RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336283.7

SRA1-201, Transcript of steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRA1, Length 2,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1-201ENST00000336283 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.98■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.98■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.96■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.96■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SRA1-201ENST00000336283 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.93■□□□□ 0.94
SRA1-201ENST00000336283 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SRA1-201ENST00000336283 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 16.6
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SRA1-201ENST00000336283 P3H3Q8IVL6 736 aa20.92■□□□□ 0.94
SRA1-201ENST00000336283 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.92■□□□□ 0.94
SRA1-201ENST00000336283 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.91■□□□□ 0.94
SRA1-201ENST00000336283 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.9■□□□□ 0.94
SRA1-201ENST00000336283 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SRA1-201ENST00000336283 FMN1Q68DA7 1419 aa20.86■□□□□ 0.93
SRA1-201ENST00000336283 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.83■□□□□ 0.93
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SRA1-201ENST00000336283 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.8■□□□□ 0.92
SRA1-201ENST00000336283 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SRA1-201ENST00000336283 ITGAEP38570 1179 aa20.77■□□□□ 0.92
SRA1-201ENST00000336283 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.77■□□□□ 0.92
SRA1-201ENST00000336283 PBRM1Q86U86 1689 aa20.74■□□□□ 0.91
SRA1-201ENST00000336283 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.74■□□□□ 0.91
SRA1-201ENST00000336283 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
SRA1-201ENST00000336283 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.72■□□□□ 0.91
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SRA1-201ENST00000336283 GRIN2BQ13224 1484 aa20.69■□□□□ 0.9
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SRA1-201ENST00000336283 IFT140Q96RY7 1462 aa20.67■□□□□ 0.9
SRA1-201ENST00000336283 WDR62O43379 1518 aa20.65■□□□□ 0.9
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SRA1-201ENST00000336283 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.63■□□□□ 0.89
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SRA1-201ENST00000336283 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.62■□□□□ 0.89
SRA1-201ENST00000336283 MAPKBP1O60336 1514 aa20.6■□□□□ 0.89
SRA1-201ENST00000336283 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SRA1-201ENST00000336283 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SRA1-201ENST00000336283 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SRA1-201ENST00000336283 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.57■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.57■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 NCOA2Q15596 1464 aa20.55■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.54■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.53■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 NEUROD1Q13562 356 aa20.53■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 MIER1Q8N108 512 aa20.53■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 HECW1Q76N89 1606 aa20.53■□□□□ 0.88
SRA1-201ENST00000336283 ARHGEF11O15085 1522 aa20.5■□□□□ 0.87
SRA1-201ENST00000336283 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.49■□□□□ 0.87
SRA1-201ENST00000336283 ERCC6Q03468 1493 aa20.48■□□□□ 0.87
SRA1-201ENST00000336283 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.47■□□□□ 0.87
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SRA1-201ENST00000336283 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SRA1-201ENST00000336283 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.45■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 HFM1A2PYH4 1435 aa20.45■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 PTPRKQ15262 1439 aa20.44■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 GRIN2AQ12879 1464 aa20.43■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.43■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 KIAA0556O60303 1618 aa20.4■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 DISP1Q96F81 1524 aa20.4■□□□□ 0.86
SRA1-201ENST00000336283 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.39■□□□□ 0.85
SRA1-201ENST00000336283 NAIPQ13075 1403 aa20.38■□□□□ 0.85
SRA1-201ENST00000336283 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SRA1-201ENST00000336283 UACAQ9BZF9 1416 aa20.37■□□□□ 0.85
SRA1-201ENST00000336283 MIA2Q96PC5 1412 aa20.36■□□□□ 0.85
SRA1-201ENST00000336283 SYNJ2O15056 1496 aa20.34■□□□□ 0.85
SRA1-201ENST00000336283 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SRA1-201ENST00000336283 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SRA1-201ENST00000336283 AKNAQ7Z591 1439 aa20.3■□□□□ 0.84
SRA1-201ENST00000336283 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.29■□□□□ 0.84
SRA1-201ENST00000336283 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SRA1-201ENST00000336283 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SRA1-201ENST00000336283 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.28■□□□□ 0.84
SRA1-201ENST00000336283 CEP170Q5SW79 1584 aa20.28■□□□□ 0.84
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SRA1-201ENST00000336283 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SRA1-201ENST00000336283 NUP160Q12769 1436 aa20.24■□□□□ 0.83
SRA1-201ENST00000336283 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.22■□□□□ 0.83
SRA1-201ENST00000336283 TONSLQ96HA7 1378 aa20.21■□□□□ 0.83
SRA1-201ENST00000336283 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.21■□□□□ 0.83
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SRA1-201ENST00000336283 FBLN2P98095 1184 aa20.19■□□□□ 0.82
SRA1-201ENST00000336283 JPH4Q96JJ6 628 aa20.18■□□□□ 0.82
SRA1-201ENST00000336283 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SRA1-201ENST00000336283 ROCK1Q13464 1354 aa20.17■□□□□ 0.82
SRA1-201ENST00000336283 DAPK1P53355 1430 aa20.15■□□□□ 0.82
SRA1-201ENST00000336283 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.14■□□□□ 0.82
SRA1-201ENST00000336283 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SRA1-201ENST00000336283 ABCC5O15440 1437 aa20.13■□□□□ 0.81
SRA1-201ENST00000336283 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SRA1-201ENST00000336283 KDM6BO15054 1643 aa20.12■□□□□ 0.81
SRA1-201ENST00000336283 TRIM52Q96A61 297 aa20.11■□□□□ 0.81
SRA1-201ENST00000336283 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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