENST00000345425 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.85■■■■■ 4.77
GIPC1-201ENST00000345425 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
GIPC1-201ENST00000345425 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
GIPC1-201ENST00000345425 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.69■■■■■ 4.74
GIPC1-201ENST00000345425 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.67■■■■■ 4.74
GIPC1-201ENST00000345425 CEP162Q5TB80 1403 aa44.67■■■■■ 4.74
GIPC1-201ENST00000345425 SAMD9Q5K651 1589 aa44.65■■■■■ 4.74
GIPC1-201ENST00000345425 DISP1Q96F81 1524 aa44.65■■■■■ 4.74
GIPC1-201ENST00000345425 CLIP1P30622 1438 aa44.63■■■■■ 4.73
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0556O60303 1618 aa44.63■■■■■ 4.73
GIPC1-201ENST00000345425 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.56■■■■■ 4.72
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.55■■■■■ 4.72
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF11O15085 1522 aa44.54■■■■■ 4.72
GIPC1-201ENST00000345425 P3H3Q8IVL6 736 aa44.48■■■■■ 4.71
GIPC1-201ENST00000345425 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.43■■■■■ 4.7
GIPC1-201ENST00000345425 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.43■■■■■ 4.7
GIPC1-201ENST00000345425 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.43■■■■■ 4.7
GIPC1-201ENST00000345425 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.42■■■■■ 4.7
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.4■■■■■ 4.7
GIPC1-201ENST00000345425 ARAP1Q96P48 1450 aa44.35■■■■■ 4.69
GIPC1-201ENST00000345425 PTPRGP23470 1445 aa44.33■■■■■ 4.69
GIPC1-201ENST00000345425 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
GIPC1-201ENST00000345425 FMN1Q68DA7 1419 aa44.25■■■■■ 4.67
GIPC1-201ENST00000345425 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.08■■■■■ 4.65
GIPC1-201ENST00000345425 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.07■■■■■ 4.65
GIPC1-201ENST00000345425 UACAQ9BZF9 1416 aa44.07■■■■■ 4.65
GIPC1-201ENST00000345425 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.06■■■■■ 4.64
GIPC1-201ENST00000345425 ABCA8O94911 1581 aa44.06■■■■■ 4.64
GIPC1-201ENST00000345425 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.05■■■■■ 4.64
GIPC1-201ENST00000345425 ABCC2Q92887 1545 aa43.98■■■■■ 4.63
GIPC1-201ENST00000345425 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.98■■■■■ 4.63
GIPC1-201ENST00000345425 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
GIPC1-201ENST00000345425 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.97■■■■■ 4.63
GIPC1-201ENST00000345425 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.95■■■■■ 4.63
GIPC1-201ENST00000345425 HECW1Q76N89 1606 aa43.93■■■■■ 4.62
GIPC1-201ENST00000345425 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.92■■■■■ 4.62
GIPC1-201ENST00000345425 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
GIPC1-201ENST00000345425 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
GIPC1-201ENST00000345425 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.76■■■■■ 4.6
GIPC1-201ENST00000345425 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.74■■■■■ 4.59
GIPC1-201ENST00000345425 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.71■■■■■ 4.59
GIPC1-201ENST00000345425 ARID3CA6NKF2 412 aa43.7■■■■■ 4.59
GIPC1-201ENST00000345425 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.7■■■■■ 4.59
GIPC1-201ENST00000345425 ATP10BO94823 1461 aa43.7■■■■■ 4.59
GIPC1-201ENST00000345425 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
GIPC1-201ENST00000345425 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
GIPC1-201ENST00000345425 APLP2Q06481 763 aa43.62■■■■■ 4.57
GIPC1-201ENST00000345425 MAP3K1Q13233 1512 aa43.57■■■■■ 4.57
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.56■■■■■ 4.56
GIPC1-201ENST00000345425 TIAM1Q13009 1591 aa43.55■■■■■ 4.56
GIPC1-201ENST00000345425 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
GIPC1-201ENST00000345425 MAPKBP1O60336 1514 aa43.47■■■■■ 4.55
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.45■■■■■ 4.55
GIPC1-201ENST00000345425 ASXL2Q76L83 1435 aa43.43■■■■■ 4.54
GIPC1-201ENST00000345425 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.38■■■■■ 4.54
GIPC1-201ENST00000345425 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.37■■■■■ 4.53
GIPC1-201ENST00000345425 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.35■■■■■ 4.53
GIPC1-201ENST00000345425 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.34■■■■■ 4.53
GIPC1-201ENST00000345425 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.33■■■■■ 4.53
GIPC1-201ENST00000345425 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
GIPC1-201ENST00000345425 KCNH8Q96L42 1107 aa43.21■■■■■ 4.51
GIPC1-201ENST00000345425 KIF14Q15058 1648 aa43.21■■■■■ 4.51
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GIPC1-201ENST00000345425 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
GIPC1-201ENST00000345425 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
GIPC1-201ENST00000345425 GLI2P10070 1586 aa43.05■■■■■ 4.48
GIPC1-201ENST00000345425 NCOA2Q15596 1464 aa43.05■■■■■ 4.48
GIPC1-201ENST00000345425 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.03■■■■■ 4.48
GIPC1-201ENST00000345425 TTC37Q6PGP7 1564 aa43■■■■■ 4.47
GIPC1-201ENST00000345425 FAM69CQ0P6D2 419 aa43■■■■■ 4.47
GIPC1-201ENST00000345425 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.97■■■■■ 4.47
GIPC1-201ENST00000345425 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.93■■■■■ 4.46
GIPC1-201ENST00000345425 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.9■■■■■ 4.46
GIPC1-201ENST00000345425 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.89■■■■■ 4.46
GIPC1-201ENST00000345425 CD109Q6YHK3 1445 aa42.87■■■■■ 4.45
GIPC1-201ENST00000345425 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
GIPC1-201ENST00000345425 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.86■■■■■ 4.45
GIPC1-201ENST00000345425 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.85■■■■■ 4.45
GIPC1-201ENST00000345425 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
GIPC1-201ENST00000345425 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.83■■■■■ 4.45
GIPC1-201ENST00000345425 PLCH2O75038 1416 aa42.82■■■■■ 4.44
GIPC1-201ENST00000345425 PREX2Q70Z35 1606 aa42.82■■■■■ 4.44
GIPC1-201ENST00000345425 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.81■■■■■ 4.44
GIPC1-201ENST00000345425 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.79■■■■■ 4.44
GIPC1-201ENST00000345425 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.76■■■■■ 4.43
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.74■■■■■ 4.43
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