RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343281.9

N4BP2L1-201, Transcript of NEDD4 binding protein 2 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene N4BP2L1, Length 1,789 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2L1-201ENST00000343281 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
N4BP2L1-201ENST00000343281 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.46■■□□□ 1.35
N4BP2L1-201ENST00000343281 WDR97A6NE52 1622 aa23.46■■□□□ 1.35
N4BP2L1-201ENST00000343281 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.4■■□□□ 1.34
N4BP2L1-201ENST00000343281 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.39■■□□□ 1.33
N4BP2L1-201ENST00000343281 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
N4BP2L1-201ENST00000343281 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
N4BP2L1-201ENST00000343281 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.36■■□□□ 1.33
N4BP2L1-201ENST00000343281 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.35■■□□□ 1.33
N4BP2L1-201ENST00000343281 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.34■■□□□ 1.33
N4BP2L1-201ENST00000343281 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.34■■□□□ 1.33
N4BP2L1-201ENST00000343281 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
N4BP2L1-201ENST00000343281 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
N4BP2L1-201ENST00000343281 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.32■■□□□ 1.32
N4BP2L1-201ENST00000343281 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.32■■□□□ 1.32
N4BP2L1-201ENST00000343281 P3H3Q8IVL6 736 aa23.32■■□□□ 1.32
N4BP2L1-201ENST00000343281 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.3■■□□□ 1.32
N4BP2L1-201ENST00000343281 FMN1Q68DA7 1419 aa23.29■■□□□ 1.32
N4BP2L1-201ENST00000343281 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
N4BP2L1-201ENST00000343281 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.23■■□□□ 1.31
N4BP2L1-201ENST00000343281 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
N4BP2L1-201ENST00000343281 SAMD9Q5K651 1589 aa23.2■■□□□ 1.3
N4BP2L1-201ENST00000343281 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
N4BP2L1-201ENST00000343281 ITGAEP38570 1179 aa23.19■■□□□ 1.3
N4BP2L1-201ENST00000343281 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
N4BP2L1-201ENST00000343281 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.17■■□□□ 1.3
N4BP2L1-201ENST00000343281 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.16■■□□□ 1.3
N4BP2L1-201ENST00000343281 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.15■■□□□ 1.3
N4BP2L1-201ENST00000343281 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.15■■□□□ 1.3
N4BP2L1-201ENST00000343281 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
N4BP2L1-201ENST00000343281 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
N4BP2L1-201ENST00000343281 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
N4BP2L1-201ENST00000343281 PBRM1Q86U86 1689 aa23.08■■□□□ 1.29
N4BP2L1-201ENST00000343281 GRIN2BQ13224 1484 aa23.07■■□□□ 1.28
N4BP2L1-201ENST00000343281 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.05■■□□□ 1.28
N4BP2L1-201ENST00000343281 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
N4BP2L1-201ENST00000343281 IFT140Q96RY7 1462 aa23.04■■□□□ 1.28
N4BP2L1-201ENST00000343281 ADAMTS12P58397 1594 aa23.03■■□□□ 1.28
N4BP2L1-201ENST00000343281 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.02■■□□□ 1.27
N4BP2L1-201ENST00000343281 WDR62O43379 1518 aa22.99■■□□□ 1.27
N4BP2L1-201ENST00000343281 MAPKBP1O60336 1514 aa22.99■■□□□ 1.27
N4BP2L1-201ENST00000343281 IQGAP2Q13576 1575 aa22.99■■□□□ 1.27
N4BP2L1-201ENST00000343281 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.97■■□□□ 1.27
N4BP2L1-201ENST00000343281 NEUROD1Q13562 356 aa22.97■■□□□ 1.27
N4BP2L1-201ENST00000343281 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.97■■□□□ 1.27
N4BP2L1-201ENST00000343281 MIER1Q8N108 512 aa22.95■■□□□ 1.26
N4BP2L1-201ENST00000343281 NCOA2Q15596 1464 aa22.94■■□□□ 1.26
N4BP2L1-201ENST00000343281 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.93■■□□□ 1.26
N4BP2L1-201ENST00000343281 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
N4BP2L1-201ENST00000343281 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.92■■□□□ 1.26
N4BP2L1-201ENST00000343281 HECW1Q76N89 1606 aa22.9■■□□□ 1.26
N4BP2L1-201ENST00000343281 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.9■■□□□ 1.26
N4BP2L1-201ENST00000343281 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.89■■□□□ 1.26
N4BP2L1-201ENST00000343281 ARHGEF11O15085 1522 aa22.87■■□□□ 1.25
N4BP2L1-201ENST00000343281 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
N4BP2L1-201ENST00000343281 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.84■■□□□ 1.25
N4BP2L1-201ENST00000343281 HFM1A2PYH4 1435 aa22.84■■□□□ 1.25
N4BP2L1-201ENST00000343281 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
N4BP2L1-201ENST00000343281 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.8■■□□□ 1.24
N4BP2L1-201ENST00000343281 OSCARQ8IYS5 282 aa22.79■■□□□ 1.24
N4BP2L1-201ENST00000343281 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.79■■□□□ 1.24
N4BP2L1-201ENST00000343281 PTPRKQ15262 1439 aa22.78■■□□□ 1.24
N4BP2L1-201ENST00000343281 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
N4BP2L1-201ENST00000343281 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 GRIN2AQ12879 1464 aa22.76■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 UACAQ9BZF9 1416 aa22.75■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.75■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 MIA2Q96PC5 1412 aa22.74■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 NAIPQ13075 1403 aa22.73■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 KIAA0556O60303 1618 aa22.73■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 DISP1Q96F81 1524 aa22.72■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.71■■□□□ 1.23
N4BP2L1-201ENST00000343281 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
N4BP2L1-201ENST00000343281 AKNAQ7Z591 1439 aa22.68■■□□□ 1.22
N4BP2L1-201ENST00000343281 SYNJ2O15056 1496 aa22.66■■□□□ 1.22
N4BP2L1-201ENST00000343281 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
N4BP2L1-201ENST00000343281 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
N4BP2L1-201ENST00000343281 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
N4BP2L1-201ENST00000343281 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.62■■□□□ 1.21
N4BP2L1-201ENST00000343281 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
N4BP2L1-201ENST00000343281 TONSLQ96HA7 1378 aa22.6■■□□□ 1.21
N4BP2L1-201ENST00000343281 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.6■■□□□ 1.21
N4BP2L1-201ENST00000343281 CEP170Q5SW79 1584 aa22.57■■□□□ 1.2
N4BP2L1-201ENST00000343281 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.55■■□□□ 1.2
N4BP2L1-201ENST00000343281 NUP160Q12769 1436 aa22.55■■□□□ 1.2
N4BP2L1-201ENST00000343281 ARID3CA6NKF2 412 aa22.55■■□□□ 1.2
N4BP2L1-201ENST00000343281 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.55■■□□□ 1.2
N4BP2L1-201ENST00000343281 ROCK1Q13464 1354 aa22.53■■□□□ 1.2
N4BP2L1-201ENST00000343281 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.53■■□□□ 1.2
N4BP2L1-201ENST00000343281 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.52■■□□□ 1.19
N4BP2L1-201ENST00000343281 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.52■■□□□ 1.19
N4BP2L1-201ENST00000343281 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.52■■□□□ 1.19
N4BP2L1-201ENST00000343281 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
N4BP2L1-201ENST00000343281 DAPK1P53355 1430 aa22.49■■□□□ 1.19
N4BP2L1-201ENST00000343281 FBLN2P98095 1184 aa22.48■■□□□ 1.19
N4BP2L1-201ENST00000343281 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
N4BP2L1-201ENST00000343281 JPH4Q96JJ6 628 aa22.48■■□□□ 1.19
N4BP2L1-201ENST00000343281 TRIM52Q96A61 297 aa22.47■■□□□ 1.19
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