RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.05■□□□□ -0
PDE4D-201ENST00000309641 JPH4Q96JJ6 628 aa15.04■□□□□ -0
PDE4D-201ENST00000309641 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.04■□□□□ -0
PDE4D-201ENST00000309641 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.03■□□□□ -0
PDE4D-201ENST00000309641 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.03■□□□□ -0
PDE4D-201ENST00000309641 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.03■□□□□ -0
PDE4D-201ENST00000309641 SHROOM2Q13796 1616 aa15.02□□□□□ -0.01
PDE4D-201ENST00000309641 KIF21BO75037 1637 aa15.01□□□□□ -0.01
PDE4D-201ENST00000309641 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDE4D-201ENST00000309641 IQGAP2Q13576 1575 aa14.99□□□□□ -0.01
PDE4D-201ENST00000309641 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.97□□□□□ -0.01
PDE4D-201ENST00000309641 ARAP1Q96P48 1450 aa14.96□□□□□ -0.01
PDE4D-201ENST00000309641 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA3Q08378 1498 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4D-201ENST00000309641 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PDE4D-201ENST00000309641 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4D-201ENST00000309641 DISP1Q96F81 1524 aa14.91□□□□□ -0.02
PDE4D-201ENST00000309641 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.91□□□□□ -0.02
PDE4D-201ENST00000309641 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-201ENST00000309641 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.89□□□□□ -0.03
PDE4D-201ENST00000309641 P3H3Q8IVL6 736 aa14.87□□□□□ -0.03
PDE4D-201ENST00000309641 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA0556O60303 1618 aa14.86□□□□□ -0.03
PDE4D-201ENST00000309641 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.82□□□□□ -0.04
PDE4D-201ENST00000309641 PTPRGP23470 1445 aa14.82□□□□□ -0.04
PDE4D-201ENST00000309641 SAMD9Q5K651 1589 aa14.81□□□□□ -0.04
PDE4D-201ENST00000309641 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.78□□□□□ -0.04
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.77□□□□□ -0.05
PDE4D-201ENST00000309641 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.74□□□□□ -0.05
PDE4D-201ENST00000309641 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.74□□□□□ -0.05
PDE4D-201ENST00000309641 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-201ENST00000309641 CLIP1P30622 1438 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-201ENST00000309641 UACAQ9BZF9 1416 aa14.71□□□□□ -0.05
PDE4D-201ENST00000309641 CEP162Q5TB80 1403 aa14.69□□□□□ -0.06
PDE4D-201ENST00000309641 ABCA8O94911 1581 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4D-201ENST00000309641 ABCC2Q92887 1545 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4D-201ENST00000309641 ARID3CA6NKF2 412 aa14.68□□□□□ -0.06
PDE4D-201ENST00000309641 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.67□□□□□ -0.06
PDE4D-201ENST00000309641 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4D-201ENST00000309641 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PDE4D-201ENST00000309641 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4D-201ENST00000309641 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PDE4D-201ENST00000309641 FMN1Q68DA7 1419 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PDE4D-201ENST00000309641 ATP10BO94823 1461 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4D-201ENST00000309641 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4D-201ENST00000309641 MAPKBP1O60336 1514 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 ASXL2Q76L83 1435 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.53□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.53□□□□□ -0.08
PDE4D-201ENST00000309641 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 HECW1Q76N89 1606 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 KCNH8Q96L42 1107 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 DIP2BQ9P265 1576 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4D-201ENST00000309641 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.45□□□□□ -0.1
PDE4D-201ENST00000309641 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.43□□□□□ -0.1
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.42□□□□□ -0.1
PDE4D-201ENST00000309641 GLI2P10070 1586 aa14.4□□□□□ -0.1
PDE4D-201ENST00000309641 TSPOAP1O95153 1857 aa14.39□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 KIF14Q15058 1648 aa14.38□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.38□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 CD109Q6YHK3 1445 aa14.36□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.36□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 TIAM1Q13009 1591 aa14.35□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.35□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.34□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.34□□□□□ -0.11
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.3□□□□□ -0.12
PDE4D-201ENST00000309641 MAP3K1Q13233 1512 aa14.29□□□□□ -0.12
PDE4D-201ENST00000309641 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.29□□□□□ -0.12
PDE4D-201ENST00000309641 APLP2Q06481 763 aa14.28□□□□□ -0.12
PDE4D-201ENST00000309641 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 PLCH2O75038 1416 aa14.26□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.25□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 NCOA2Q15596 1464 aa14.24□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.24□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 FANCAO15360 1455 aa14.24□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.24□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.23□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.22□□□□□ -0.13
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms