RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 NEUROD1Q13562 356 aa28.64■■■□□ 2.18
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TM7SF3-201ENST00000343028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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TM7SF3-201ENST00000343028 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-201ENST00000343028 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.45■■■□□ 2.15
TM7SF3-201ENST00000343028 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.44■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 CUL7Q14999 1698 aa28.44■■■□□ 2.14
TM7SF3-201ENST00000343028 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.43■■■□□ 2.14
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TM7SF3-201ENST00000343028 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-201ENST00000343028 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-201ENST00000343028 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.31■■■□□ 2.12
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TM7SF3-201ENST00000343028 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.28■■■□□ 2.12
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TM7SF3-201ENST00000343028 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-201ENST00000343028 ARID3CA6NKF2 412 aa28.23■■■□□ 2.11
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TM7SF3-201ENST00000343028 PBRM1Q86U86 1689 aa28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TM7SF3-201ENST00000343028 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.04■■■□□ 2.08
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TM7SF3-201ENST00000343028 IFT140Q96RY7 1462 aa27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNH8Q96L42 1107 aa27.81■■■□□ 2.04
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TM7SF3-201ENST00000343028 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 NAIPQ13075 1403 aa27.8■■■□□ 2.04
TM7SF3-201ENST00000343028 HECW1Q76N89 1606 aa27.78■■■□□ 2.04
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TM7SF3-201ENST00000343028 WDR62O43379 1518 aa27.76■■■□□ 2.03
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TM7SF3-201ENST00000343028 TONSLQ96HA7 1378 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-201ENST00000343028 UACAQ9BZF9 1416 aa27.73■■■□□ 2.03
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TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGEF11O15085 1522 aa27.7■■■□□ 2.03
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TM7SF3-201ENST00000343028 CEP170Q5SW79 1584 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
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TM7SF3-201ENST00000343028 SYNJ2O15056 1496 aa27.46■■□□□ 1.99
TM7SF3-201ENST00000343028 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
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