RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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ZNF554-201ENST00000317243 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.45■■■□□ 2.15
ZNF554-201ENST00000317243 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ZNF554-201ENST00000317243 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ZNF554-201ENST00000317243 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.4■■■□□ 2.14
ZNF554-201ENST00000317243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.38■■■□□ 2.13
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ZNF554-201ENST00000317243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.36■■■□□ 2.13
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ZNF554-201ENST00000317243 WDR97A6NE52 1622 aa28.27■■■□□ 2.12
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ZNF554-201ENST00000317243 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.23■■■□□ 2.11
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ZNF554-201ENST00000317243 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.19■■■□□ 2.1
ZNF554-201ENST00000317243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.19■■■□□ 2.1
ZNF554-201ENST00000317243 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
ZNF554-201ENST00000317243 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.17■■■□□ 2.1
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ZNF554-201ENST00000317243 MAP3K1Q13233 1512 aa28.12■■■□□ 2.09
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ZNF554-201ENST00000317243 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.07■■■□□ 2.08
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ZNF554-201ENST00000317243 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.05■■■□□ 2.08
ZNF554-201ENST00000317243 ARID3CA6NKF2 412 aa28.05■■■□□ 2.08
ZNF554-201ENST00000317243 BCL11AQ9H165 835 aa28.03■■■□□ 2.08
ZNF554-201ENST00000317243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.02■■■□□ 2.08
ZNF554-201ENST00000317243 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.02■■■□□ 2.08
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ZNF554-201ENST00000317243 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.99■■■□□ 2.07
ZNF554-201ENST00000317243 MAPKBP1O60336 1514 aa27.99■■■□□ 2.07
ZNF554-201ENST00000317243 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.98■■■□□ 2.07
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ZNF554-201ENST00000317243 SAMD9Q5K651 1589 aa27.94■■■□□ 2.06
ZNF554-201ENST00000317243 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.94■■■□□ 2.06
ZNF554-201ENST00000317243 PBRM1Q86U86 1689 aa27.9■■■□□ 2.06
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ZNF554-201ENST00000317243 ADAMTS12P58397 1594 aa27.78■■■□□ 2.04
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ZNF554-201ENST00000317243 TONSLQ96HA7 1378 aa27.39■■□□□ 1.97
ZNF554-201ENST00000317243 CEP170Q5SW79 1584 aa27.38■■□□□ 1.97
ZNF554-201ENST00000317243 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.36■■□□□ 1.97
ZNF554-201ENST00000317243 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ZNF554-201ENST00000317243 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ZNF554-201ENST00000317243 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ZNF554-201ENST00000317243 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.3■■□□□ 1.96
ZNF554-201ENST00000317243 JPH4Q96JJ6 628 aa27.27■■□□□ 1.96
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