RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325139.9

CYTH2-201, Transcript of cytohesin 2, humanhuman

TSL 2

Gene CYTH2, Length 1,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH2-201ENST00000325139 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.14■■■■■ 4.5
CYTH2-201ENST00000325139 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
CYTH2-201ENST00000325139 JPH4Q96JJ6 628 aa43.01■■■■■ 4.48
CYTH2-201ENST00000325139 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.93■■■■■ 4.46
CYTH2-201ENST00000325139 IQGAP2Q13576 1575 aa42.91■■■■■ 4.46
CYTH2-201ENST00000325139 PRXQ9BXM0 1461 aa42.81■■■■■ 4.44
CYTH2-201ENST00000325139 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.79■■■■■ 4.44
CYTH2-201ENST00000325139 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.73■■■■■ 4.43
CYTH2-201ENST00000325139 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.71■■■■■ 4.43
CYTH2-201ENST00000325139 DISP1Q96F81 1524 aa42.69■■■■■ 4.42
CYTH2-201ENST00000325139 KIAA0556O60303 1618 aa42.57■■■■■ 4.41
CYTH2-201ENST00000325139 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.55■■■■■ 4.4
CYTH2-201ENST00000325139 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
CYTH2-201ENST00000325139 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.51■■■■■ 4.4
CYTH2-201ENST00000325139 MAPKBP1O60336 1514 aa42.5■■■■■ 4.39
CYTH2-201ENST00000325139 EEA1Q15075 1411 aa42.49■■■■■ 4.39
CYTH2-201ENST00000325139 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.49■■■■■ 4.39
CYTH2-201ENST00000325139 PTPRGP23470 1445 aa42.43■■■■■ 4.38
CYTH2-201ENST00000325139 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.36■■■■■ 4.37
CYTH2-201ENST00000325139 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.35■■■■■ 4.37
CYTH2-201ENST00000325139 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.32■■■■■ 4.37
CYTH2-201ENST00000325139 DIP2BQ9P265 1576 aa42.31■■■■■ 4.36
CYTH2-201ENST00000325139 ABCC2Q92887 1545 aa42.3■■■■■ 4.36
CYTH2-201ENST00000325139 KIF21BO75037 1637 aa42.29■■■■■ 4.36
CYTH2-201ENST00000325139 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.26■■■■■ 4.36
CYTH2-201ENST00000325139 UACAQ9BZF9 1416 aa42.23■■■■■ 4.35
CYTH2-201ENST00000325139 GOLGA3Q08378 1498 aa42.23■■■■■ 4.35
CYTH2-201ENST00000325139 SAMD9Q5K651 1589 aa42.22■■■■■ 4.35
CYTH2-201ENST00000325139 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.16■■■■■ 4.34
CYTH2-201ENST00000325139 ABCA8O94911 1581 aa42.15■■■■■ 4.34
CYTH2-201ENST00000325139 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
CYTH2-201ENST00000325139 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.07■■■■■ 4.33
CYTH2-201ENST00000325139 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
CYTH2-201ENST00000325139 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.05■■■■■ 4.32
CYTH2-201ENST00000325139 ASXL2Q76L83 1435 aa42■■■■■ 4.31
CYTH2-201ENST00000325139 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
CYTH2-201ENST00000325139 GLI2P10070 1586 aa41.97■■■■■ 4.31
CYTH2-201ENST00000325139 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
CYTH2-201ENST00000325139 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.9■■■■■ 4.3
CYTH2-201ENST00000325139 TSPOAP1O95153 1857 aa41.85■■■■■ 4.29
CYTH2-201ENST00000325139 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
CYTH2-201ENST00000325139 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.83■■■■■ 4.29
CYTH2-201ENST00000325139 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.81■■■■■ 4.28
CYTH2-201ENST00000325139 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.79■■■■■ 4.28
CYTH2-201ENST00000325139 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.77■■■■■ 4.28
CYTH2-201ENST00000325139 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.71■■■■■ 4.27
CYTH2-201ENST00000325139 P3H3Q8IVL6 736 aa41.7■■■■■ 4.27
CYTH2-201ENST00000325139 ATP10BO94823 1461 aa41.66■■■■■ 4.26
CYTH2-201ENST00000325139 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
CYTH2-201ENST00000325139 KDM6BO15054 1643 aa41.62■■■■■ 4.25
CYTH2-201ENST00000325139 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.59■■■■■ 4.25
CYTH2-201ENST00000325139 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.55■■■■■ 4.24
CYTH2-201ENST00000325139 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
CYTH2-201ENST00000325139 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.44■■■■■ 4.22
CYTH2-201ENST00000325139 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.41■■■■■ 4.22
CYTH2-201ENST00000325139 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CYTH2-201ENST00000325139 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.39■■■■■ 4.22
CYTH2-201ENST00000325139 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.39■■■■■ 4.22
CYTH2-201ENST00000325139 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
CYTH2-201ENST00000325139 ARID3CA6NKF2 412 aa41.33■■■■■ 4.21
CYTH2-201ENST00000325139 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.32■■■■■ 4.2
CYTH2-201ENST00000325139 CD109Q6YHK3 1445 aa41.29■■■■■ 4.2
CYTH2-201ENST00000325139 HECW1Q76N89 1606 aa41.29■■■■■ 4.2
CYTH2-201ENST00000325139 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
CYTH2-201ENST00000325139 FMN1Q68DA7 1419 aa41.27■■■■■ 4.2
CYTH2-201ENST00000325139 KCNH8Q96L42 1107 aa41.21■■■■■ 4.19
CYTH2-201ENST00000325139 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CYTH2-201ENST00000325139 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.12■■■■■ 4.17
CYTH2-201ENST00000325139 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
CYTH2-201ENST00000325139 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.07■■■■■ 4.16
CYTH2-201ENST00000325139 CLIP1P30622 1438 aa41.01■■■■■ 4.15
CYTH2-201ENST00000325139 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41■■■■■ 4.15
CYTH2-201ENST00000325139 NEO1Q92859 1461 aa40.99■■■■■ 4.15
CYTH2-201ENST00000325139 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
CYTH2-201ENST00000325139 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
CYTH2-201ENST00000325139 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.97■■■■■ 4.15
CYTH2-201ENST00000325139 KIF14Q15058 1648 aa40.96■■■■■ 4.15
CYTH2-201ENST00000325139 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.94■■■■■ 4.14
CYTH2-201ENST00000325139 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.91■■■■■ 4.14
CYTH2-201ENST00000325139 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.89■■■■■ 4.14
CYTH2-201ENST00000325139 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.89■■■■■ 4.14
CYTH2-201ENST00000325139 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.86■■■■■ 4.13
CYTH2-201ENST00000325139 RICTORQ6R327 1708 aa40.85■■■■■ 4.13
CYTH2-201ENST00000325139 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.85■■■■■ 4.13
CYTH2-201ENST00000325139 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
CYTH2-201ENST00000325139 FANCAO15360 1455 aa40.78■■■■■ 4.12
CYTH2-201ENST00000325139 CEP162Q5TB80 1403 aa40.77■■■■■ 4.12
CYTH2-201ENST00000325139 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.75■■■■■ 4.11
CYTH2-201ENST00000325139 PLCH2O75038 1416 aa40.74■■■■■ 4.11
CYTH2-201ENST00000325139 AKNAQ7Z591 1439 aa40.71■■■■■ 4.11
CYTH2-201ENST00000325139 ADGRL1O94910 1474 aa40.7■■■■■ 4.11
CYTH2-201ENST00000325139 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
CYTH2-201ENST00000325139 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.69■■■■■ 4.1
CYTH2-201ENST00000325139 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.67■■■■■ 4.1
CYTH2-201ENST00000325139 PREX2Q70Z35 1606 aa40.66■■■■■ 4.1
CYTH2-201ENST00000325139 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
CYTH2-201ENST00000325139 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.62■■■■■ 4.09
CYTH2-201ENST00000325139 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.62■■■■■ 4.09
CYTH2-201ENST00000325139 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
CYTH2-201ENST00000325139 RAPGEF3O95398 923 aa40.59■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.3 ms