RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305476.9

SEMA4C-201, Transcript of semaphorin 4C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4C, Length 3,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4C-201ENST00000305476 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.2■■□□□ 1.3
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SEMA4C-201ENST00000305476 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.96■■□□□ 1.27
SEMA4C-201ENST00000305476 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.95■■□□□ 1.26
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SEMA4C-201ENST00000305476 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.72■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 PRDM2Q13029 1718 aa22.71■■□□□ 1.23
SEMA4C-201ENST00000305476 GRIN2BQ13224 1484 aa22.71■■□□□ 1.23
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SEMA4C-201ENST00000305476 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.68■■□□□ 1.22
SEMA4C-201ENST00000305476 TONSLQ96HA7 1378 aa22.67■■□□□ 1.22
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SEMA4C-201ENST00000305476 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.61■■□□□ 1.21
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SEMA4C-201ENST00000305476 PTPRKQ15262 1439 aa22.49■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.48■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 TSPY4P0CV99 314 aa22.48■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 TSPY10P0CW01 314 aa22.48■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.47■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.47■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SEMA4C-201ENST00000305476 IQGAP2Q13576 1575 aa22.45■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.45■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 GRIN2AQ12879 1464 aa22.42■■□□□ 1.18
SEMA4C-201ENST00000305476 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.42■■□□□ 1.18
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SEMA4C-201ENST00000305476 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.38■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.37■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 ANP32CO43423 234 aa22.37■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 PTPRGP23470 1445 aa22.36■■□□□ 1.17
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SEMA4C-201ENST00000305476 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.36■■□□□ 1.17
SEMA4C-201ENST00000305476 MAP3K1Q13233 1512 aa22.34■■□□□ 1.17
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SEMA4C-201ENST00000305476 BCANQ96GW7 911 aa22.32■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 ADAMTS12P58397 1594 aa22.31■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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SEMA4C-201ENST00000305476 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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SEMA4C-201ENST00000305476 SYNJ2O15056 1496 aa22.29■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 WDR62O43379 1518 aa22.28■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SEMA4C-201ENST00000305476 PBRM1Q86U86 1689 aa22.27■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 MAPKBP1O60336 1514 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 WDR97A6NE52 1622 aa22.25■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.155e-6■■□□□ 11.4
SEMA4C-201ENST00000305476 DISP1Q96F81 1524 aa22.23■■□□□ 1.15
SEMA4C-201ENST00000305476 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.22■■□□□ 1.15
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