RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
ITGA3-202ENST00000320031 BCANQ96GW7 911 aa22.62■■□□□ 1.21
ITGA3-202ENST00000320031 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ITGA3-202ENST00000320031 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ITGA3-202ENST00000320031 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-202ENST00000320031 KCNH8Q96L42 1107 aa22.56■■□□□ 1.2
ITGA3-202ENST00000320031 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ITGA3-202ENST00000320031 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-202ENST00000320031 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.51■■□□□ 1.19
ITGA3-202ENST00000320031 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGA3-202ENST00000320031 FMN1Q68DA7 1419 aa22.49■■□□□ 1.19
ITGA3-202ENST00000320031 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.49■■□□□ 1.19
ITGA3-202ENST00000320031 NEFMP07197 916 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-202ENST00000320031 MIER1Q8N108 512 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-202ENST00000320031 NCAPD3P42695 1498 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-202ENST00000320031 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
ITGA3-202ENST00000320031 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-202ENST00000320031 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.44■■□□□ 1.18
ITGA3-202ENST00000320031 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.41■■□□□ 1.18
ITGA3-202ENST00000320031 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.4■■□□□ 1.18
ITGA3-202ENST00000320031 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.4■■□□□ 1.18
ITGA3-202ENST00000320031 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ITGA3-202ENST00000320031 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.38■■□□□ 1.17
ITGA3-202ENST00000320031 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ITGA3-202ENST00000320031 TMC1Q8TDI8 760 aa22.37■■□□□ 1.17
ITGA3-202ENST00000320031 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.37■■□□□ 1.17
ITGA3-202ENST00000320031 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ITGA3-202ENST00000320031 MRS2Q9HD23 443 aa22.34■■□□□ 1.17
ITGA3-202ENST00000320031 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.34■■□□□ 1.17
ITGA3-202ENST00000320031 FKBP8Q14318 412 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA3-202ENST00000320031 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA3-202ENST00000320031 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ITGA3-202ENST00000320031 RGL3Q3MIN7 710 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGA3-202ENST00000320031 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.23■■□□□ 1.15
ITGA3-202ENST00000320031 IGF1RP08069 1367 aa22.2■■□□□ 1.14
ITGA3-202ENST00000320031 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.19■■□□□ 1.14
ITGA3-202ENST00000320031 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
ITGA3-202ENST00000320031 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.19■■□□□ 1.14
ITGA3-202ENST00000320031 CDCA8Q53HL2 280 aa22.16■■□□□ 1.14
ITGA3-202ENST00000320031 CFTRP13569 1480 aa22.14■■□□□ 1.14
ITGA3-202ENST00000320031 HMGXB3Q12766 1538 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-202ENST00000320031 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-202ENST00000320031 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-202ENST00000320031 SLC24A1O60721 1099 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-202ENST00000320031 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-202ENST00000320031 JPH4Q96JJ6 628 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-202ENST00000320031 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.08■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 KANK1Q14678 1352 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 KIF21BO75037 1637 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 SYNJ1O43426 1573 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGA3-202ENST00000320031 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.02■■□□□ 1.11
ITGA3-202ENST00000320031 PKD2Q13563 968 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-202ENST00000320031 KNSTRNQ9Y448 316 aa22■■□□□ 1.11
ITGA3-202ENST00000320031 DCAF11Q8TEB1 546 aa22■■□□□ 1.11
ITGA3-202ENST00000320031 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22■■□□□ 1.11
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC136Q96JN2 1154 aa22■■□□□ 1.11
ITGA3-202ENST00000320031 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGA3-202ENST00000320031 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-202ENST00000320031 TOP2BQ02880 1626 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-202ENST00000320031 NUP155O75694 1391 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-202ENST00000320031 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGA3-202ENST00000320031 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ITGA3-202ENST00000320031 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-202ENST00000320031 FOXD1Q16676 465 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-202ENST00000320031 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-202ENST00000320031 CCER2I3L3R5 266 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 TMF1P82094 1093 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 CFAP53Q96M91 514 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 BCL11AQ9H165 835 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 PTPRGP23470 1445 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 PRXQ9BXM0 1461 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 CUX1P39880 1505 aa21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ITGA3-202ENST00000320031 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 GRIN2BQ13224 1484 aa21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 NESP48681 1621 aa21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.8■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 TOPBP1Q92547 1522 aa21.79■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 POGKQ9P215 609 aa21.79■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.78■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.78■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 GGT6Q6P531 493 aa21.77■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.77■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ITGA3-202ENST00000320031 ARAP1Q96P48 1450 aa21.76■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.76■■□□□ 1.07
ITGA3-202ENST00000320031 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.75■■□□□ 1.07
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