RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309027.4

GOLIM4-201, Transcript of golgi integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GOLIM4, Length 2,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4-201ENST00000309027 KIF21BO75037 1637 aa25.73■■□□□ 1.71
GOLIM4-201ENST00000309027 ARHGEF11O15085 1522 aa25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4-201ENST00000309027 SHROOM2Q13796 1616 aa25.68■■□□□ 1.7
GOLIM4-201ENST00000309027 GOLGA3Q08378 1498 aa25.64■■□□□ 1.7
GOLIM4-201ENST00000309027 IQGAP2Q13576 1575 aa25.64■■□□□ 1.7
GOLIM4-201ENST00000309027 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
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GOLIM4-201ENST00000309027 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.61■■□□□ 1.69
GOLIM4-201ENST00000309027 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.61■■□□□ 1.69
GOLIM4-201ENST00000309027 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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GOLIM4-201ENST00000309027 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.54■■□□□ 1.68
GOLIM4-201ENST00000309027 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.53■■□□□ 1.68
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GOLIM4-201ENST00000309027 DISP1Q96F81 1524 aa25.47■■□□□ 1.67
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GOLIM4-201ENST00000309027 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.36■■□□□ 1.65
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GOLIM4-201ENST00000309027 P3H3Q8IVL6 736 aa25.31■■□□□ 1.64
GOLIM4-201ENST00000309027 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.31■■□□□ 1.64
GOLIM4-201ENST00000309027 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
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GOLIM4-201ENST00000309027 UACAQ9BZF9 1416 aa25.22■■□□□ 1.63
GOLIM4-201ENST00000309027 CLIP1P30622 1438 aa25.19■■□□□ 1.62
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GOLIM4-201ENST00000309027 FMN1Q68DA7 1419 aa25.11■■□□□ 1.61
GOLIM4-201ENST00000309027 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.04■■□□□ 1.6
GOLIM4-201ENST00000309027 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.02■■□□□ 1.6
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GOLIM4-201ENST00000309027 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.94■■□□□ 1.58
GOLIM4-201ENST00000309027 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
GOLIM4-201ENST00000309027 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4-201ENST00000309027 ARID3CA6NKF2 412 aa24.91■■□□□ 1.58
GOLIM4-201ENST00000309027 ASXL2Q76L83 1435 aa24.9■■□□□ 1.58
GOLIM4-201ENST00000309027 HECW1Q76N89 1606 aa24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4-201ENST00000309027 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4-201ENST00000309027 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GOLIM4-201ENST00000309027 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.87■■□□□ 1.57
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GOLIM4-201ENST00000309027 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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GOLIM4-201ENST00000309027 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4-201ENST00000309027 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4-201ENST00000309027 KCNH8Q96L42 1107 aa24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4-201ENST00000309027 DIP2BQ9P265 1576 aa24.74■■□□□ 1.55
GOLIM4-201ENST00000309027 GLI2P10070 1586 aa24.71■■□□□ 1.55
GOLIM4-201ENST00000309027 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.68■■□□□ 1.54
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GOLIM4-201ENST00000309027 MAP3K1Q13233 1512 aa24.61■■□□□ 1.53
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GOLIM4-201ENST00000309027 APLP2Q06481 763 aa24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4-201ENST00000309027 CD109Q6YHK3 1445 aa24.58■■□□□ 1.53
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GOLIM4-201ENST00000309027 TIAM1Q13009 1591 aa24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4-201ENST00000309027 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4-201ENST00000309027 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.56■■□□□ 1.52
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GOLIM4-201ENST00000309027 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.5■■□□□ 1.51
GOLIM4-201ENST00000309027 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GOLIM4-201ENST00000309027 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.48■■□□□ 1.51
GOLIM4-201ENST00000309027 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.46■■□□□ 1.51
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GOLIM4-201ENST00000309027 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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GOLIM4-201ENST00000309027 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.38■■□□□ 1.49
GOLIM4-201ENST00000309027 NCOA2Q15596 1464 aa24.38■■□□□ 1.49
GOLIM4-201ENST00000309027 NEO1Q92859 1461 aa24.38■■□□□ 1.49
GOLIM4-201ENST00000309027 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GOLIM4-201ENST00000309027 FANCAO15360 1455 aa24.36■■□□□ 1.49
GOLIM4-201ENST00000309027 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GOLIM4-201ENST00000309027 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.33■■□□□ 1.49
GOLIM4-201ENST00000309027 AKNAQ7Z591 1439 aa24.32■■□□□ 1.48
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